126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1404 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  56.44 
 
 		 704 aa  722    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  57.45 
 
 		 681 aa  696    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  58.32 
 
 		 668 aa  720    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  59.51 
 
 		 664 aa  758    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  71.75 
 
 		 672 aa  958    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1916  hypothetical protein  68.63 
 
 		 667 aa  853    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635201  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  61.67 
 
 		 654 aa  818    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  60 
 
 		 674 aa  724    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  58.51 
 
 		 685 aa  743    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  59.51 
 
 		 664 aa  758    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  59.26 
 
 		 664 aa  749    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  59.66 
 
 		 664 aa  758    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  58.96 
 
 		 664 aa  728    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1487  hypothetical protein  58.88 
 
 		 696 aa  723    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479036  normal  0.671369 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  58.52 
 
 		 657 aa  736    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1563  putative transporter  63.09 
 
 		 677 aa  725    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.694586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  58.96 
 
 		 683 aa  760    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  55.12 
 
 		 731 aa  684    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  60.34 
 
 		 691 aa  712    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  58.57 
 
 		 672 aa  763    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  100 
 
 		 678 aa  1349    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  55.9 
 
 		 677 aa  686    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  56.35 
 
 		 655 aa  711    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  70.92 
 
 		 667 aa  882    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  60.49 
 
 		 658 aa  798    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  67.85 
 
 		 678 aa  827    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  58.37 
 
 		 682 aa  744    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  57.59 
 
 		 674 aa  707    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  54.42 
 
 		 781 aa  696    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  41.9 
 
 		 614 aa  462  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  41.43 
 
 		 614 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000427762  unclonable  0.0000151298 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  38.07 
 
 		 693 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  38.86 
 
 		 627 aa  413  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000300657  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  39.97 
 
 		 615 aa  415  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  38.95 
 
 		 672 aa  398  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  38.29 
 
 		 611 aa  393  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  38.79 
 
 		 611 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  37.42 
 
 		 608 aa  378  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  37.73 
 
 		 608 aa  378  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  37.11 
 
 		 609 aa  375  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  36.02 
 
 		 609 aa  375  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  36.02 
 
 		 609 aa  375  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  36.36 
 
 		 608 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  35.05 
 
 		 627 aa  375  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  33.33 
 
 		 629 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  34.31 
 
 		 629 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  38.04 
 
 		 608 aa  360  4e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  36.59 
 
 		 612 aa  359  9e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  39.01 
 
 		 585 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  37.33 
 
 		 608 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  38.04 
 
 		 608 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  36.03 
 
 		 636 aa  356  7.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  38.2 
 
 		 608 aa  356  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  37.73 
 
 		 608 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  37.1 
 
 		 750 aa  353  8e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  37.73 
 
 		 608 aa  350  5e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000121839  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  34.46 
 
 		 614 aa  342  1e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  33.94 
 
 		 615 aa  327  5e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  38.86 
 
 		 650 aa  323  6e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  36.53 
 
 		 614 aa  315  1.9999999999999998e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  34.11 
 
 		 612 aa  314  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  34.4 
 
 		 653 aa  306  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  36.16 
 
 		 615 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  34.41 
 
 		 622 aa  298  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000285538  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  33.59 
 
 		 647 aa  295  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  32.83 
 
 		 774 aa  289  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.46 
 
 		 815 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.58 
 
 		 777 aa  261  3e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  41.55 
 
 		 365 aa  251  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  32.9 
 
 		 619 aa  236  9e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  37.55 
 
 		 470 aa  204  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  29.89 
 
 		 713 aa  187  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  29.89 
 
 		 713 aa  187  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  28.83 
 
 		 657 aa  175  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  26.16 
 
 		 656 aa  167  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  27.56 
 
 		 657 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  27.06 
 
 		 680 aa  153  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  27.84 
 
 		 685 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  25.29 
 
 		 680 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0024  lysine-specific permease  24.26 
 
 		 647 aa  133  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1995  hypothetical protein  24.26 
 
 		 647 aa  133  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1725  amino acid permease, central region  38.96 
 
 		 253 aa  127  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1726  amino acid permease, C-terminal  34.29 
 
 		 272 aa  124  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0922786  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1038  amino acid permease-associated region  32.07 
 
 		 657 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1041  amino acid permease-associated region  31.57 
 
 		 657 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0979  amino acid permease-associated region  30.59 
 
 		 655 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.696975  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1748  hypothetical protein  27.45 
 
 		 218 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0151353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1724  amino acid permease, N-terminal  43.68 
 
 		 101 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  23.63 
 
 		 443 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0162  amino acid transporter  27.02 
 
 		 755 aa  56.6  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  25.43 
 
 		 455 aa  55.5  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2156  amino acid transporters  26.02 
 
 		 746 aa  54.3  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.739886  normal  0.876305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1104  amino acid transporter  24.21 
 
 		 676 aa  53.5  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  25.7 
 
 		 462 aa  52.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3914  hypothetical protein  33.02 
 
 		 448 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3899  hypothetical protein  37.5 
 
 		 448 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.823757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3973  hypothetical protein  37.5 
 
 		 448 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.460443  normal  0.984313 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>