More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1465 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1465  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 223 aa  434  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3285  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.64 
 
 		 224 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00225391  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1953  two component transcriptional regulator  63.89 
 
 		 226 aa  241  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1754  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.89 
 
 		 226 aa  241  6e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1143  two component transcriptional regulator  60.63 
 
 		 224 aa  241  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.606905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0392  DNA-binding transcriptional regulator BasR  45.16 
 
 		 222 aa  190  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.421328  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 221 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  47.69 
 
 		 220 aa  187  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  47.69 
 
 		 220 aa  187  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  47.69 
 
 		 220 aa  187  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0310  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.7 
 
 		 232 aa  185  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0214332  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0124  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.73 
 
 		 220 aa  185  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.0356027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3094  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3836  DNA-binding transcriptional regulator BasR  45.62 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3088  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3815  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 219 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.681737  normal  0.25062 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4016  DNA-binding transcriptional regulator BasR  46.08 
 
 		 222 aa  181  9.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.727043  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4141  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.27 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1602  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389685 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3610  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  45.62 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2735  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  41.36 
 
 		 220 aa  175  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6029  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167629 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  44.24 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 221 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  42.52 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4961  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.675974  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3284  two component transcriptional regulator  44.5 
 
 		 219 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0910618 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  44.95 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.86 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  43.52 
 
 		 219 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4547  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.86 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4554  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.86 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4687  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.86 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.20519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.86 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  40.65 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  42.86 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 219 aa  168  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4876  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 221 aa  167  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.292661  normal  0.262349 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3879  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.4 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1075  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BasS  42.4 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4578  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.4 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.800667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4667  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.4 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03945  hypothetical protein  42.4 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  44.86 
 
 		 219 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3914  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.4 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.730701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5626  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.4 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1183  two component transcriptional regulator  45.62 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4353  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.4 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 219 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1244  DNA-binding response regulator  41.94 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.98 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00402  putative two component response regulator transcription regulator protein  44.39 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00497843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2076  OmpR family two-component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 224 aa  164  8e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000231542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 225 aa  164  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02658  hypothetical protein  42.4 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0559  DNA-binding response regulator  47.22 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1512  two component transcriptional regulator  39.45 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0003  response regulator receiver  43.24 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  40.37 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1561  two component transcriptional regulator  39.45 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1624  DNA-binding response regulator  47.22 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0176162  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0784  DNA-binding response regulator  47.22 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.42757  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0490  two component response regulator  47.22 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663456  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0671  DNA-binding response regulator  47.22 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.485657  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0471  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  43.06 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2074  DNA-binding response regulator  47.22 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.401565  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1977  DNA-binding response regulator  47.22 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0692  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 224 aa  161  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.44 
 
 		 218 aa  161  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0603  DNA-binding response regulator  38.74 
 
 		 229 aa  161  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2154  two component transcriptional regulator  44.91 
 
 		 218 aa  161  8.000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  44.09 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0604  DNA-binding response regulator  38.74 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3443  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0278745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5168  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.54 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2733  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00185097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  40.09 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1979  putative transcriptional regulator  41.47 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1433  two component transcriptional regulator  35.91 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>