219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1394 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  54.12 
 
 
620 aa  670    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  54.34 
 
 
620 aa  681    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  54.12 
 
 
621 aa  676    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  55.13 
 
 
624 aa  665    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  54.5 
 
 
620 aa  687    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1394  K+ potassium transporter  100 
 
 
648 aa  1308    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  53.68 
 
 
620 aa  675    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  54.5 
 
 
620 aa  695    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  63.97 
 
 
653 aa  803    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2061  K+ potassium transporter  63.29 
 
 
644 aa  811    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266591  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  50.58 
 
 
630 aa  628  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  51.28 
 
 
626 aa  626  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  49.6 
 
 
628 aa  617  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  48.7 
 
 
636 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  49.76 
 
 
628 aa  610  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  47.78 
 
 
637 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  49.6 
 
 
628 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  49.84 
 
 
631 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  47.58 
 
 
631 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  48.96 
 
 
630 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1823  K potassium transporter  48.36 
 
 
638 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0350815  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  48.81 
 
 
632 aa  605  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  48.89 
 
 
660 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  47.93 
 
 
637 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1799  K+ potassium transporter  48.36 
 
 
638 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  48.96 
 
 
630 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  48.96 
 
 
630 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  47.98 
 
 
631 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  48.8 
 
 
660 aa  601  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5100  K+ transporter  48.12 
 
 
638 aa  600  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6280  K+ potassium transporter  48.36 
 
 
688 aa  601  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  48.8 
 
 
630 aa  601  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  48.8 
 
 
630 aa  601  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  49.28 
 
 
622 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  47.92 
 
 
647 aa  595  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  48.75 
 
 
639 aa  592  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  47.27 
 
 
647 aa  592  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1475  K potassium transporter  48.31 
 
 
638 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765149  normal  0.163846 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  46.94 
 
 
622 aa  588  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  47.93 
 
 
634 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4594  potassium uptake protein Kup  48.23 
 
 
634 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0949  K+ potassium transporter  48.93 
 
 
670 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.986532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  47.26 
 
 
628 aa  587  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1010  K potassium transporter  48.77 
 
 
671 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  49.19 
 
 
656 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  46.83 
 
 
627 aa  582  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1007  K potassium transporter  48.93 
 
 
671 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  47.1 
 
 
622 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  47.1 
 
 
622 aa  585  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24540  potassium uptake protein  49.84 
 
 
632 aa  584  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.465778  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  47.1 
 
 
622 aa  585  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  48.29 
 
 
639 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  46.61 
 
 
622 aa  580  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  44.74 
 
 
637 aa  580  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  48.09 
 
 
628 aa  578  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0989  K potassium transporter  49.67 
 
 
663 aa  582  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00318249  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  48.35 
 
 
633 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  46.09 
 
 
637 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1192  K+ potassium transporter  49.21 
 
 
633 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1262  K potassium transporter  47.32 
 
 
643 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0285347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1926  K potassium transporter  47.58 
 
 
633 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406918  normal  0.0407314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4015  K potassium transporter  49.13 
 
 
632 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.035438 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1598  K potassium transporter  47.5 
 
 
633 aa  571  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  46.7 
 
 
622 aa  569  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  46.94 
 
 
622 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  45.97 
 
 
622 aa  565  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4218  K potassium transporter  48.44 
 
 
636 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.945846  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3762  K potassium transporter  47.17 
 
 
650 aa  566  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  46.94 
 
 
622 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  46.23 
 
 
664 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0514546 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  47.57 
 
 
634 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0006  potassium transport protein Kup  47.06 
 
 
622 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0580063  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1200  Kup system potassium uptake protein  49.06 
 
 
636 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4723  K potassium transporter  47.29 
 
 
640 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0485791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  48.21 
 
 
634 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4252  K+ potassium transporter  47.88 
 
 
641 aa  555  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  46.61 
 
 
622 aa  556  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  47.73 
 
 
634 aa  558  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2327  K potassium transporter  45.91 
 
 
658 aa  556  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0976  potassium uptake protein, Kup system  46.76 
 
 
626 aa  553  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1753  potassium uptake protein  47.3 
 
 
644 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.909141  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2539  K+ potassium transporter  47.08 
 
 
625 aa  554  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  46.33 
 
 
630 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  48.38 
 
 
634 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  44.73 
 
 
661 aa  552  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3513  Kup family low affinity potassium transporter  47.69 
 
 
640 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1052  potassium uptake transmembrane protein  47.64 
 
 
613 aa  549  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6716  K potassium transporter  44.79 
 
 
641 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19104  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2018  Kup system potassium uptake protein  44.22 
 
 
643 aa  551  1e-155  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1229  K+ potassium transporter  48.44 
 
 
636 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136519  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  47.89 
 
 
614 aa  545  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3926  K potassium transporter  47.63 
 
 
641 aa  546  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.147688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  46.75 
 
 
637 aa  545  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  45.92 
 
 
622 aa  548  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  45.82 
 
 
636 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0985  K potassium transporter  44.22 
 
 
680 aa  545  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  45.66 
 
 
632 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  45.75 
 
 
622 aa  544  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4765  K potassium transporter  43.93 
 
 
652 aa  539  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.266428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  46.92 
 
 
637 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>