More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2778 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2778  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
235 aa  467  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.33 
 
 
229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0250  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.36 
 
 
229 aa  161  7e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1651  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.44 
 
 
229 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.885252  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1115  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.63 
 
 
228 aa  156  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0333  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.94 
 
 
229 aa  152  4e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1499  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.85 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0856  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.1 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.79 
 
 
270 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.5 
 
 
273 aa  125  8.000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.86 
 
 
274 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2939  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.85 
 
 
269 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1551  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.92 
 
 
255 aa  123  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2818  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.16 
 
 
289 aa  122  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3039  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40 
 
 
267 aa  122  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0932911 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.5 
 
 
263 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.07 
 
 
271 aa  122  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1552  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.56 
 
 
264 aa  121  7e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1685  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.39 
 
 
250 aa  121  9e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.159562  normal  0.0633733 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20750  indole-3-glycerol phosphate synthase  36.41 
 
 
270 aa  120  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.600467  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1450  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.1 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1271  Indole-3-glycerol phosphate synthase  38.6 
 
 
269 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.8 
 
 
268 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.84 
 
 
262 aa  120  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2948  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.83 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.544839  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2875  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.71 
 
 
268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000186744  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.33 
 
 
275 aa  119  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.26 
 
 
262 aa  118  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1169  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.44 
 
 
261 aa  118  7e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.949378  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0940  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.04 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1986  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.55 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.32 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3027  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.61 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.26 
 
 
261 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0225  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.07 
 
 
251 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.71 
 
 
286 aa  115  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1156  indole-3-glycerol phosphate synthase  37.98 
 
 
260 aa  115  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3051  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.06 
 
 
272 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3067  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.06 
 
 
272 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.285409  normal  0.207369 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.12 
 
 
269 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.06 
 
 
272 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475678  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10960  indole-3-glycerol phosphate synthase  35.07 
 
 
268 aa  115  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0068358  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0909  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.79 
 
 
271 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000352387  hitchhiker  0.00000000301828 
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.1 
 
 
259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0074  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.93 
 
 
251 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  38.68 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0478  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.22 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  35.87 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3076  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.41 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000445652  hitchhiker  0.0000898073 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.92 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.38 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.49 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  33.92 
 
 
271 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1073  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.83 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110907  normal  0.803257 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  35.91 
 
 
259 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3175  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.12 
 
 
268 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504045  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2046  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.06 
 
 
272 aa  112  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.941423  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.79 
 
 
272 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1147  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.61 
 
 
253 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0344268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1460  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.19 
 
 
260 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1693  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.92 
 
 
260 aa  112  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1431  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.19 
 
 
260 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.85 
 
 
260 aa  112  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3621  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.08 
 
 
268 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2856  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.03 
 
 
264 aa  111  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.29 
 
 
282 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.271209 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0216  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41 
 
 
267 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.04 
 
 
267 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.64 
 
 
271 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.38 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2816  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.38 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.07226  normal  0.927217 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.22 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1838  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.62 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.24 
 
 
317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  33.02 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.74 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0914  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.4 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  33.63 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.86 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.86 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.35 
 
 
258 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0107  indole-3-glycerol phosphate synthase  37.83 
 
 
271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  33.49 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  32.89 
 
 
266 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1252  indole-3-glycerol phosphate synthase  37.61 
 
 
257 aa  108  6e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0535  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.78 
 
 
258 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2885  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.55 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  32.43 
 
 
268 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0468  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38 
 
 
258 aa  107  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  32.43 
 
 
268 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.71 
 
 
253 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.71 
 
 
253 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1133  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.27 
 
 
253 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.02 
 
 
295 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1319  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.71 
 
 
253 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000247169 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.71 
 
 
253 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.449092  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  33.33 
 
 
271 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.29 
 
 
256 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3097  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.33 
 
 
270 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.780725  normal  0.58213 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.87 
 
 
258 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>