219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3574 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  53.81 
 
 
631 aa  657    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1007  K potassium transporter  54.17 
 
 
671 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1010  K potassium transporter  54.34 
 
 
671 aa  637    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0949  K+ potassium transporter  54.83 
 
 
670 aa  643    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.986532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  61.07 
 
 
661 aa  803    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3574  K+ potassium transporter  100 
 
 
640 aa  1296    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0248596  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0985  K potassium transporter  58.16 
 
 
680 aa  749    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333179 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0989  K potassium transporter  54.96 
 
 
663 aa  633  1e-180  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00318249  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  51.15 
 
 
630 aa  625  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  51.38 
 
 
626 aa  627  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  48.43 
 
 
637 aa  620  1e-176  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  49.92 
 
 
637 aa  618  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2018  Kup system potassium uptake protein  49.51 
 
 
643 aa  609  1e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  48.78 
 
 
620 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  48.94 
 
 
620 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  48.72 
 
 
624 aa  599  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  49.27 
 
 
632 aa  600  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  48.94 
 
 
620 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1725  Kup system potassium uptake protein  49.09 
 
 
620 aa  597  1e-169  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00153025  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  48.53 
 
 
620 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0976  potassium uptake protein, Kup system  50.32 
 
 
626 aa  592  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2771  K potassium transporter  48.86 
 
 
637 aa  593  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  48.63 
 
 
636 aa  594  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  47.72 
 
 
631 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  47.56 
 
 
621 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  47.26 
 
 
634 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  47.29 
 
 
627 aa  583  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  47.39 
 
 
631 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  48.46 
 
 
628 aa  581  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  48.29 
 
 
630 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  48.29 
 
 
628 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  48.29 
 
 
660 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  48.45 
 
 
660 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24540  potassium uptake protein  49.35 
 
 
632 aa  578  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.465778  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  47.43 
 
 
628 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  47.57 
 
 
637 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  48.29 
 
 
630 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  48.29 
 
 
630 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  48.29 
 
 
630 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  48.29 
 
 
630 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  49.51 
 
 
622 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  48.68 
 
 
633 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  47.48 
 
 
647 aa  574  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1823  K potassium transporter  47.74 
 
 
638 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0350815  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  47.26 
 
 
637 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  47.39 
 
 
633 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1799  K+ potassium transporter  47.74 
 
 
638 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2061  K+ potassium transporter  48.36 
 
 
644 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266591  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  45.57 
 
 
622 aa  570  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5100  K+ transporter  47.59 
 
 
638 aa  572  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  46.79 
 
 
639 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6280  K+ potassium transporter  47.74 
 
 
688 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  47.72 
 
 
622 aa  571  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1475  K potassium transporter  48.62 
 
 
638 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765149  normal  0.163846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4594  potassium uptake protein Kup  46.95 
 
 
634 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1753  potassium uptake protein  47.43 
 
 
644 aa  568  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.909141  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  46.12 
 
 
622 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  47.5 
 
 
656 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  46.34 
 
 
633 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  46.12 
 
 
622 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  44.94 
 
 
622 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  46.42 
 
 
622 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1926  K potassium transporter  49.43 
 
 
633 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406918  normal  0.0407314 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  47.67 
 
 
653 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  46.91 
 
 
622 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  45.81 
 
 
622 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  47.23 
 
 
622 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  47.23 
 
 
622 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4117  potassium transport protein Kup  46.83 
 
 
622 aa  561  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0495643 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1598  K potassium transporter  48.32 
 
 
633 aa  561  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0006  potassium transport protein Kup  46.5 
 
 
622 aa  561  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0580063  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  46.12 
 
 
622 aa  561  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  46.58 
 
 
628 aa  560  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  45.85 
 
 
633 aa  561  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1394  K+ potassium transporter  44.18 
 
 
648 aa  556  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  46.25 
 
 
622 aa  558  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  45.97 
 
 
620 aa  556  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  44.43 
 
 
647 aa  556  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03631  potassium transporter  44.46 
 
 
622 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4220  potassium uptake protein  44.46 
 
 
622 aa  553  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  44.46 
 
 
622 aa  553  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  46.35 
 
 
651 aa  552  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3979  potassium transport protein Kup  44.62 
 
 
622 aa  551  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03575  hypothetical protein  44.46 
 
 
622 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4247  potassium transport protein Kup  44.46 
 
 
622 aa  553  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5183  potassium transport protein Kup  44.46 
 
 
622 aa  554  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.594597 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3963  potassium transport protein Kup  44.46 
 
 
622 aa  553  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4115  potassium transport protein Kup  44.46 
 
 
622 aa  553  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.133962 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  46.35 
 
 
651 aa  553  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4173  potassium transport protein Kup  44.46 
 
 
622 aa  553  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  44.78 
 
 
651 aa  553  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4213  potassium transport protein Kup  45.57 
 
 
622 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.681675  normal  0.819116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6716  K potassium transporter  46.07 
 
 
641 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19104  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4163  potassium transport protein Kup  45.57 
 
 
622 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.134372  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4272  potassium transport protein Kup  45.57 
 
 
622 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.461844  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1596  K potassium transporter  46.56 
 
 
637 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286785  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4092  potassium transport protein Kup  45.57 
 
 
622 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3115  K potassium transporter  46.45 
 
 
629 aa  550  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0980834 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4107  potassium transport protein Kup  45.57 
 
 
622 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382302  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4387  K potassium transporter  45.44 
 
 
631 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.635262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>