219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0101 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1512  K+ potassium transporter  61.43 
 
 		 634 aa  726    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0101  K+ potassium transporter  100 
 
 		 648 aa  1296    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  51.63 
 
 		 630 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1262  K potassium transporter  52.32 
 
 		 643 aa  625  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0285347 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0508  K potassium transporter  49.69 
 
 		 632 aa  624  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3513  Kup family low affinity potassium transporter  54.23 
 
 		 640 aa  624  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4765  K potassium transporter  50.7 
 
 		 652 aa  620  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.266428 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0551  K potassium transporter  49.22 
 
 		 632 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3932  K potassium transporter  50.7 
 
 		 672 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0963001  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  50.39 
 
 		 633 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0444  K potassium transporter  50.87 
 
 		 630 aa  607  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0753432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5357  K potassium transporter  52.79 
 
 		 656 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00124872  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  49.92 
 
 		 633 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  51.98 
 
 		 632 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  50.47 
 
 		 651 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  50.16 
 
 		 633 aa  601  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  49.76 
 
 		 651 aa  599  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  49.76 
 
 		 651 aa  597  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2327  K potassium transporter  51.47 
 
 		 658 aa  597  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163546 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0927  potassium uptake protein  51.25 
 
 		 634 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1643  K potassium transporter  49.61 
 
 		 670 aa  586  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2222  K potassium transporter  50.24 
 
 		 629 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.569984  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1596  K potassium transporter  49.45 
 
 		 668 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.0938769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1877  K potassium transporter  49.45 
 
 		 668 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.119842  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5050  K potassium transporter  52.63 
 
 		 657 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3926  K potassium transporter  51.55 
 
 		 641 aa  584  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147688 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6041  K potassium transporter  50.8 
 
 		 633 aa  580  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420233  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1238  K+ potassium transporter  50.7 
 
 		 651 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.261795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2252  K potassium transporter  48.29 
 
 		 633 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  48.81 
 
 		 636 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  47.92 
 
 		 634 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  47.81 
 
 		 634 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2565  K potassium transporter  48.82 
 
 		 633 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  48.46 
 
 		 637 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1497  K+ potassium transporter  51.03 
 
 		 666 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  48.28 
 
 		 630 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  48.5 
 
 		 626 aa  560  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  47.09 
 
 		 656 aa  561  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  47.85 
 
 		 637 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  48.28 
 
 		 630 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  48.28 
 
 		 630 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  48.12 
 
 		 630 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  48.12 
 
 		 630 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  48.58 
 
 		 622 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6370  K potassium transporter  48.41 
 
 		 633 aa  560  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  47 
 
 		 628 aa  555  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1823  K potassium transporter  48.5 
 
 		 638 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0350815  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  49.92 
 
 		 624 aa  558  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  48.12 
 
 		 660 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5100  K+ transporter  47.85 
 
 		 638 aa  557  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  48.03 
 
 		 628 aa  558  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1799  K+ potassium transporter  48.5 
 
 		 638 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  47.71 
 
 		 637 aa  556  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  48.52 
 
 		 637 aa  552  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1475  K potassium transporter  48.11 
 
 		 638 aa  555  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765149  normal  0.163846 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  47.26 
 
 		 628 aa  554  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  47.97 
 
 		 660 aa  555  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6280  K+ potassium transporter  48.5 
 
 		 688 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  48.99 
 
 		 637 aa  551  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  48.89 
 
 		 636 aa  548  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  46.61 
 
 		 622 aa  545  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  45.81 
 
 		 628 aa  548  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  47.59 
 
 		 630 aa  542  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  45.68 
 
 		 647 aa  543  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  47.54 
 
 		 631 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  46.98 
 
 		 620 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  45.53 
 
 		 627 aa  541  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  45.31 
 
 		 632 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  46.7 
 
 		 620 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  47.45 
 
 		 653 aa  538  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  45.91 
 
 		 620 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  46.59 
 
 		 639 aa  535  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  44.43 
 
 		 639 aa  535  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  46.1 
 
 		 620 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2061  K+ potassium transporter  47.32 
 
 		 644 aa  533  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  43.82 
 
 		 622 aa  529  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  44.41 
 
 		 622 aa  531  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  45.27 
 
 		 622 aa  532  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  45.77 
 
 		 622 aa  531  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  45.77 
 
 		 622 aa  531  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  47.93 
 
 		 614 aa  528  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  45.79 
 
 		 631 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  45.63 
 
 		 631 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  47.09 
 
 		 620 aa  527  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  43.94 
 
 		 622 aa  528  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0976  potassium uptake protein, Kup system  46.01 
 
 		 626 aa  523  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  45.31 
 
 		 634 aa  525  1e-147  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  45.31 
 
 		 634 aa  525  1e-147  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  46.37 
 
 		 633 aa  521  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  45.66 
 
 		 621 aa  521  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2539  K+ potassium transporter  44.41 
 
 		 625 aa  520  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4252  K+ potassium transporter  45.2 
 
 		 641 aa  518  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1926  K potassium transporter  46.74 
 
 		 633 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406918  normal  0.0407314 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  46.68 
 
 		 664 aa  521  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0514546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3454  Kup family low affinity potassium transporter  46.1 
 
 		 611 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  44.18 
 
 		 628 aa  519  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  43.43 
 
 		 661 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1598  K potassium transporter  46.1 
 
 		 633 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1122  K potassium transporter  48.64 
 
 		 569 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2018  Kup system potassium uptake protein  44.65 
 
 		 643 aa  510  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.36441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>