219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0511 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0739  K potassium transporter  63.83 
 
 
647 aa  781    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0511  K potassium transporter  100 
 
 
637 aa  1254    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2282  K potassium transporter  63.56 
 
 
642 aa  783    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.795196  normal  0.048597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1596  K potassium transporter  79.45 
 
 
637 aa  994    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286785  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5466  K potassium transporter  60.67 
 
 
662 aa  731    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0738492  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2557  K potassium transporter  63.56 
 
 
642 aa  783    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.173587 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2239  K potassium transporter  63.43 
 
 
646 aa  755    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.447875  normal  0.116397 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  50.79 
 
 
631 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  47.73 
 
 
626 aa  571  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  50.8 
 
 
624 aa  571  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  49.19 
 
 
632 aa  571  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  48.22 
 
 
621 aa  558  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  48.72 
 
 
620 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  48.48 
 
 
620 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  48.64 
 
 
620 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6716  K potassium transporter  49.35 
 
 
641 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19104  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  46.69 
 
 
636 aa  553  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  50.48 
 
 
636 aa  554  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4252  K+ potassium transporter  49.44 
 
 
641 aa  554  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  47.76 
 
 
620 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  48.63 
 
 
622 aa  555  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  50.16 
 
 
637 aa  553  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  50.16 
 
 
637 aa  549  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4723  K potassium transporter  48.43 
 
 
640 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0485791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  48.55 
 
 
622 aa  551  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  48.55 
 
 
622 aa  551  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  46.47 
 
 
628 aa  549  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  49.76 
 
 
630 aa  545  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  46.39 
 
 
628 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  47.65 
 
 
656 aa  547  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  47.14 
 
 
627 aa  542  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3513  Kup family low affinity potassium transporter  47.98 
 
 
640 aa  544  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  45.57 
 
 
628 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2539  K+ potassium transporter  47.35 
 
 
625 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  47.26 
 
 
622 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  48.55 
 
 
628 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  47.78 
 
 
647 aa  540  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1753  potassium uptake protein  48.87 
 
 
644 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.909141  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  46.91 
 
 
639 aa  541  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  47.27 
 
 
628 aa  538  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  47.02 
 
 
620 aa  536  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  48.47 
 
 
637 aa  538  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  46.38 
 
 
630 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  46.13 
 
 
622 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  46.38 
 
 
630 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  46.38 
 
 
630 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  46.38 
 
 
622 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1475  K potassium transporter  46.95 
 
 
638 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765149  normal  0.163846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  48.69 
 
 
633 aa  529  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  46.22 
 
 
660 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  46.04 
 
 
660 aa  531  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  47.11 
 
 
634 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  47.33 
 
 
661 aa  531  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  46.22 
 
 
630 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  46.22 
 
 
630 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0985  K potassium transporter  47.48 
 
 
680 aa  530  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  47.51 
 
 
631 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1598  K potassium transporter  48.56 
 
 
633 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  44.87 
 
 
622 aa  528  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  45.32 
 
 
622 aa  528  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  44.79 
 
 
647 aa  526  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1926  K potassium transporter  49.2 
 
 
633 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406918  normal  0.0407314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  47.02 
 
 
631 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5100  K+ transporter  45.71 
 
 
638 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  45.23 
 
 
637 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7401  putative potassium uptake protein Kup  46.83 
 
 
641 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1823  K potassium transporter  45.07 
 
 
638 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0350815  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  45.23 
 
 
637 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6280  K+ potassium transporter  45.31 
 
 
688 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5167  K potassium transporter  46.53 
 
 
655 aa  519  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0763503  normal  0.222033 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1799  K+ potassium transporter  45.07 
 
 
638 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3574  K+ potassium transporter  45.16 
 
 
640 aa  520  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0248596  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  46.05 
 
 
637 aa  520  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1885  K potassium transporter  44.55 
 
 
622 aa  519  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.508127  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3454  Kup family low affinity potassium transporter  46.04 
 
 
611 aa  521  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2547  K potassium transporter  47.42 
 
 
625 aa  521  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  46.71 
 
 
664 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0514546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  46.02 
 
 
634 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  45.76 
 
 
653 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  45 
 
 
637 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0976  potassium uptake protein, Kup system  47.74 
 
 
626 aa  514  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  44.79 
 
 
634 aa  512  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  44.63 
 
 
634 aa  513  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3762  K potassium transporter  47.4 
 
 
650 aa  513  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  44.3 
 
 
622 aa  512  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  44.13 
 
 
622 aa  512  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2061  K+ potassium transporter  45.59 
 
 
644 aa  513  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266591  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2507  K potassium transporter  48.38 
 
 
614 aa  512  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  44.3 
 
 
622 aa  512  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4277  K potassium transporter  46.97 
 
 
631 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1052  potassium uptake transmembrane protein  47 
 
 
613 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4387  K potassium transporter  46.97 
 
 
631 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.635262 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2018  Kup system potassium uptake protein  46.05 
 
 
643 aa  509  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  46.64 
 
 
634 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24540  potassium uptake protein  48.67 
 
 
632 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.465778  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  45.88 
 
 
639 aa  506  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1122  K potassium transporter  49.48 
 
 
569 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  45.41 
 
 
630 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  44.66 
 
 
632 aa  508  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6041  K potassium transporter  45.81 
 
 
633 aa  506  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420233  normal  0.917457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>