219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2252 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0927  potassium uptake protein  63.95 
 
 
634 aa  766    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137865  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3932  K potassium transporter  53.95 
 
 
672 aa  640    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0963001  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2327  K potassium transporter  54.28 
 
 
658 aa  646    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0551  K potassium transporter  63.35 
 
 
632 aa  806    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0508  K potassium transporter  62.56 
 
 
632 aa  805    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845054  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  51.34 
 
 
630 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  53.16 
 
 
634 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  52.28 
 
 
633 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1262  K potassium transporter  53.15 
 
 
643 aa  642    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0285347 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2252  K potassium transporter  100 
 
 
633 aa  1266    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  53.14 
 
 
634 aa  642    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3513  Kup family low affinity potassium transporter  52.07 
 
 
640 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  52.39 
 
 
633 aa  648    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  51.73 
 
 
633 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2565  K potassium transporter  94.63 
 
 
633 aa  1160    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6041  K potassium transporter  69.32 
 
 
633 aa  850    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420233  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6370  K potassium transporter  65.75 
 
 
633 aa  807    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649313  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0444  K potassium transporter  64.66 
 
 
630 aa  813    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0753432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5357  K potassium transporter  54.46 
 
 
656 aa  629  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00124872  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  53.7 
 
 
636 aa  631  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  53.58 
 
 
637 aa  630  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  51.97 
 
 
632 aa  630  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  53.74 
 
 
637 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  50.65 
 
 
651 aa  628  1e-178  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  54.37 
 
 
637 aa  628  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  50.49 
 
 
651 aa  625  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  50.49 
 
 
651 aa  627  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1643  K potassium transporter  52.4 
 
 
670 aa  623  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1596  K potassium transporter  51.99 
 
 
668 aa  621  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.0938769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1877  K potassium transporter  51.99 
 
 
668 aa  620  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.119842  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4765  K potassium transporter  51.26 
 
 
652 aa  618  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.266428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5050  K potassium transporter  53.66 
 
 
657 aa  618  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1497  K+ potassium transporter  52.31 
 
 
666 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2222  K potassium transporter  52.56 
 
 
629 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.569984  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1238  K+ potassium transporter  52.21 
 
 
651 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.261795  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1122  K potassium transporter  54.34 
 
 
569 aa  592  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3926  K potassium transporter  50.24 
 
 
641 aa  586  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.147688 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0101  K+ potassium transporter  48.29 
 
 
648 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185505  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  47.29 
 
 
632 aa  565  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  46.66 
 
 
626 aa  555  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  47.76 
 
 
653 aa  558  1e-157  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  46.61 
 
 
628 aa  552  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  47.11 
 
 
639 aa  551  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0976  potassium uptake protein, Kup system  47.04 
 
 
626 aa  546  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  45.83 
 
 
631 aa  548  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  46.3 
 
 
631 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  46.03 
 
 
630 aa  546  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  46.05 
 
 
621 aa  545  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2539  K+ potassium transporter  46.25 
 
 
625 aa  545  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  45.7 
 
 
622 aa  543  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  45.25 
 
 
620 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  45.73 
 
 
620 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  46.05 
 
 
620 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  44.98 
 
 
622 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  46.9 
 
 
622 aa  541  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  47.73 
 
 
631 aa  538  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  44.55 
 
 
639 aa  536  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  46.23 
 
 
636 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  46.12 
 
 
620 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  47 
 
 
656 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  46.01 
 
 
627 aa  538  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  46.86 
 
 
628 aa  535  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  45.86 
 
 
622 aa  533  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  45.01 
 
 
628 aa  535  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  44.94 
 
 
628 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  47.64 
 
 
634 aa  535  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  46.08 
 
 
622 aa  533  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  44.52 
 
 
622 aa  529  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  44.65 
 
 
660 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6716  K potassium transporter  44.29 
 
 
641 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19104  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  44.68 
 
 
622 aa  529  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  44.52 
 
 
622 aa  530  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4252  K+ potassium transporter  44.94 
 
 
641 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  44.85 
 
 
630 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  44.85 
 
 
630 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2061  K+ potassium transporter  46.59 
 
 
644 aa  528  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266591  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  44.68 
 
 
622 aa  529  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  44.69 
 
 
630 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1192  K+ potassium transporter  46.73 
 
 
633 aa  527  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1512  K+ potassium transporter  47.63 
 
 
634 aa  528  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  44.62 
 
 
628 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  44.68 
 
 
622 aa  528  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  45.5 
 
 
622 aa  528  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  44.69 
 
 
630 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  44.69 
 
 
630 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  45.1 
 
 
622 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  45.5 
 
 
622 aa  528  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  43.8 
 
 
664 aa  526  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0514546 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4220  potassium uptake protein  43.96 
 
 
622 aa  522  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4247  potassium transport protein Kup  43.96 
 
 
622 aa  522  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1200  Kup system potassium uptake protein  47.8 
 
 
636 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3963  potassium transport protein Kup  43.96 
 
 
622 aa  522  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4115  potassium transport protein Kup  43.96 
 
 
622 aa  522  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.133962 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  44.37 
 
 
660 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03575  hypothetical protein  43.96 
 
 
622 aa  522  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4218  K potassium transporter  47.19 
 
 
636 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.945846  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  44.36 
 
 
647 aa  522  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4117  potassium transport protein Kup  44.28 
 
 
622 aa  524  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0495643 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  43.96 
 
 
622 aa  522  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4594  potassium uptake protein Kup  46.86 
 
 
634 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>