More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0521 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0521  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 242 aa  496  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0970  Nucleotidyl transferase  51.65 
 
 		 244 aa  260  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.02 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  28.63 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.82 
 
 		 397 aa  106  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  29.05 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  28.81 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  29.22 
 
 		 257 aa  98.6  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.42 
 
 		 358 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  29.58 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  28.07 
 
 		 393 aa  96.3  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.7 
 
 		 393 aa  95.1  8e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.92 
 
 		 400 aa  95.1  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  30.17 
 
 		 439 aa  95.1  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.34 
 
 		 357 aa  94  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  29.82 
 
 		 405 aa  93.2  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29.51 
 
 		 400 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.22 
 
 		 353 aa  91.3  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  29.51 
 
 		 400 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  28.19 
 
 		 393 aa  90.9  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  31.65 
 
 		 397 aa  90.1  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  30.26 
 
 		 393 aa  89  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  29.46 
 
 		 397 aa  88.6  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  28.69 
 
 		 396 aa  87.8  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.42 
 
 		 357 aa  87.8  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  29.91 
 
 		 393 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  31.72 
 
 		 393 aa  86.3  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  28.95 
 
 		 402 aa  85.5  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.63 
 
 		 355 aa  85.5  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.13 
 
 		 355 aa  85.5  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.92 
 
 		 354 aa  85.1  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.12 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  25.65 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  27.76 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  29.15 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  28.38 
 
 		 326 aa  82.4  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  28.46 
 
 		 391 aa  82  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  29.88 
 
 		 401 aa  82  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.09 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  27.24 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.46 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.44 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.78 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.29 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  30 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.71 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.81 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  29.63 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  30.69 
 
 		 833 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  25.1 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.11 
 
 		 364 aa  79.3  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  31.9 
 
 		 414 aa  79  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  30.69 
 
 		 832 aa  79  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  33.05 
 
 		 392 aa  79  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.83 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  25.2 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.83 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.7 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.62 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  27.78 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.12 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  28.71 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4141  Nucleotidyl transferase  28.37 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020886 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.44 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.29 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  25.58 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.86 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.97 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  28.37 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  29.63 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.08 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  25.44 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.23 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  25.3 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  28.78 
 
 		 411 aa  75.5  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.81 
 
 		 357 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.64 
 
 		 344 aa  75.5  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  30.39 
 
 		 399 aa  75.5  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.77 
 
 		 354 aa  75.5  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  26.75 
 
 		 325 aa  75.1  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2236  nucleotidyl transferase  26.24 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  29.09 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.07 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.71 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  29.41 
 
 		 841 aa  74.3  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  27.63 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.4 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  23.25 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  29.29 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  25 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3317  Nucleotidyl transferase  26.7 
 
 		 243 aa  72  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  24.9 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  25.53 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  30.36 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.17 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.57 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1351  Nucleotidyl transferase  25.41 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397002  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.83 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  29.35 
 
 		 827 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0521  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  25.11 
 
 		 450 aa  68.9  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000119793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>