219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5868 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2222  K potassium transporter  54.75 
 
 
629 aa  643    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.569984  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  100 
 
 
633 aa  1266    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  58.39 
 
 
651 aa  735    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3932  K potassium transporter  53.4 
 
 
672 aa  657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0963001  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5357  K potassium transporter  54.72 
 
 
656 aa  659    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00124872  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  55.28 
 
 
630 aa  685    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1497  K+ potassium transporter  53.57 
 
 
666 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1262  K potassium transporter  52.46 
 
 
643 aa  650    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0285347 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0927  potassium uptake protein  56.15 
 
 
634 aa  664    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137865  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  87.52 
 
 
633 aa  1127    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  95.58 
 
 
633 aa  1211    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  54.91 
 
 
632 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3513  Kup family low affinity potassium transporter  55.07 
 
 
640 aa  668    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5050  K potassium transporter  55.04 
 
 
657 aa  640    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992645 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  58.39 
 
 
651 aa  736    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0508  K potassium transporter  53.21 
 
 
632 aa  673    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845054  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0444  K potassium transporter  53.41 
 
 
630 aa  662    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0753432 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  58.43 
 
 
651 aa  743    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0551  K potassium transporter  53.76 
 
 
632 aa  679    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  50.08 
 
 
634 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2327  K potassium transporter  51.94 
 
 
658 aa  630  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163546 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4765  K potassium transporter  50.39 
 
 
652 aa  631  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.266428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2252  K potassium transporter  52.39 
 
 
633 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1238  K+ potassium transporter  53.41 
 
 
651 aa  625  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.261795  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1877  K potassium transporter  51.83 
 
 
668 aa  618  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.119842  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  50.08 
 
 
634 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2565  K potassium transporter  53.31 
 
 
633 aa  616  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1596  K potassium transporter  51.83 
 
 
668 aa  618  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.0938769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1643  K potassium transporter  51.67 
 
 
670 aa  617  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6041  K potassium transporter  51.79 
 
 
633 aa  617  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420233  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  51.2 
 
 
637 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6370  K potassium transporter  50.81 
 
 
633 aa  608  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649313  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  49.52 
 
 
626 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  48.48 
 
 
621 aa  595  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  50.08 
 
 
637 aa  593  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  49.76 
 
 
637 aa  594  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0101  K+ potassium transporter  50.16 
 
 
648 aa  594  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185505  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  48.46 
 
 
636 aa  587  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  47.04 
 
 
628 aa  586  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  49.6 
 
 
636 aa  587  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  48.08 
 
 
620 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  47.2 
 
 
628 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  47.28 
 
 
620 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  47.02 
 
 
630 aa  581  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  49.11 
 
 
656 aa  579  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  48.47 
 
 
620 aa  580  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  46.98 
 
 
628 aa  578  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  45.26 
 
 
628 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  47.44 
 
 
620 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3926  K potassium transporter  49.51 
 
 
641 aa  570  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.147688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  46.96 
 
 
620 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  49.76 
 
 
631 aa  567  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  45.87 
 
 
627 aa  566  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  45.18 
 
 
622 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0976  potassium uptake protein, Kup system  48.04 
 
 
626 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  47.99 
 
 
639 aa  564  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  46.09 
 
 
631 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  45.06 
 
 
630 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  44.76 
 
 
660 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  45.81 
 
 
622 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  45.02 
 
 
622 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  45.06 
 
 
630 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  45.06 
 
 
630 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  45.06 
 
 
630 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  45.06 
 
 
630 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  44.83 
 
 
637 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  46.08 
 
 
628 aa  560  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1475  K potassium transporter  45.09 
 
 
638 aa  558  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765149  normal  0.163846 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3979  potassium transport protein Kup  45.5 
 
 
622 aa  560  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  44.59 
 
 
660 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  44.83 
 
 
637 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  45.93 
 
 
639 aa  559  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  45.98 
 
 
622 aa  561  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  45.41 
 
 
622 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1823  K potassium transporter  45.13 
 
 
638 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0350815  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  45.93 
 
 
631 aa  557  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5100  K+ transporter  44.93 
 
 
638 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  44.97 
 
 
632 aa  556  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6280  K+ potassium transporter  45.13 
 
 
688 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  47.48 
 
 
634 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1799  K+ potassium transporter  45.13 
 
 
638 aa  558  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  45.41 
 
 
622 aa  555  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4594  potassium uptake protein Kup  47.33 
 
 
634 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  47.98 
 
 
624 aa  554  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  46.2 
 
 
622 aa  552  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4179  potassium transport protein Kup  45.28 
 
 
622 aa  553  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.418392  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  46.47 
 
 
647 aa  555  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0141  K+ potassium transporter  48.81 
 
 
630 aa  554  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4173  potassium transport protein Kup  45.07 
 
 
622 aa  552  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  46.55 
 
 
647 aa  555  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4220  potassium uptake protein  45.07 
 
 
622 aa  551  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4247  potassium transport protein Kup  45.07 
 
 
622 aa  551  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  47.1 
 
 
633 aa  551  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6716  K potassium transporter  44.97 
 
 
641 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19104  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  44.44 
 
 
622 aa  548  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3963  potassium transport protein Kup  45.07 
 
 
622 aa  551  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0006  potassium transport protein Kup  45.4 
 
 
622 aa  550  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0580063  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  45.07 
 
 
622 aa  551  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4115  potassium transport protein Kup  45.07 
 
 
622 aa  551  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.133962 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  45.4 
 
 
622 aa  551  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>