More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2373 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2373  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  121  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  77.59 
 
 		 461 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  77.59 
 
 		 461 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  72.41 
 
 		 469 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  74.14 
 
 		 461 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  68.97 
 
 		 464 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  70.69 
 
 		 461 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  86.05 
 
 		 457 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  86.05 
 
 		 457 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  86.05 
 
 		 457 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  86.05 
 
 		 457 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5816  major facilitator superfamily MFS_1  70.18 
 
 		 468 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2248  major facilitator superfamily MFS_1  75 
 
 		 463 aa  78.6  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169754  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  63.16 
 
 		 477 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  81.4 
 
 		 467 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  64.41 
 
 		 468 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  70.83 
 
 		 477 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  79.07 
 
 		 459 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0102  major facilitator superfamily MFS_1  64.58 
 
 		 456 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5800  major facilitator superfamily MFS_1  74.42 
 
 		 477 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000483558  normal  0.391929 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  62 
 
 		 453 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  72.5 
 
 		 493 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3484  major facilitator transporter  65.91 
 
 		 468 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  48.33 
 
 		 458 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2130  major facilitator superfamily MFS_1  59.52 
 
 		 464 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3858  major facilitator superfamily MFS_1  51.79 
 
 		 439 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  58.14 
 
 		 436 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2329  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 452 aa  60.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126091  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4082  major facilitator transporter  59.09 
 
 		 439 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  46.55 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  46.55 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  46.55 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2036  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  47.83 
 
 		 433 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70971  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1681  major facilitator transporter  57.5 
 
 		 439 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0114815  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1100  major facilitator family transporter  57.5 
 
 		 444 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341901  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0253  major facilitator family transporter  57.5 
 
 		 444 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1162  major facilitator family transporter  57.5 
 
 		 439 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12498  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1267  major facilitator family transporter  57.5 
 
 		 439 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1770  major facilitator family transporter  57.5 
 
 		 457 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363498  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0098  major facilitator family transporter  57.5 
 
 		 457 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381076  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0326  major facilitator family transporter  57.5 
 
 		 457 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.544768  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  56.52 
 
 		 439 aa  57.8  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11224  integral membrane transport protein  57.14 
 
 		 425 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000679327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  52.38 
 
 		 463 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  63.89 
 
 		 444 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  46.03 
 
 		 439 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3276  major facilitator superfamily MFS_1  48.94 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  57.5 
 
 		 437 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  48.89 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  53.49 
 
 		 431 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  52.38 
 
 		 441 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  52.38 
 
 		 439 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 439 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  57.5 
 
 		 437 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 439 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  46.03 
 
 		 439 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  46.81 
 
 		 467 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 439 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  53.49 
 
 		 436 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  53.49 
 
 		 436 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  54.76 
 
 		 457 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4803  major facilitator superfamily MFS_1  63.16 
 
 		 444 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.543727 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2888  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  40.82 
 
 		 434 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  54.76 
 
 		 457 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  53.49 
 
 		 436 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  54.76 
 
 		 457 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3920  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44 
 
 		 440 aa  54.7  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.210524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  52.38 
 
 		 430 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1268  major facilitator superfamily MFS_1  43.86 
 
 		 473 aa  54.3  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3744  General substrate transporter  57.14 
 
 		 465 aa  53.9  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  48.89 
 
 		 441 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 439 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  52.38 
 
 		 482 aa  53.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  46.67 
 
 		 442 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3803  MFS transporter metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  43.14 
 
 		 440 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3881  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  43.14 
 
 		 440 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148005  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1753  major facilitator family transporter  52.5 
 
 		 443 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1677  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  52.38 
 
 		 446 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.905645 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2779  major facilitator family transporter  52.5 
 
 		 443 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1665  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  52.38 
 
 		 446 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1540  major facilitator superfamily MFS_1  52.27 
 
 		 468 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0867894 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  44.19 
 
 		 430 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1621  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  42.86 
 
 		 455 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00533306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2586  major facilitator superfamily MFS_1  48.94 
 
 		 435 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.900551  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1831  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  52.38 
 
 		 446 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  55.26 
 
 		 438 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3984  MFS transporter metabolite:H+ symporter family protein  43.14 
 
 		 440 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.139706 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1534  major facilitator family transporter  52.5 
 
 		 443 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.348841  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 465 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1002  major facilitator superfamily MFS_1  42.31 
 
 		 468 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.101841 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3816  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  43.14 
 
 		 440 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1618  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  52.38 
 
 		 446 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1609  inner membrane metabolite transport protein YdfJ  52.38 
 
 		 446 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5058  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 468 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2262  major facilitator family transporter  52.5 
 
 		 443 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.445444  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3925  MFS transporter/metabolite:H+ symporter family protein  43.14 
 
 		 440 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3057  major facilitator family transporter  52.5 
 
 		 443 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.758675  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  47.62 
 
 		 443 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  50 
 
 		 455 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  46.51 
 
 		 446 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>