220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3443 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0061  K potassium transporter  54.74 
 
 
655 aa  735    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3467  K potassium transporter  47.98 
 
 
651 aa  641    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0767221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6986  K potassium transporter  58.27 
 
 
661 aa  806    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571387  hitchhiker  0.00000436362 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2024  K potassium transporter  52.01 
 
 
650 aa  684    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00348692  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2974  K potassium transporter  70.77 
 
 
650 aa  944    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3426  low affinity potassium transport system  60.86 
 
 
655 aa  805    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1235  potassium transporter  48.57 
 
 
665 aa  642    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000105426  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4676  K potassium transporter  73.54 
 
 
648 aa  1031    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4780  K+ potassium transporter  59.33 
 
 
657 aa  779    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3443  K potassium transporter  100 
 
 
646 aa  1312    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0884  K potassium transporter  55.78 
 
 
650 aa  767    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.011338 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1046  potassium transporter family protein  48.93 
 
 
657 aa  634  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000334828  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1090  potassium uptake protein, putative  45.66 
 
 
666 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0643  K+ transporter  45.6 
 
 
673 aa  569  1e-161  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0152538  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0644  K+ transporter  46.02 
 
 
671 aa  558  1e-157  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00948742  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1015  K potassium transporter  42.97 
 
 
760 aa  555  1e-156  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.020253  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0153  K+ transporter  42.31 
 
 
682 aa  544  1e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000510146  unclonable  2.5551699999999998e-27 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1011  K+ transporter  39.82 
 
 
677 aa  502  1e-141  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0760728  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1553  K+ transporter  37.99 
 
 
834 aa  485  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0403456  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1247  K+ potassium transporter  37.25 
 
 
877 aa  465  1e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801309 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  39.77 
 
 
621 aa  359  7e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  39.45 
 
 
620 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  38.21 
 
 
620 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  43.11 
 
 
647 aa  353  4e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  38.57 
 
 
620 aa  353  8e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  39.96 
 
 
636 aa  351  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  37.46 
 
 
624 aa  351  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  37.52 
 
 
637 aa  347  4e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1596  K potassium transporter  38.35 
 
 
637 aa  345  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286785  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  38.03 
 
 
630 aa  345  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  34.87 
 
 
633 aa  345  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5167  K potassium transporter  35.64 
 
 
655 aa  344  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0763503  normal  0.222033 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  34.48 
 
 
633 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  37.21 
 
 
620 aa  339  8e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2282  K potassium transporter  43.19 
 
 
642 aa  339  9e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.795196  normal  0.048597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2557  K potassium transporter  43.9 
 
 
642 aa  339  9e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.173587 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2507  K potassium transporter  38.47 
 
 
614 aa  337  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  42.51 
 
 
628 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  42.11 
 
 
628 aa  335  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  36.6 
 
 
664 aa  335  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0514546 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  40.3 
 
 
656 aa  335  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0739  K potassium transporter  38.42 
 
 
647 aa  335  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  38.34 
 
 
626 aa  334  3e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  37.46 
 
 
622 aa  334  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  37.46 
 
 
622 aa  334  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  41.13 
 
 
647 aa  334  4e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0976  potassium uptake protein, Kup system  38.15 
 
 
626 aa  334  4e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  42.86 
 
 
622 aa  333  5e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4117  potassium transport protein Kup  38.3 
 
 
622 aa  333  5e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0495643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  43.02 
 
 
639 aa  333  5e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  33.76 
 
 
633 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  38.3 
 
 
622 aa  333  8e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  38.3 
 
 
622 aa  333  8e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  41.93 
 
 
622 aa  332  9e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  43.74 
 
 
622 aa  333  9e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0511  K potassium transporter  37.87 
 
 
637 aa  332  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  34.86 
 
 
631 aa  332  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1190  hypothetical protein  43.52 
 
 
624 aa  331  2e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  34.93 
 
 
631 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  42.86 
 
 
622 aa  331  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  42.09 
 
 
634 aa  332  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  41.67 
 
 
628 aa  332  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  43.45 
 
 
637 aa  331  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  43.81 
 
 
651 aa  332  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  43.81 
 
 
661 aa  330  5.0000000000000004e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2018  Kup system potassium uptake protein  37.92 
 
 
643 aa  330  6e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.36441 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03631  potassium transporter  38.27 
 
 
622 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4220  potassium uptake protein  38.27 
 
 
622 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  38.27 
 
 
622 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4247  potassium transport protein Kup  38.27 
 
 
622 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4173  potassium transport protein Kup  38.27 
 
 
622 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03575  hypothetical protein  38.27 
 
 
622 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3963  potassium transport protein Kup  38.27 
 
 
622 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4115  potassium transport protein Kup  38.27 
 
 
622 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.133962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  41.89 
 
 
622 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2239  K potassium transporter  38.93 
 
 
646 aa  327  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.447875  normal  0.116397 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  41.28 
 
 
622 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  41.06 
 
 
622 aa  325  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  41.28 
 
 
627 aa  325  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5183  potassium transport protein Kup  38.08 
 
 
622 aa  324  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.594597 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3979  potassium transport protein Kup  41.28 
 
 
622 aa  324  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4092  potassium transport protein Kup  38.65 
 
 
622 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  40.98 
 
 
634 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4179  potassium transport protein Kup  42.73 
 
 
622 aa  324  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.418392  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4272  potassium transport protein Kup  38.65 
 
 
622 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.461844  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4163  potassium transport protein Kup  38.65 
 
 
622 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.134372  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4213  potassium transport protein Kup  38.65 
 
 
622 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.681675  normal  0.819116 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4107  potassium transport protein Kup  38.65 
 
 
622 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382302  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  39.2 
 
 
633 aa  324  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  37.57 
 
 
630 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1394  K+ potassium transporter  36.45 
 
 
648 aa  323  6e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4594  potassium uptake protein Kup  36.63 
 
 
634 aa  323  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  37.55 
 
 
622 aa  323  7e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  37.85 
 
 
637 aa  323  8e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0985  K potassium transporter  41.54 
 
 
680 aa  323  9.000000000000001e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333179 
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  42.3 
 
 
651 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4387  K potassium transporter  42.82 
 
 
631 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.635262 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  38.7 
 
 
634 aa  322  9.999999999999999e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  36.47 
 
 
634 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  36.96 
 
 
628 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.506892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>