93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12705 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  71.58 
 
 
672 aa  937    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  62.52 
 
 
678 aa  733    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1487  hypothetical protein  65.01 
 
 
696 aa  802    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479036  normal  0.671369 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  76.71 
 
 
664 aa  995    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  60.73 
 
 
781 aa  738    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  78.08 
 
 
664 aa  1040    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  59.04 
 
 
678 aa  716    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  77.32 
 
 
664 aa  1022    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  56.4 
 
 
658 aa  719    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  77.78 
 
 
664 aa  1039    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  60.87 
 
 
685 aa  753    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  61 
 
 
674 aa  719    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  68.12 
 
 
682 aa  868    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  57.14 
 
 
654 aa  720    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  100 
 
 
657 aa  1315    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  62.82 
 
 
683 aa  808    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  62.27 
 
 
672 aa  774    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  77.78 
 
 
664 aa  1039    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  62.73 
 
 
668 aa  743    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  65.26 
 
 
691 aa  785    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1563  putative transporter  60.73 
 
 
677 aa  682    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.694586 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1916  hypothetical protein  59.48 
 
 
667 aa  704    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  62.59 
 
 
704 aa  786    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  57.5 
 
 
677 aa  687    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  63.61 
 
 
655 aa  811    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  63.85 
 
 
667 aa  754    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  60.58 
 
 
681 aa  754    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  71.3 
 
 
674 aa  891    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  58.22 
 
 
731 aa  738    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  44.65 
 
 
614 aa  473  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  44.3 
 
 
614 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000427762  unclonable  0.0000151298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  43.57 
 
 
615 aa  442  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  39.57 
 
 
627 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000300657  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  40.75 
 
 
611 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  39.15 
 
 
693 aa  403  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  41.39 
 
 
672 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  39.12 
 
 
611 aa  391  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  36.75 
 
 
609 aa  389  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  35.33 
 
 
609 aa  378  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  35.33 
 
 
609 aa  378  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  37.87 
 
 
612 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  36.95 
 
 
608 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  36.95 
 
 
608 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  35.61 
 
 
608 aa  365  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  34.48 
 
 
629 aa  362  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  39.27 
 
 
585 aa  360  6e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  33.7 
 
 
629 aa  360  6e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  34.47 
 
 
627 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  38.34 
 
 
750 aa  355  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  36.98 
 
 
653 aa  353  4e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  36.48 
 
 
608 aa  347  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  36.32 
 
 
608 aa  343  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  36.32 
 
 
608 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  36.16 
 
 
608 aa  343  8e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000121839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  36.32 
 
 
608 aa  342  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  34.75 
 
 
608 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  34.98 
 
 
614 aa  340  5.9999999999999996e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  36.31 
 
 
612 aa  333  5e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  34.42 
 
 
636 aa  326  7e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  33.8 
 
 
615 aa  323  7e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  34.74 
 
 
774 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  36.53 
 
 
614 aa  311  2e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  34.56 
 
 
615 aa  307  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  37.68 
 
 
650 aa  300  7e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.93 
 
 
815 aa  293  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  34.37 
 
 
622 aa  290  4e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000285538  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  35.67 
 
 
777 aa  288  2e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  34 
 
 
647 aa  280  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  32.7 
 
 
619 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  39.02 
 
 
365 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  38.25 
 
 
470 aa  208  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  30.43 
 
 
713 aa  189  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  30.43 
 
 
713 aa  189  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  28.55 
 
 
685 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  27.41 
 
 
657 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  27.25 
 
 
656 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 
657 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0024  lysine-specific permease  26.72 
 
 
647 aa  154  4e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1995  hypothetical protein  26.72 
 
 
647 aa  154  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  27.05 
 
 
680 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  27.16 
 
 
680 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1726  amino acid permease, C-terminal  33.81 
 
 
272 aa  120  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0922786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1725  amino acid permease, central region  35.87 
 
 
253 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759722  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1038  amino acid permease-associated region  30.62 
 
 
657 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1041  amino acid permease-associated region  31.44 
 
 
657 aa  94.4  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0979  amino acid permease-associated region  29.32 
 
 
655 aa  84.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.696975  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1748  hypothetical protein  28.57 
 
 
218 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0151353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1724  amino acid permease, N-terminal  41.11 
 
 
101 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0920  Amino acid transporter-like  28.89 
 
 
619 aa  51.2  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000519212  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3899  hypothetical protein  28.98 
 
 
448 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.823757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3973  hypothetical protein  28.98 
 
 
448 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.460443  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1345  amino acid permease-associated region  23.28 
 
 
521 aa  46.6  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295081  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3914  hypothetical protein  28.06 
 
 
448 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>