57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1104 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1104  amino acid transporter  100 
 
 		 676 aa  1372    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0162  amino acid transporter  39.42 
 
 		 755 aa  479  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2156  amino acid transporters  40.72 
 
 		 746 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.739886  normal  0.876305 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  26.11 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1345  amino acid permease-associated region  25.98 
 
 		 521 aa  73.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2796  amino acid permease-associated region  24.02 
 
 		 580 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0920  Amino acid transporter-like  25.64 
 
 		 619 aa  63.2  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000519212  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  25.35 
 
 		 612 aa  62.4  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0055  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.195903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2910  UspA domain protein  30.37 
 
 		 649 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12405  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  24.92 
 
 		 627 aa  57.4  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  23.95 
 
 		 745 aa  57.4  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  23.59 
 
 		 792 aa  55.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  21.49 
 
 		 774 aa  55.5  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2908  UspA domain protein  27.47 
 
 		 636 aa  55.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.1088  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  26.92 
 
 		 585 aa  54.7  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  23.63 
 
 		 609 aa  53.9  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  25.25 
 
 		 608 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  26.89 
 
 		 693 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 		 473 aa  52.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 		 664 aa  51.2  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  24.31 
 
 		 678 aa  50.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  21.85 
 
 		 615 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 		 664 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  22.46 
 
 		 615 aa  50.4  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  25.54 
 
 		 664 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 653 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  24.05 
 
 		 672 aa  49.7  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2460  amino acid permease-associated region  24.07 
 
 		 468 aa  48.9  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.708189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  22.38 
 
 		 449 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  24.79 
 
 		 615 aa  48.9  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  21.9 
 
 		 657 aa  48.5  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  23.72 
 
 		 608 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  23.94 
 
 		 608 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  25.77 
 
 		 488 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1531  amino acid permease-associated region  25.82 
 
 		 479 aa  47.8  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  28.72 
 
 		 495 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  30.11 
 
 		 481 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  25.19 
 
 		 636 aa  46.2  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  25.4 
 
 		 681 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  24.93 
 
 		 658 aa  46.2  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  21.45 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  25.07 
 
 		 654 aa  46.2  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  22.8 
 
 		 764 aa  45.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  30.58 
 
 		 491 aa  45.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  25.92 
 
 		 672 aa  45.8  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  24.1 
 
 		 629 aa  45.4  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0779  amino acid permease-associated region  24.64 
 
 		 427 aa  44.7  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.047573  normal  0.0991739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  23.68 
 
 		 677 aa  44.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  24.62 
 
 		 609 aa  45.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  24.62 
 
 		 609 aa  45.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0820  amino acid permease-associated region  23.63 
 
 		 480 aa  44.7  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  21.61 
 
 		 657 aa  44.7  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  22.82 
 
 		 629 aa  44.7  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0810  amino acid transporter  23.63 
 
 		 480 aa  44.7  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286981  normal  0.0705 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  28.71 
 
 		 650 aa  43.9  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 501 aa  43.9  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>