220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3426 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0884  K potassium transporter  57.73 
 
 
650 aa  784    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.011338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4676  K potassium transporter  61.07 
 
 
648 aa  820    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2974  K potassium transporter  61.31 
 
 
650 aa  796    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3426  low affinity potassium transport system  100 
 
 
655 aa  1330    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3443  K potassium transporter  60.86 
 
 
646 aa  820    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4780  K+ potassium transporter  58.55 
 
 
657 aa  771    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6986  K potassium transporter  60.15 
 
 
661 aa  815    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571387  hitchhiker  0.00000436362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3467  K potassium transporter  49.54 
 
 
651 aa  640    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0767221 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2024  K potassium transporter  49.77 
 
 
650 aa  652    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00348692  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0061  K potassium transporter  53.15 
 
 
655 aa  703    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685026 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1235  potassium transporter  49.55 
 
 
665 aa  632  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000105426  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1046  potassium transporter family protein  49.69 
 
 
657 aa  624  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000334828  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0643  K+ transporter  44.39 
 
 
673 aa  576  1.0000000000000001e-163  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0152538  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0644  K+ transporter  45.11 
 
 
671 aa  549  1e-155  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00948742  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0153  K+ transporter  44.11 
 
 
682 aa  551  1e-155  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000510146  unclonable  2.5551699999999998e-27 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1090  potassium uptake protein, putative  44.75 
 
 
666 aa  546  1e-154  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1015  K potassium transporter  39.53 
 
 
760 aa  522  1e-147  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.020253  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1011  K+ transporter  38.71 
 
 
677 aa  486  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0760728  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1553  K+ transporter  37.73 
 
 
834 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0403456  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1247  K+ potassium transporter  38.38 
 
 
877 aa  462  1e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1596  K potassium transporter  35.89 
 
 
637 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286785  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  41.48 
 
 
647 aa  323  9.000000000000001e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  36.28 
 
 
620 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  39.42 
 
 
634 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  39.92 
 
 
634 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  39.39 
 
 
621 aa  313  5.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  42.79 
 
 
647 aa  312  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0511  K potassium transporter  35.27 
 
 
637 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317674 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  34.61 
 
 
622 aa  310  6.999999999999999e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  38.2 
 
 
661 aa  309  9e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1190  hypothetical protein  40.92 
 
 
624 aa  309  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  38.17 
 
 
636 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1341  K+ transporter  40.23 
 
 
454 aa  308  3e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  34.11 
 
 
622 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  35 
 
 
637 aa  306  6e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2547  K potassium transporter  38.33 
 
 
625 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  37.01 
 
 
637 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  37.47 
 
 
622 aa  304  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  37.47 
 
 
622 aa  304  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  34.47 
 
 
631 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03631  potassium transporter  37.32 
 
 
622 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4220  potassium uptake protein  37.32 
 
 
622 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  37.32 
 
 
622 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03575  hypothetical protein  37.32 
 
 
622 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4247  potassium transport protein Kup  37.32 
 
 
622 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4173  potassium transport protein Kup  37.32 
 
 
622 aa  303  6.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3963  potassium transport protein Kup  37.32 
 
 
622 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3979  potassium transport protein Kup  34.14 
 
 
622 aa  303  6.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4115  potassium transport protein Kup  37.32 
 
 
622 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.133962 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  35.74 
 
 
620 aa  303  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  39.71 
 
 
633 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5183  potassium transport protein Kup  37.32 
 
 
622 aa  302  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.594597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1372  K potassium transporter  35.01 
 
 
649 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.560989  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  36.38 
 
 
628 aa  302  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  38.53 
 
 
639 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  36.01 
 
 
631 aa  301  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0976  potassium uptake protein, Kup system  37.17 
 
 
626 aa  301  3e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  34.64 
 
 
631 aa  301  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  40.04 
 
 
633 aa  301  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4117  potassium transport protein Kup  38.33 
 
 
622 aa  301  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0495643 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2282  K potassium transporter  39.09 
 
 
642 aa  300  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.795196  normal  0.048597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2557  K potassium transporter  39.7 
 
 
642 aa  301  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.173587 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  41.22 
 
 
633 aa  300  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  34.72 
 
 
620 aa  300  7e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  39 
 
 
622 aa  300  7e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  36.18 
 
 
628 aa  299  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  40.7 
 
 
651 aa  299  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  38.05 
 
 
630 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  38.25 
 
 
660 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1885  K potassium transporter  36.19 
 
 
622 aa  298  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.508127  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  38.05 
 
 
630 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  38.05 
 
 
630 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  38.05 
 
 
622 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0985  K potassium transporter  40.04 
 
 
680 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333179 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  38.05 
 
 
630 aa  298  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  38.05 
 
 
630 aa  298  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  38.05 
 
 
660 aa  297  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4179  potassium transport protein Kup  33.79 
 
 
622 aa  297  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.418392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3574  K+ potassium transporter  39.35 
 
 
640 aa  297  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0248596  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  39.17 
 
 
633 aa  296  6e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2018  Kup system potassium uptake protein  35.66 
 
 
643 aa  296  8e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  37.4 
 
 
637 aa  296  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  37.76 
 
 
630 aa  296  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  36.38 
 
 
637 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  38.81 
 
 
636 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  33.33 
 
 
624 aa  296  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5100  K+ transporter  38.31 
 
 
638 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0006  potassium transport protein Kup  37.47 
 
 
622 aa  295  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0580063  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  37.8 
 
 
637 aa  296  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  35.52 
 
 
632 aa  295  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6280  K+ potassium transporter  37.92 
 
 
688 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2252  K potassium transporter  35.78 
 
 
633 aa  294  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  39.09 
 
 
637 aa  294  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1799  K+ potassium transporter  37.92 
 
 
638 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1823  K potassium transporter  37.92 
 
 
638 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0350815  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  38 
 
 
622 aa  294  4e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0141  K+ potassium transporter  38.28 
 
 
630 aa  294  4e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  39.78 
 
 
651 aa  293  7e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2446  hypothetical protein  38.36 
 
 
629 aa  293  7e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  40.31 
 
 
626 aa  293  7e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>