More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1298 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1298  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
341 aa  666    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.17642  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  27.86 
 
 
718 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  30.92 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  26.47 
 
 
770 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 
618 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.86 
 
 
1125 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  37.87 
 
 
451 aa  102  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  24.61 
 
 
648 aa  99.8  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.44 
 
 
853 aa  97.4  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  32.86 
 
 
1333 aa  97.1  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.87 
 
 
487 aa  97.1  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2424  HD-GYP domain-containing protein  33.88 
 
 
400 aa  96.7  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  29.08 
 
 
550 aa  95.9  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  28.76 
 
 
553 aa  95.9  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0061  metal dependent phosphohydrolase  39.46 
 
 
465 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0188  metal dependent phosphohydrolase  33.71 
 
 
279 aa  94.7  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.691401  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0190  metal dependent phosphohydrolase  33.71 
 
 
279 aa  94.7  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.780552  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 
428 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
465 aa  93.2  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  30.42 
 
 
703 aa  92.4  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.2 
 
 
513 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  30.42 
 
 
703 aa  92  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.17 
 
 
496 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.46 
 
 
960 aa  90.9  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 
615 aa  90.9  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0220  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
371 aa  90.5  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  33.97 
 
 
387 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 
508 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  29.55 
 
 
548 aa  89.7  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0970  response regulator receiver  35.67 
 
 
438 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  31.47 
 
 
509 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  32.61 
 
 
836 aa  89  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 
547 aa  88.6  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 
718 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1018  metal dependent phosphohydrolase  37.13 
 
 
652 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 
547 aa  88.6  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2111  metal dependent phosphohydrolase  32.28 
 
 
201 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.61 
 
 
841 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  29.47 
 
 
407 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  30.94 
 
 
451 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.98 
 
 
491 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  32.61 
 
 
792 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.53 
 
 
343 aa  87.4  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1141  metal dependent phosphohydrolase  33.52 
 
 
197 aa  87.4  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000147329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.21 
 
 
971 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.09 
 
 
860 aa  86.7  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1178  metal dependent phosphohydrolase  39.39 
 
 
317 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1246  metal dependent phosphohydrolase  39.39 
 
 
317 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.09 
 
 
880 aa  86.7  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1949  metal dependent phosphohydrolase  39.69 
 
 
226 aa  87  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000478205  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  26.52 
 
 
363 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
469 aa  86.3  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  30.15 
 
 
719 aa  85.9  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  27.83 
 
 
373 aa  85.9  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0262  metal dependent phosphohydrolase  27.45 
 
 
523 aa  85.9  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.703004  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  34.43 
 
 
1313 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.61 
 
 
1073 aa  85.9  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2450  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 
617 aa  85.1  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  31.65 
 
 
471 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.87 
 
 
498 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  35.67 
 
 
651 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  36.71 
 
 
428 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  26.5 
 
 
692 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 
487 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8321  putative metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
451 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1328  metal dependent phosphohydrolase  29.27 
 
 
268 aa  84  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  34.85 
 
 
388 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0383  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.04 
 
 
746 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1052  HD domain protein  27.42 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34036e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0914  HD domain-containing protein  27.42 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  27.42 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0881  group-specific protein  27.42 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0975  HD domain-containing protein  27.42 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0726  metal dependent phosphohydrolase  26.73 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0306  metal dependent phosphohydrolase  31.96 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.62 
 
 
506 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  31.09 
 
 
438 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  30.21 
 
 
712 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  32.91 
 
 
428 aa  82.8  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1793  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 
298 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000123225  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.45 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0979  metal dependent phosphohydrolase  28.27 
 
 
374 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  32.52 
 
 
430 aa  82.4  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  32.02 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1836  metal dependent phosphohydrolase  34.72 
 
 
210 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1118  metal dependent phosphohydrolase  38.64 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328624  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  22.76 
 
 
452 aa  81.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  34.64 
 
 
518 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  29.63 
 
 
740 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2934  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.44 
 
 
683 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  24.91 
 
 
424 aa  80.1  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  33.33 
 
 
561 aa  80.5  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1432  metal dependent phosphohydrolase  38.06 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000116071  normal  0.0291247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2443  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 
912 aa  80.5  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2483  putative PAS/PAC sensor protein  36.71 
 
 
619 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.55 
 
 
593 aa  80.5  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  30.46 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.6 
 
 
357 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  30.46 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>