219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6041 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1262  K potassium transporter  54.71 
 
 		 643 aa  652    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0285347 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2565  K potassium transporter  68.34 
 
 		 633 aa  820    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  53.74 
 
 		 637 aa  663    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  53.26 
 
 		 651 aa  642    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5050  K potassium transporter  55.77 
 
 		 657 aa  664    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  53.81 
 
 		 634 aa  660    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5357  K potassium transporter  56.56 
 
 		 656 aa  677    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00124872  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1238  K+ potassium transporter  53.4 
 
 		 651 aa  642    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.261795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0927  potassium uptake protein  68.37 
 
 		 634 aa  859    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137865  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2327  K potassium transporter  54.86 
 
 		 658 aa  659    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163546 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4765  K potassium transporter  52.99 
 
 		 652 aa  659    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.266428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  54.05 
 
 		 630 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  54.09 
 
 		 634 aa  666    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1497  K+ potassium transporter  54.13 
 
 		 666 aa  646    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  53.66 
 
 		 636 aa  659    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1596  K potassium transporter  53.7 
 
 		 668 aa  652    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.0938769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1877  K potassium transporter  53.7 
 
 		 668 aa  652    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.119842  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  53.74 
 
 		 637 aa  654    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0508  K potassium transporter  68.62 
 
 		 632 aa  889    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0551  K potassium transporter  68.46 
 
 		 632 aa  885    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3932  K potassium transporter  54.75 
 
 		 672 aa  665    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0963001  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  53.69 
 
 		 632 aa  653    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3513  Kup family low affinity potassium transporter  56.89 
 
 		 640 aa  682    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  53.71 
 
 		 637 aa  652    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  53.09 
 
 		 651 aa  640    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6041  K potassium transporter  100 
 
 		 633 aa  1274    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420233  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6370  K potassium transporter  86.41 
 
 		 633 aa  1098    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0444  K potassium transporter  72.51 
 
 		 630 aa  913    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0753432 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2252  K potassium transporter  69.32 
 
 		 633 aa  842    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  53.59 
 
 		 651 aa  647    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1643  K potassium transporter  53.86 
 
 		 670 aa  654    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2222  K potassium transporter  54.14 
 
 		 629 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.569984  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  51.63 
 
 		 633 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  51.79 
 
 		 633 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  52.12 
 
 		 633 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1122  K potassium transporter  54.69 
 
 		 569 aa  624  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3926  K potassium transporter  51.5 
 
 		 641 aa  617  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147688 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  49.12 
 
 		 653 aa  591  1e-167  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0101  K+ potassium transporter  50.8 
 
 		 648 aa  588  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  47.73 
 
 		 632 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  47.55 
 
 		 624 aa  570  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  47.15 
 
 		 627 aa  570  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  46.1 
 
 		 621 aa  565  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  48.47 
 
 		 639 aa  565  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  47.1 
 
 		 630 aa  559  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1512  K+ potassium transporter  49.52 
 
 		 634 aa  560  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  46.86 
 
 		 622 aa  560  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  46.54 
 
 		 622 aa  560  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  47.98 
 
 		 622 aa  559  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  46.2 
 
 		 626 aa  558  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  47.16 
 
 		 620 aa  558  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  47.37 
 
 		 656 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  47.17 
 
 		 622 aa  556  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  47.27 
 
 		 631 aa  551  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0976  potassium uptake protein, Kup system  48.63 
 
 		 626 aa  554  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  46.13 
 
 		 622 aa  554  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  45.93 
 
 		 636 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  46.85 
 
 		 622 aa  550  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  46.85 
 
 		 622 aa  550  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  45.97 
 
 		 628 aa  549  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  45.71 
 
 		 620 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  46.66 
 
 		 620 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  44.88 
 
 		 664 aa  542  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0514546 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  46.04 
 
 		 647 aa  542  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  45.98 
 
 		 631 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  44.69 
 
 		 628 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  46.75 
 
 		 639 aa  539  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  45.66 
 
 		 631 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  45.16 
 
 		 628 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2539  K+ potassium transporter  44.5 
 
 		 625 aa  536  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  44.46 
 
 		 628 aa  537  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  44.57 
 
 		 620 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  43.99 
 
 		 622 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  44.27 
 
 		 630 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  44.57 
 
 		 620 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1394  K+ potassium transporter  45.47 
 
 		 648 aa  532  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  44.27 
 
 		 630 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  44.27 
 
 		 630 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  44.11 
 
 		 630 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  44.11 
 
 		 630 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  44.98 
 
 		 622 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4117  potassium transport protein Kup  43.43 
 
 		 622 aa  535  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0495643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2061  K+ potassium transporter  46.47 
 
 		 644 aa  535  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  43.99 
 
 		 622 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03631  potassium transporter  42.95 
 
 		 622 aa  528  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4220  potassium uptake protein  42.95 
 
 		 622 aa  528  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5183  potassium transport protein Kup  42.95 
 
 		 622 aa  529  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.594597 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  42.95 
 
 		 622 aa  528  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  44.11 
 
 		 660 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  44.2 
 
 		 660 aa  529  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03575  hypothetical protein  42.95 
 
 		 622 aa  528  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6716  K potassium transporter  43.01 
 
 		 641 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4247  potassium transport protein Kup  42.95 
 
 		 622 aa  528  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  45.48 
 
 		 647 aa  529  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4115  potassium transport protein Kup  42.95 
 
 		 622 aa  528  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133962 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3963  potassium transport protein Kup  42.95 
 
 		 622 aa  528  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  43.99 
 
 		 628 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  44.15 
 
 		 637 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  43.9 
 
 		 622 aa  525  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4173  potassium transport protein Kup  42.95 
 
 		 622 aa  528  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>