79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2156 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2156  amino acid transporters  100 
 
 		 746 aa  1528    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.739886  normal  0.876305 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0162  amino acid transporter  71.89 
 
 		 755 aa  1110    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1104  amino acid transporter  40.72 
 
 		 676 aa  470  1.0000000000000001e-131  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  26.54 
 
 		 455 aa  86.3  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0920  Amino acid transporter-like  24.07 
 
 		 619 aa  73.9  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000519212  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2796  amino acid permease-associated region  26.59 
 
 		 580 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  26.3 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  25.17 
 
 		 636 aa  62.4  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  23.06 
 
 		 609 aa  62.4  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  23.43 
 
 		 609 aa  61.6  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  23.43 
 
 		 609 aa  61.6  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  25.83 
 
 		 629 aa  60.8  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  27.22 
 
 		 585 aa  60.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  25.83 
 
 		 654 aa  58.5  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1345  amino acid permease-associated region  21.64 
 
 		 521 aa  58.2  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2910  UspA domain protein  22.74 
 
 		 649 aa  58.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12405  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  26.78 
 
 		 608 aa  57.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  23.82 
 
 		 792 aa  57.4  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  21.75 
 
 		 815 aa  57.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  25.71 
 
 		 668 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  24.42 
 
 		 658 aa  56.6  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0055  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 		 428 aa  55.8  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.195903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  22.34 
 
 		 501 aa  55.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  24.66 
 
 		 466 aa  54.7  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3641  amino acid permease-associated region  27.57 
 
 		 513 aa  54.3  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  26.4 
 
 		 608 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  25.28 
 
 		 681 aa  54.3  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  26.4 
 
 		 608 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2908  UspA domain protein  33.88 
 
 		 636 aa  53.9  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.1088  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  22.82 
 
 		 615 aa  53.9  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  26.94 
 
 		 501 aa  52.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  24.36 
 
 		 627 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000300657  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  24.54 
 
 		 615 aa  52.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  36.7 
 
 		 495 aa  51.2  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  26.57 
 
 		 481 aa  50.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  27.62 
 
 		 615 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  23.15 
 
 		 612 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  26.99 
 
 		 693 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  23.85 
 
 		 745 aa  49.3  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 473 aa  49.3  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  25.74 
 
 		 672 aa  48.9  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  31.31 
 
 		 504 aa  49.3  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  25.9 
 
 		 678 aa  48.5  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  23.98 
 
 		 614 aa  48.9  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  24.23 
 
 		 627 aa  48.9  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  24.15 
 
 		 774 aa  48.5  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  26.65 
 
 		 731 aa  48.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  26.72 
 
 		 674 aa  48.5  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  21.37 
 
 		 480 aa  48.1  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 		 506 aa  48.1  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3885  amino acid permease-associated region  21.77 
 
 		 487 aa  47.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  24.54 
 
 		 682 aa  47.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  26.97 
 
 		 672 aa  47  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  23.39 
 
 		 438 aa  47.4  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3063  amino acid permease-associated region  24.67 
 
 		 468 aa  47  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.313511  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  20.95 
 
 		 614 aa  47.4  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  23.68 
 
 		 518 aa  47.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0608  amino acid permease-associated region  23.76 
 
 		 444 aa  47  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  25.17 
 
 		 608 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6322  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 503 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.393049  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  25.4 
 
 		 677 aa  45.8  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  33.02 
 
 		 489 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  24.26 
 
 		 629 aa  45.8  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  26.72 
 
 		 468 aa  45.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 468 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3706  hypothetical protein  22.6 
 
 		 483 aa  45.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  normal  0.130124 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 468 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  25.84 
 
 		 685 aa  45.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1784  amino acid permease-associated region  33.64 
 
 		 475 aa  45.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  26.96 
 
 		 664 aa  45.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  25.06 
 
 		 468 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  23.22 
 
 		 491 aa  45.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  22.05 
 
 		 481 aa  45.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3674  amino acid permease-associated region  21.77 
 
 		 487 aa  44.7  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  22.45 
 
 		 517 aa  44.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  23.68 
 
 		 680 aa  44.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 476 aa  44.3  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  23.54 
 
 		 468 aa  44.3  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  25.63 
 
 		 460 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>