220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4676 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0884  K potassium transporter  54.69 
 
 		 650 aa  747    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4676  K potassium transporter  100 
 
 		 648 aa  1323    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2974  K potassium transporter  70.92 
 
 		 650 aa  958    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3443  K potassium transporter  73.54 
 
 		 646 aa  1031    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6986  K potassium transporter  58.24 
 
 		 661 aa  811    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571387  hitchhiker  0.00000436362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0061  K potassium transporter  52.01 
 
 		 655 aa  712    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3426  low affinity potassium transport system  61.07 
 
 		 655 aa  801    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1235  potassium transporter  47.29 
 
 		 665 aa  646    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000105426  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1046  potassium transporter family protein  46.78 
 
 		 657 aa  635    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000334828  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3467  K potassium transporter  49.54 
 
 		 651 aa  642    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0767221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4780  K+ potassium transporter  58.75 
 
 		 657 aa  786    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2024  K potassium transporter  53.47 
 
 		 650 aa  703    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00348692  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0643  K+ transporter  44.31 
 
 		 673 aa  571  1e-161  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0152538  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1015  K potassium transporter  44.08 
 
 		 760 aa  571  1e-161  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.020253  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1090  potassium uptake protein, putative  46.43 
 
 		 666 aa  559  1e-158  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0153  K+ transporter  44.38 
 
 		 682 aa  549  1e-155  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000510146  unclonable  2.5551699999999998e-27 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0644  K+ transporter  45.69 
 
 		 671 aa  548  1e-154  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00948742  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1011  K+ transporter  39.82 
 
 		 677 aa  509  1e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0760728  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1553  K+ transporter  38.33 
 
 		 834 aa  491  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0403456  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1247  K+ potassium transporter  36.53 
 
 		 877 aa  452  1e-125  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  38.53 
 
 		 636 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  39.03 
 
 		 620 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  37.5 
 
 		 637 aa  355  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  39.21 
 
 		 620 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  37.57 
 
 		 637 aa  349  8e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  38.35 
 
 		 620 aa  346  7e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  36.41 
 
 		 621 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  38.45 
 
 		 630 aa  344  4e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3979  potassium transport protein Kup  36.32 
 
 		 622 aa  343  5e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  43.08 
 
 		 633 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  36.03 
 
 		 622 aa  342  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  43.15 
 
 		 622 aa  342  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  42.86 
 
 		 633 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  35.95 
 
 		 622 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  42.38 
 
 		 627 aa  340  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  35.75 
 
 		 622 aa  340  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  35.75 
 
 		 622 aa  340  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  38.67 
 
 		 622 aa  340  5e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  43.18 
 
 		 622 aa  339  8e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  37.5 
 
 		 620 aa  339  9e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  35.92 
 
 		 624 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  42.47 
 
 		 622 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  42.47 
 
 		 622 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  36.88 
 
 		 639 aa  338  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  36.35 
 
 		 647 aa  337  3.9999999999999995e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0976  potassium uptake protein, Kup system  38.24 
 
 		 626 aa  337  5.999999999999999e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  37.27 
 
 		 656 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5167  K potassium transporter  37.35 
 
 		 655 aa  335  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0763503  normal  0.222033 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  43.19 
 
 		 647 aa  333  5e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  35.78 
 
 		 620 aa  333  5e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1190  hypothetical protein  42.69 
 
 		 624 aa  333  8e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  43.45 
 
 		 622 aa  332  9e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0006  potassium transport protein Kup  35.75 
 
 		 622 aa  332  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0580063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0511  K potassium transporter  36.51 
 
 		 637 aa  332  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  38.01 
 
 		 634 aa  331  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  43.35 
 
 		 651 aa  331  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2282  K potassium transporter  41.65 
 
 		 642 aa  330  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.795196  normal  0.048597 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4218  K potassium transporter  35.62 
 
 		 636 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.945846  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  43.35 
 
 		 651 aa  330  5.0000000000000004e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  34.1 
 
 		 631 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2557  K potassium transporter  41.65 
 
 		 642 aa  330  6e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1596  K potassium transporter  35.62 
 
 		 637 aa  330  6e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286785  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4117  potassium transport protein Kup  35.28 
 
 		 622 aa  329  7e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0495643 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1052  potassium uptake transmembrane protein  37.23 
 
 		 613 aa  329  8e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  35.1 
 
 		 628 aa  329  9e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  43.35 
 
 		 651 aa  329  9e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4277  K potassium transporter  35.95 
 
 		 631 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4387  K potassium transporter  35.95 
 
 		 631 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.635262 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  34.48 
 
 		 631 aa  328  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  34.98 
 
 		 622 aa  327  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2018  Kup system potassium uptake protein  37.09 
 
 		 643 aa  326  7e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4179  potassium transport protein Kup  35.26 
 
 		 622 aa  326  7e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.418392  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03631  potassium transporter  34.4 
 
 		 622 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4220  potassium uptake protein  34.4 
 
 		 622 aa  325  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  42.76 
 
 		 631 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3963  potassium transport protein Kup  34.4 
 
 		 622 aa  325  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  34.4 
 
 		 622 aa  325  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4115  potassium transport protein Kup  34.4 
 
 		 622 aa  325  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133962 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4247  potassium transport protein Kup  34.4 
 
 		 622 aa  325  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03575  hypothetical protein  34.4 
 
 		 622 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4173  potassium transport protein Kup  38.37 
 
 		 622 aa  325  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  41.1 
 
 		 628 aa  325  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  41.44 
 
 		 633 aa  324  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  42.53 
 
 		 628 aa  323  4e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3574  K+ potassium transporter  37.52 
 
 		 640 aa  323  5e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0248596  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1229  K+ potassium transporter  35.65 
 
 		 636 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136519  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0739  K potassium transporter  40.8 
 
 		 647 aa  323  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  37.84 
 
 		 637 aa  323  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  36.19 
 
 		 622 aa  323  8e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  39.21 
 
 		 633 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5183  potassium transport protein Kup  34.22 
 
 		 622 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.594597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4723  K potassium transporter  38.57 
 
 		 640 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0485791 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  40.4 
 
 		 628 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2239  K potassium transporter  38.85 
 
 		 646 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.447875  normal  0.116397 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1372  K potassium transporter  35.52 
 
 		 649 aa  322  9.999999999999999e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.560989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  36.08 
 
 		 661 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1394  K+ potassium transporter  35.67 
 
 		 648 aa  320  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1200  Kup system potassium uptake protein  35.21 
 
 		 636 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  36.51 
 
 		 626 aa  320  7e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0985  K potassium transporter  40.09 
 
 		 680 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>