219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0629 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  100 
 
 
664 aa  1344    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0514546 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0141  K+ potassium transporter  56.78 
 
 
630 aa  677    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  49.2 
 
 
621 aa  610  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  50.72 
 
 
620 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  50.81 
 
 
620 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  50.16 
 
 
620 aa  598  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  50.32 
 
 
620 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  49.76 
 
 
620 aa  596  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1262  K potassium transporter  49.2 
 
 
643 aa  593  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0285347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3513  Kup family low affinity potassium transporter  48.96 
 
 
640 aa  594  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  48.97 
 
 
630 aa  587  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  49.92 
 
 
624 aa  586  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  50.16 
 
 
639 aa  588  1e-166  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3932  K potassium transporter  46.62 
 
 
672 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0963001  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2061  K+ potassium transporter  49.59 
 
 
644 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266591  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  48.62 
 
 
626 aa  580  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  47 
 
 
630 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  46.89 
 
 
656 aa  579  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  49.19 
 
 
632 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  49.59 
 
 
622 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1643  K potassium transporter  48.41 
 
 
670 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1596  K potassium transporter  48.57 
 
 
668 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.0938769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1877  K potassium transporter  48.57 
 
 
668 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.119842  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2327  K potassium transporter  47.21 
 
 
658 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  47.78 
 
 
628 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  47.86 
 
 
630 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  46.97 
 
 
636 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  47.03 
 
 
660 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  48.04 
 
 
628 aa  570  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  47.45 
 
 
634 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  47.86 
 
 
630 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  47.86 
 
 
630 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  47.7 
 
 
630 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  47.7 
 
 
630 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  48.17 
 
 
622 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5357  K potassium transporter  47.29 
 
 
656 aa  565  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00124872  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  46.52 
 
 
631 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1823  K potassium transporter  48.09 
 
 
638 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0350815  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  47.93 
 
 
637 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  46.6 
 
 
631 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  47.39 
 
 
660 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1753  potassium uptake protein  48.11 
 
 
644 aa  568  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.909141  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6280  K+ potassium transporter  48.09 
 
 
688 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  47.93 
 
 
637 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1799  K+ potassium transporter  48.09 
 
 
638 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1475  K potassium transporter  48.09 
 
 
638 aa  567  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765149  normal  0.163846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  46.82 
 
 
632 aa  566  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  46.25 
 
 
622 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1394  K+ potassium transporter  46.23 
 
 
648 aa  563  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  49.92 
 
 
637 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  47.87 
 
 
634 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  47.49 
 
 
653 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  46.09 
 
 
622 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  46.42 
 
 
622 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  48.02 
 
 
633 aa  561  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6716  K potassium transporter  47.54 
 
 
641 aa  561  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19104  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5100  K+ transporter  47.93 
 
 
638 aa  561  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  47.78 
 
 
627 aa  561  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  47.29 
 
 
628 aa  561  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  47.73 
 
 
639 aa  561  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  45.27 
 
 
647 aa  558  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  46.42 
 
 
622 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  46.98 
 
 
628 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  49.59 
 
 
614 aa  555  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  47.65 
 
 
634 aa  556  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1598  K potassium transporter  49.51 
 
 
633 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  47.29 
 
 
622 aa  556  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4117  potassium transport protein Kup  47.23 
 
 
622 aa  557  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0495643 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  47.67 
 
 
634 aa  557  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2222  K potassium transporter  47.19 
 
 
629 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.569984  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  46.8 
 
 
622 aa  553  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1497  K+ potassium transporter  46.52 
 
 
666 aa  553  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  46.24 
 
 
661 aa  552  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1926  K potassium transporter  49.35 
 
 
633 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406918  normal  0.0407314 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0006  potassium transport protein Kup  46.26 
 
 
622 aa  554  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0580063  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0444  K potassium transporter  45.5 
 
 
630 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0753432 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  44.29 
 
 
651 aa  553  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4179  potassium transport protein Kup  44.73 
 
 
622 aa  549  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.418392  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  47.47 
 
 
631 aa  551  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1238  K+ potassium transporter  47.92 
 
 
651 aa  550  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.261795  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4765  K potassium transporter  46.42 
 
 
652 aa  548  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.266428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2539  K+ potassium transporter  46.4 
 
 
625 aa  551  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  47.2 
 
 
634 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  45.95 
 
 
622 aa  550  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  48.06 
 
 
637 aa  550  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  45.02 
 
 
637 aa  549  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  47.78 
 
 
622 aa  548  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  47.95 
 
 
622 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  48.24 
 
 
636 aa  550  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4723  K potassium transporter  46.23 
 
 
640 aa  551  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0485791 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3979  potassium transport protein Kup  44.82 
 
 
622 aa  551  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0551  K potassium transporter  43.7 
 
 
632 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  48.44 
 
 
622 aa  548  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  47.65 
 
 
637 aa  547  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  44.08 
 
 
647 aa  548  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  48.44 
 
 
622 aa  548  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5050  K potassium transporter  47.13 
 
 
657 aa  548  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992645 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4594  potassium uptake protein Kup  48.24 
 
 
634 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  46.25 
 
 
622 aa  544  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3963  potassium transport protein Kup  46.25 
 
 
622 aa  544  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>