More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0087 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0087  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 304 aa  624  1e-178  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0147  LysR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 296 aa  93.6  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3128  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 309 aa  92.4  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4731  LysR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4789  transcriptional regulator, LysR family  34.66 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0963  LysR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0216  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1693  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3176  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19670  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.663565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1450  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4525  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0345  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1664  LysR substrate-binding protein  33.33 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1385  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134108  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0644  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0772357  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2479  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4032  LysR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660064  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0092  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0215492  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2118  LysR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3097  transcriptional regulator, LysR family  23.42 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3126  LysR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8824  transcriptional regulator, LysR family  24.64 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2000  transcriptional regulator, LysR family  31.9 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40236  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0898  transcriptional regulator, LysR family  24.28 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0236  LysR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0835  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1896  LysR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4124  transcriptional regulator, LysR family  29.28 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0390  transcriptional regulator, LysR family  33.17 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4958  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.468232 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4438  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0898  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2204  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1281  transcriptional regulator, LysR family  30.14 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20663  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1309  LysR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0868  fhu operon transcriptional regulator  33.33 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3818  LysR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.173651 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  29.77 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0889  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2025  LysR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.639957  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0551  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.863373 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0886  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0376917  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2231  LysR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.392595  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18090  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4627  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6028  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4487  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4611  LysR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0937251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1855  transcriptional regulator, LysR family  26.4 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1907  transcriptional regulator  28.29 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0704  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.271413  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1243  transcriptional regulator, LysR family  25.81 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.0485343 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1937  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6676  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2176  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2993  LysR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.462363 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3118  transcriptional regulator, LysR family  27.37 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0720  LysR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0880  LysR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0841  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.697299  normal  0.209982 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  28.49 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1823  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0382  transcriptional regulator, LysR family  25.8 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3338  LysR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714315  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2608  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2980  LysR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5029  LysR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.534863  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4836  LysR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1974  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1827  LysR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.140863  hitchhiker  0.00393629 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2584  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0798399  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1388  LysR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  22.78 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0691  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.780494  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2070  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 328 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518674  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5022  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.851594  normal  0.174295 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  32.09 
 
 		 343 aa  72.4  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5255  LysR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27230  transcriptional regulator  26.23 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0269  LysR substrate-binding  26.84 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670723  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2486  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  27.5 
 
 		 293 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2159  LysR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 303 aa  72.4  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2633  LysR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.787388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2503  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5915  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1250  transcriptional regulator, LysR family  29.91 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0513927 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26681  putative Rubisco transcriptional regulator  32.12 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2188  transcriptional regulator, LysR family  30.27 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4630  LysR family transcriptional regulator  25.72 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0713  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.411699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>