More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1159 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1159  BCCT transporter  100 
 
 		 602 aa  1217    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2119  betaine/carnitine/choline transporter family protein  38.66 
 
 		 524 aa  288  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1851  choline/carnitine/betaine transporter  34.27 
 
 		 543 aa  272  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.993809  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0309  choline/carnitine/betaine transporter  33.2 
 
 		 552 aa  270  5e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.670789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2029  choline/carnitine/betaine transporter  30.99 
 
 		 558 aa  269  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0600  choline/carnitine/betaine transporter  33.06 
 
 		 584 aa  259  7e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000857259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  31.22 
 
 		 567 aa  257  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  33.39 
 
 		 531 aa  257  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  30.62 
 
 		 657 aa  257  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1003  choline/carnitine/betaine transporter  31.48 
 
 		 553 aa  255  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  32.19 
 
 		 661 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  31.2 
 
 		 530 aa  254  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2792  choline/carnitine/betaine transporter  30.64 
 
 		 711 aa  253  5.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  32.6 
 
 		 661 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  28.11 
 
 		 546 aa  253  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  35.18 
 
 		 524 aa  249  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0023  choline/carnitine/betaine transporter  31.51 
 
 		 539 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.16107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  30.59 
 
 		 583 aa  248  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  31.59 
 
 		 526 aa  248  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  29.37 
 
 		 530 aa  247  6e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  27.48 
 
 		 551 aa  246  6e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  31.49 
 
 		 532 aa  246  8e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  29.42 
 
 		 548 aa  246  8e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  29.42 
 
 		 548 aa  246  8e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0898  BCCT family transporter  31.19 
 
 		 540 aa  246  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  32.2 
 
 		 516 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  32.16 
 
 		 541 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5374  choline/carnitine/betaine transporter family protein  31.07 
 
 		 567 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985383  normal  0.22306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  31.57 
 
 		 606 aa  244  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  29.32 
 
 		 573 aa  244  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  33.46 
 
 		 573 aa  243  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  31.49 
 
 		 580 aa  243  7.999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  29.18 
 
 		 582 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  28.75 
 
 		 582 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  28.75 
 
 		 582 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  30.9 
 
 		 505 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  30.33 
 
 		 505 aa  240  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  30.33 
 
 		 505 aa  240  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  30.33 
 
 		 505 aa  240  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  32.97 
 
 		 659 aa  240  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  30.08 
 
 		 505 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  31.76 
 
 		 506 aa  240  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  29.98 
 
 		 504 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04148  secondary glycine betaine transporter BetU  30.12 
 
 		 667 aa  240  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04111  hypothetical protein  30.12 
 
 		 667 aa  240  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  33.08 
 
 		 583 aa  240  6.999999999999999e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  30.33 
 
 		 505 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  30.33 
 
 		 505 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  33.26 
 
 		 659 aa  239  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  30.19 
 
 		 610 aa  239  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4850  BCCT family transporter  29.92 
 
 		 667 aa  239  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0764  transporter, BCCT family  29.51 
 
 		 667 aa  238  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.846408  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  30.33 
 
 		 505 aa  238  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  30.04 
 
 		 545 aa  237  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  31.72 
 
 		 516 aa  237  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2045  choline/carnitine/betaine transporter  31.12 
 
 		 554 aa  237  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0189191  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  30.36 
 
 		 667 aa  236  8e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1805  choline/carnitine/betaine transporter  30.22 
 
 		 664 aa  236  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.376035  hitchhiker  0.00814736 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  29.87 
 
 		 550 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  32.32 
 
 		 531 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  31.72 
 
 		 516 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  31.72 
 
 		 516 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  31.72 
 
 		 516 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  31.72 
 
 		 516 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  30.12 
 
 		 504 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  31.72 
 
 		 516 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  31.31 
 
 		 494 aa  234  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2003  choline/carnitine/betaine transport family protein  31.94 
 
 		 535 aa  234  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  32.83 
 
 		 660 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4336  choline/carnitine/betaine transporter  30.74 
 
 		 529 aa  233  6e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  29.92 
 
 		 504 aa  233  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  31.37 
 
 		 682 aa  233  6e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  29.21 
 
 		 573 aa  233  7.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  33.84 
 
 		 668 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  31.3 
 
 		 516 aa  233  9e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00590  choline/carnitine/betaine transport  31.22 
 
 		 592 aa  233  9e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0767816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001291  choline/carnitine/betaine transporter family protein  30.74 
 
 		 578 aa  233  9e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.335478  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  31.3 
 
 		 516 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  28.51 
 
 		 490 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  28.42 
 
 		 538 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0049  choline/carnitine/betaine transporter  30.77 
 
 		 523 aa  232  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.335489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1282  transporter, BCCT family  31.78 
 
 		 534 aa  232  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2125  choline/carnitine/betaine transport  31.78 
 
 		 549 aa  231  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  31.09 
 
 		 516 aa  230  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  32.19 
 
 		 534 aa  229  8e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  30.85 
 
 		 577 aa  229  9e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  29.62 
 
 		 637 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2261  choline/carnitine/betaine transporter  29.76 
 
 		 671 aa  228  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0098  transporter, BCCT family  30.66 
 
 		 526 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  32.97 
 
 		 520 aa  228  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01883  choline/carnitine/betaine transporter  31.14 
 
 		 529 aa  228  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1337  choline/carnitine/betaine transport  30.3 
 
 		 687 aa  228  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1542  choline/carnitine/betaine transporter  32.06 
 
 		 658 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.869304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2804  choline/carnitine/betaine transporter  32.06 
 
 		 658 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  32.97 
 
 		 520 aa  228  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  29.85 
 
 		 685 aa  228  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1576  choline/carnitine/betaine transporter  32.06 
 
 		 658 aa  228  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1809  choline/carnitine/betaine transporter  32.16 
 
 		 526 aa  227  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1441  choline/carnitine/betaine transporter  31.71 
 
 		 658 aa  227  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  29.55 
 
 		 682 aa  227  6e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>