125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2258 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  59.73 
 
 		 668 aa  747    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  58.57 
 
 		 678 aa  732    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  66.61 
 
 		 682 aa  860    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  73.11 
 
 		 664 aa  965    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  58.71 
 
 		 654 aa  736    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  60.68 
 
 		 674 aa  717    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  59.4 
 
 		 685 aa  755    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  73.11 
 
 		 664 aa  965    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  72.51 
 
 		 664 aa  972    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  73.26 
 
 		 664 aa  965    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  72.66 
 
 		 664 aa  958    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1487  hypothetical protein  64.88 
 
 		 696 aa  813    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479036  normal  0.671369 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  71.43 
 
 		 657 aa  918    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1563  putative transporter  62.07 
 
 		 677 aa  723    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.694586 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  57.31 
 
 		 677 aa  736    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  63.38 
 
 		 667 aa  767    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  56.98 
 
 		 731 aa  741    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  65.99 
 
 		 691 aa  795    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  59.43 
 
 		 681 aa  734    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  63.61 
 
 		 672 aa  807    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  62.59 
 
 		 683 aa  815    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  100 
 
 		 672 aa  1352    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  63.47 
 
 		 704 aa  794    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1916  hypothetical protein  59.49 
 
 		 667 aa  712    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635201  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  58.55 
 
 		 658 aa  731    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  62.9 
 
 		 678 aa  733    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  64.9 
 
 		 655 aa  838    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  71.49 
 
 		 674 aa  917    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  60.03 
 
 		 781 aa  759    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  43.31 
 
 		 614 aa  477  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  43.94 
 
 		 614 aa  475  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000427762  unclonable  0.0000151298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  42.66 
 
 		 615 aa  445  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  39.08 
 
 		 627 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000300657  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  38.05 
 
 		 693 aa  414  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  39.43 
 
 		 611 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  40.82 
 
 		 672 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  39.66 
 
 		 611 aa  399  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  36.91 
 
 		 609 aa  397  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  36.6 
 
 		 609 aa  392  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  36.6 
 
 		 609 aa  392  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  37.17 
 
 		 629 aa  386  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  35.38 
 
 		 629 aa  385  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  38.97 
 
 		 612 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  37.93 
 
 		 608 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  37.93 
 
 		 608 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  35.78 
 
 		 627 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  36.35 
 
 		 608 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  38.12 
 
 		 585 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  37.93 
 
 		 608 aa  360  4e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  37.93 
 
 		 608 aa  359  8e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  37.93 
 
 		 608 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  37.62 
 
 		 608 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  37.62 
 
 		 608 aa  355  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000121839  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  37.27 
 
 		 653 aa  352  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  36.31 
 
 		 608 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  35.68 
 
 		 612 aa  347  6e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  34.16 
 
 		 615 aa  344  4e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  35.96 
 
 		 636 aa  343  8e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  36.97 
 
 		 750 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  35.38 
 
 		 614 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  37.75 
 
 		 614 aa  329  1.0000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  34.48 
 
 		 774 aa  308  3e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  39.9 
 
 		 650 aa  305  1.0000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  35.22 
 
 		 615 aa  302  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  35.21 
 
 		 647 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  34.78 
 
 		 622 aa  295  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000285538  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.74 
 
 		 815 aa  293  9e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.38 
 
 		 777 aa  267  4e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  34.08 
 
 		 619 aa  258  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  41.42 
 
 		 365 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  32.78 
 
 		 713 aa  220  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  32.78 
 
 		 713 aa  220  6e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  39.5 
 
 		 470 aa  219  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  29.34 
 
 		 657 aa  194  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  28.34 
 
 		 656 aa  185  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  28.53 
 
 		 685 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  28.68 
 
 		 657 aa  177  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  28.75 
 
 		 680 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  27.65 
 
 		 680 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0024  lysine-specific permease  26.37 
 
 		 647 aa  150  6e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1995  hypothetical protein  26.37 
 
 		 647 aa  150  6e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1725  amino acid permease, central region  40.8 
 
 		 253 aa  127  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1726  amino acid permease, C-terminal  34.64 
 
 		 272 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0922786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1038  amino acid permease-associated region  34.12 
 
 		 657 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1041  amino acid permease-associated region  33.53 
 
 		 657 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0979  amino acid permease-associated region  32.07 
 
 		 655 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.696975  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1724  amino acid permease, N-terminal  42.7 
 
 		 101 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1748  hypothetical protein  27.94 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0151353  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0920  Amino acid transporter-like  22.95 
 
 		 619 aa  63.5  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000519212  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2908  UspA domain protein  24.84 
 
 		 636 aa  61.6  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.1088  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1345  amino acid permease-associated region  21.79 
 
 		 521 aa  55.1  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1104  amino acid transporter  23.62 
 
 		 676 aa  51.6  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  22.82 
 
 		 467 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  22.82 
 
 		 467 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  22.82 
 
 		 467 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  31.37 
 
 		 455 aa  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1828  hypothetical protein  25.87 
 
 		 650 aa  48.5  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  36 
 
 		 463 aa  48.5  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  35.16 
 
 		 463 aa  48.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  27.52 
 
 		 462 aa  47.8  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>