219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1407 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03631  potassium transporter  51.04 
 
 
622 aa  660    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4220  potassium uptake protein  51.04 
 
 
622 aa  660    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4247  potassium transport protein Kup  51.04 
 
 
622 aa  660    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1475  K potassium transporter  84.03 
 
 
638 aa  1059    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765149  normal  0.163846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  67.66 
 
 
633 aa  852    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1052  potassium uptake transmembrane protein  59.97 
 
 
613 aa  737    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  50.81 
 
 
622 aa  657    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4213  potassium transport protein Kup  51.67 
 
 
622 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.681675  normal  0.819116 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  52.36 
 
 
631 aa  656    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  83.49 
 
 
630 aa  1058    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4277  K potassium transporter  59.58 
 
 
631 aa  733    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4092  potassium transport protein Kup  51.67 
 
 
622 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  83.49 
 
 
637 aa  1058    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1926  K potassium transporter  67.75 
 
 
633 aa  847    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406918  normal  0.0407314 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  52.03 
 
 
631 aa  652    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  52.81 
 
 
630 aa  654    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  55.48 
 
 
621 aa  692    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  52.99 
 
 
626 aa  662    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  68.46 
 
 
636 aa  888    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  51.77 
 
 
622 aa  666    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  53.98 
 
 
624 aa  676    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  83.65 
 
 
660 aa  1059    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5100  K+ transporter  83.2 
 
 
638 aa  1058    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  50.48 
 
 
622 aa  645    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  49.84 
 
 
634 aa  635    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  51.75 
 
 
632 aa  674    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  83.81 
 
 
660 aa  1060    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  52.77 
 
 
620 aa  666    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4173  potassium transport protein Kup  51.04 
 
 
622 aa  660    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0006  potassium transport protein Kup  51.61 
 
 
622 aa  658    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0580063  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  50.64 
 
 
622 aa  654    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  53.58 
 
 
620 aa  661    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  50.73 
 
 
639 aa  637    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3979  potassium transport protein Kup  50.48 
 
 
622 aa  642    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  51.45 
 
 
622 aa  657    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  90.45 
 
 
628 aa  1137    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2507  K potassium transporter  51.14 
 
 
614 aa  641    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  54.07 
 
 
620 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4107  potassium transport protein Kup  51.67 
 
 
622 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382302  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  68.78 
 
 
656 aa  877    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03575  hypothetical protein  51.04 
 
 
622 aa  660    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6280  K+ potassium transporter  82.73 
 
 
688 aa  1051    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  50.65 
 
 
622 aa  649    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  51.52 
 
 
627 aa  660    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4179  potassium transport protein Kup  50.16 
 
 
622 aa  638    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.418392  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  83.17 
 
 
637 aa  1054    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  50.48 
 
 
628 aa  639    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3963  potassium transport protein Kup  51.04 
 
 
622 aa  660    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  51.04 
 
 
622 aa  660    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1799  K+ potassium transporter  82.73 
 
 
638 aa  1051    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5183  potassium transport protein Kup  50.88 
 
 
622 aa  657    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.594597 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  50.4 
 
 
622 aa  651    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  51.61 
 
 
622 aa  661    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  50.48 
 
 
622 aa  645    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  83.49 
 
 
630 aa  1058    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  49.84 
 
 
622 aa  641    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  83.49 
 
 
630 aa  1058    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4115  potassium transport protein Kup  51.04 
 
 
622 aa  660    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.133962 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  83.65 
 
 
630 aa  1060    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  83.65 
 
 
630 aa  1060    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  84.19 
 
 
622 aa  1055    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  59.04 
 
 
647 aa  796    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4117  potassium transport protein Kup  50.4 
 
 
622 aa  653    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0495643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  100 
 
 
628 aa  1261    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1823  K potassium transporter  82.73 
 
 
638 aa  1051    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0350815  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4387  K potassium transporter  59.58 
 
 
631 aa  733    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.635262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  54.56 
 
 
620 aa  681    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  50.65 
 
 
622 aa  657    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  52.17 
 
 
620 aa  654    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  51.2 
 
 
639 aa  659    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2061  K+ potassium transporter  52.3 
 
 
644 aa  636    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266591  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1598  K potassium transporter  67.91 
 
 
633 aa  850    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  90.45 
 
 
628 aa  1134    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  50.97 
 
 
634 aa  639    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4163  potassium transport protein Kup  51.67 
 
 
622 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.134372  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4272  potassium transport protein Kup  51.67 
 
 
622 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.461844  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  51.77 
 
 
622 aa  666    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  50.65 
 
 
631 aa  630  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1394  K+ potassium transporter  49.6 
 
 
648 aa  627  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4723  K potassium transporter  51.15 
 
 
640 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0485791 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  49.26 
 
 
647 aa  624  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  49.84 
 
 
628 aa  622  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4015  K potassium transporter  52.85 
 
 
632 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.035438 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  48.47 
 
 
637 aa  619  1e-176  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1192  K+ potassium transporter  52.83 
 
 
633 aa  619  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  52.2 
 
 
634 aa  620  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24540  potassium uptake protein  51.87 
 
 
632 aa  619  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.465778  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6716  K potassium transporter  50 
 
 
641 aa  618  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19104  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  51.62 
 
 
614 aa  619  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4218  K potassium transporter  52.36 
 
 
636 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.945846  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  47.66 
 
 
637 aa  617  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4594  potassium uptake protein Kup  51.87 
 
 
634 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0976  potassium uptake protein, Kup system  50.49 
 
 
626 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0989  K potassium transporter  51.06 
 
 
663 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00318249  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1010  K potassium transporter  50.08 
 
 
671 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0949  K+ potassium transporter  50.41 
 
 
670 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.986532  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1007  K potassium transporter  50.08 
 
 
671 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2539  K+ potassium transporter  48.39 
 
 
625 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1200  Kup system potassium uptake protein  52.2 
 
 
636 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1229  K+ potassium transporter  52.2 
 
 
636 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136519  normal  0.564151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>