219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3556 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  57.42 
 
 		 631 aa  683    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  54.9 
 
 		 631 aa  652    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  53.21 
 
 		 630 aa  654    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  53.58 
 
 		 639 aa  662    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1823  K potassium transporter  52.88 
 
 		 638 aa  640    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0350815  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  54.9 
 
 		 631 aa  647    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  61.87 
 
 		 630 aa  786    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  54.95 
 
 		 621 aa  697    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  100 
 
 		 626 aa  1253    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  52.24 
 
 		 636 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  52.82 
 
 		 622 aa  650    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  57.19 
 
 		 624 aa  691    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  53.92 
 
 		 620 aa  684    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  53.37 
 
 		 660 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5100  K+ transporter  52.72 
 
 		 638 aa  636    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  51.36 
 
 		 628 aa  637    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  54.12 
 
 		 632 aa  675    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  53.37 
 
 		 660 aa  654    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0949  K+ potassium transporter  55.46 
 
 		 670 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.986532  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  54.35 
 
 		 620 aa  669    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  53.63 
 
 		 622 aa  664    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2539  K+ potassium transporter  53.37 
 
 		 625 aa  654    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  55.39 
 
 		 620 aa  674    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4252  K+ potassium transporter  52.4 
 
 		 641 aa  636    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  53.62 
 
 		 622 aa  667    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  52.88 
 
 		 628 aa  651    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  53.62 
 
 		 620 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6280  K+ potassium transporter  52.88 
 
 		 688 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  52.97 
 
 		 627 aa  669    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  52.64 
 
 		 637 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  50.96 
 
 		 637 aa  639    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1799  K+ potassium transporter  52.88 
 
 		 638 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  52.67 
 
 		 637 aa  646    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  52.82 
 
 		 622 aa  651    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  53.87 
 
 		 622 aa  672    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  52.82 
 
 		 622 aa  650    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  53.21 
 
 		 630 aa  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  53.62 
 
 		 622 aa  664    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  52.87 
 
 		 628 aa  650    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  53.21 
 
 		 630 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  53.37 
 
 		 630 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  53.37 
 
 		 630 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  53.47 
 
 		 622 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1475  K potassium transporter  52.79 
 
 		 638 aa  636    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765149  normal  0.163846 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1010  K potassium transporter  55.56 
 
 		 671 aa  656    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1007  K potassium transporter  55.57 
 
 		 671 aa  657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  52.99 
 
 		 628 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  54.59 
 
 		 620 aa  672    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  53.37 
 
 		 628 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2061  K+ potassium transporter  55.61 
 
 		 644 aa  655    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  52.48 
 
 		 637 aa  638    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0989  K potassium transporter  56.37 
 
 		 663 aa  644    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00318249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0006  potassium transport protein Kup  51.45 
 
 		 622 aa  632  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0580063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  51.45 
 
 		 622 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  51.45 
 
 		 622 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4723  K potassium transporter  52.14 
 
 		 640 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0485791 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0985  K potassium transporter  51.58 
 
 		 680 aa  628  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  52.69 
 
 		 656 aa  629  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  52.33 
 
 		 633 aa  627  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  51.28 
 
 		 622 aa  627  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1394  K+ potassium transporter  51.28 
 
 		 648 aa  626  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  51.28 
 
 		 622 aa  627  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0976  potassium uptake protein, Kup system  50.24 
 
 		 626 aa  622  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2018  Kup system potassium uptake protein  51.52 
 
 		 643 aa  623  1e-177  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24540  potassium uptake protein  54.57 
 
 		 632 aa  622  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.465778  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  51.29 
 
 		 622 aa  623  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  50.32 
 
 		 647 aa  623  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6716  K potassium transporter  51.81 
 
 		 641 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1598  K potassium transporter  52.66 
 
 		 633 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3979  potassium transport protein Kup  50 
 
 		 622 aa  620  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  51.22 
 
 		 639 aa  618  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3762  K potassium transporter  52.33 
 
 		 650 aa  618  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1926  K potassium transporter  52.82 
 
 		 633 aa  618  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406918  normal  0.0407314 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  51.13 
 
 		 634 aa  615  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4179  potassium transport protein Kup  49.84 
 
 		 622 aa  615  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.418392  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1192  K+ potassium transporter  53.78 
 
 		 633 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  51.45 
 
 		 653 aa  615  9.999999999999999e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5183  potassium transport protein Kup  49.36 
 
 		 622 aa  608  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.594597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  50.08 
 
 		 634 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4117  potassium transport protein Kup  49.68 
 
 		 622 aa  609  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0495643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3513  Kup family low affinity potassium transporter  50.81 
 
 		 640 aa  609  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03631  potassium transporter  49.36 
 
 		 622 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4220  potassium uptake protein  49.36 
 
 		 622 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3963  potassium transport protein Kup  49.36 
 
 		 622 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2771  K potassium transporter  52.12 
 
 		 637 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4173  potassium transport protein Kup  49.36 
 
 		 622 aa  607  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  50.08 
 
 		 633 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4247  potassium transport protein Kup  49.36 
 
 		 622 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  50.74 
 
 		 647 aa  605  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  49.36 
 
 		 622 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4115  potassium transport protein Kup  49.36 
 
 		 622 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133962 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3574  K+ potassium transporter  51.38 
 
 		 640 aa  606  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0248596  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  50.97 
 
 		 634 aa  607  9.999999999999999e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2327  K potassium transporter  50.48 
 
 		 658 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163546 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  49.52 
 
 		 633 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03575  hypothetical protein  49.36 
 
 		 622 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1262  K potassium transporter  50.65 
 
 		 643 aa  604  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0285347 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  52.92 
 
 		 634 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  49.52 
 
 		 633 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4594  potassium uptake protein Kup  52.92 
 
 		 634 aa  601  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>