219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3909 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  54.35 
 
 
630 aa  661    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  51.45 
 
 
621 aa  643    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  52.82 
 
 
626 aa  650    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  51.69 
 
 
636 aa  639    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  53.91 
 
 
624 aa  663    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  56.77 
 
 
632 aa  732    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  51.6 
 
 
620 aa  641    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  79.9 
 
 
627 aa  1021    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  76.37 
 
 
622 aa  978    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2539  K+ potassium transporter  55.88 
 
 
625 aa  686    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4252  K+ potassium transporter  55.56 
 
 
641 aa  660    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  78.94 
 
 
622 aa  1019    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  51.55 
 
 
620 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3762  K potassium transporter  53.31 
 
 
650 aa  653    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  100 
 
 
622 aa  1249    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  87.78 
 
 
622 aa  1112    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  77.97 
 
 
622 aa  1008    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  100 
 
 
622 aa  1249    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  85.53 
 
 
622 aa  1087    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  70.34 
 
 
628 aa  878    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6716  K potassium transporter  55.99 
 
 
641 aa  682    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19104  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  66.99 
 
 
628 aa  882    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4723  K potassium transporter  55.83 
 
 
640 aa  682    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0485791 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  77.22 
 
 
639 aa  979    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  50.65 
 
 
628 aa  631  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1475  K potassium transporter  51.21 
 
 
638 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765149  normal  0.163846 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  50.8 
 
 
637 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  51.36 
 
 
620 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  50.72 
 
 
628 aa  629  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  51.55 
 
 
620 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  50.48 
 
 
628 aa  631  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  51.55 
 
 
631 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  50.65 
 
 
630 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  50.48 
 
 
660 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  50.65 
 
 
660 aa  627  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  50.64 
 
 
637 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  50.65 
 
 
630 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  50.65 
 
 
630 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  50.48 
 
 
630 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  50.48 
 
 
630 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  50.65 
 
 
622 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5100  K+ transporter  50.16 
 
 
638 aa  623  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6280  K+ potassium transporter  50.32 
 
 
688 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1799  K+ potassium transporter  50.32 
 
 
638 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1823  K potassium transporter  50.32 
 
 
638 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0350815  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  51.06 
 
 
631 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  51.13 
 
 
656 aa  620  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  48.15 
 
 
647 aa  612  9.999999999999999e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  51.37 
 
 
633 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  52.41 
 
 
634 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24540  potassium uptake protein  52.81 
 
 
632 aa  605  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.465778  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  50.16 
 
 
620 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  49.12 
 
 
637 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1598  K potassium transporter  51.46 
 
 
633 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  51.29 
 
 
639 aa  604  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4594  potassium uptake protein Kup  52.34 
 
 
634 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1753  potassium uptake protein  49.92 
 
 
644 aa  600  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.909141  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  48.55 
 
 
634 aa  597  1e-169  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1926  K potassium transporter  51.29 
 
 
633 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406918  normal  0.0407314 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4277  K potassium transporter  51.92 
 
 
631 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4387  K potassium transporter  51.92 
 
 
631 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.635262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3926  K potassium transporter  50.56 
 
 
641 aa  594  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.147688 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  48.22 
 
 
637 aa  595  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  49.18 
 
 
647 aa  592  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1052  potassium uptake transmembrane protein  53.1 
 
 
613 aa  591  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  48.39 
 
 
634 aa  591  1e-167  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2061  K+ potassium transporter  49.59 
 
 
644 aa  588  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266591  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4015  K potassium transporter  51.45 
 
 
632 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.035438 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2018  Kup system potassium uptake protein  50.08 
 
 
643 aa  585  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  52.03 
 
 
614 aa  585  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3513  Kup family low affinity potassium transporter  50.16 
 
 
640 aa  585  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03631  potassium transporter  47.84 
 
 
622 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4220  potassium uptake protein  47.84 
 
 
622 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  51.2 
 
 
631 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4247  potassium transport protein Kup  47.84 
 
 
622 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03575  hypothetical protein  47.84 
 
 
622 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4173  potassium transport protein Kup  47.84 
 
 
622 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  48.33 
 
 
622 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1394  K+ potassium transporter  47.1 
 
 
648 aa  585  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  47.84 
 
 
622 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4115  potassium transport protein Kup  47.84 
 
 
622 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.133962 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3963  potassium transport protein Kup  47.84 
 
 
622 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  47.76 
 
 
622 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  48.33 
 
 
622 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4218  K potassium transporter  51.29 
 
 
636 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.945846  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  47.6 
 
 
622 aa  579  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1192  K+ potassium transporter  51.93 
 
 
633 aa  578  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0006  potassium transport protein Kup  48.33 
 
 
622 aa  580  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0580063  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4117  potassium transport protein Kup  47.84 
 
 
622 aa  580  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0495643 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5183  potassium transport protein Kup  47.68 
 
 
622 aa  580  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.594597 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2327  K potassium transporter  47.41 
 
 
658 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163546 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  48.17 
 
 
622 aa  578  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1200  Kup system potassium uptake protein  51.13 
 
 
636 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2771  K potassium transporter  49.19 
 
 
637 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3979  potassium transport protein Kup  46.65 
 
 
622 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0949  K+ potassium transporter  50.74 
 
 
670 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.986532  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1010  K potassium transporter  50.74 
 
 
671 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1007  K potassium transporter  50.9 
 
 
671 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1262  K potassium transporter  47.15 
 
 
643 aa  569  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0285347 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  48.06 
 
 
653 aa  566  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>