219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp1052 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  64.51 
 
 		 633 aa  809    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1052  potassium uptake transmembrane protein  100 
 
 		 613 aa  1226    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  59.48 
 
 		 630 aa  758    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1823  K potassium transporter  58.99 
 
 		 638 aa  757    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0350815  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  65.09 
 
 		 636 aa  833    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  53.18 
 
 		 624 aa  645    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  59.31 
 
 		 660 aa  756    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5100  K+ transporter  58.99 
 
 		 638 aa  754    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4387  K potassium transporter  89.23 
 
 		 631 aa  1059    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.635262 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  52.45 
 
 		 632 aa  651    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  59.15 
 
 		 660 aa  754    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  51.47 
 
 		 622 aa  645    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  52.29 
 
 		 622 aa  640    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  60.95 
 
 		 628 aa  774    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1926  K potassium transporter  64.44 
 
 		 633 aa  794    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406918  normal  0.0407314 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  63.95 
 
 		 656 aa  815    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6280  K+ potassium transporter  58.99 
 
 		 688 aa  756    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  58.99 
 
 		 637 aa  753    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  61.11 
 
 		 628 aa  777    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  59.15 
 
 		 637 aa  756    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1799  K+ potassium transporter  58.99 
 
 		 638 aa  757    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  51.31 
 
 		 622 aa  639    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  59.48 
 
 		 630 aa  758    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  59.48 
 
 		 630 aa  758    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  59.31 
 
 		 630 aa  757    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  59.31 
 
 		 630 aa  757    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  59.48 
 
 		 622 aa  757    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  59.05 
 
 		 647 aa  763    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1475  K potassium transporter  58.99 
 
 		 638 aa  757    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765149  normal  0.163846 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1598  K potassium transporter  64.27 
 
 		 633 aa  796    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  59.97 
 
 		 628 aa  766    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4277  K potassium transporter  89.23 
 
 		 631 aa  1059    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  52.78 
 
 		 622 aa  633  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  51.63 
 
 		 622 aa  631  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  51.31 
 
 		 626 aa  630  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  51.22 
 
 		 620 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  53.1 
 
 		 622 aa  629  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  51.62 
 
 		 639 aa  628  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  53.1 
 
 		 622 aa  629  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03631  potassium transporter  51.14 
 
 		 622 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4220  potassium uptake protein  51.14 
 
 		 622 aa  623  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  51.14 
 
 		 622 aa  623  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4173  potassium transport protein Kup  51.14 
 
 		 622 aa  622  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5183  potassium transport protein Kup  50.98 
 
 		 622 aa  622  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.594597 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  51.82 
 
 		 630 aa  623  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4723  K potassium transporter  51.97 
 
 		 640 aa  624  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0485791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  51.55 
 
 		 620 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  50.82 
 
 		 627 aa  625  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3963  potassium transport protein Kup  51.14 
 
 		 622 aa  623  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4115  potassium transport protein Kup  51.14 
 
 		 622 aa  623  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133962 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4247  potassium transport protein Kup  51.14 
 
 		 622 aa  623  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03575  hypothetical protein  51.14 
 
 		 622 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  51.63 
 
 		 622 aa  621  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  50.41 
 
 		 639 aa  620  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2507  K potassium transporter  52.68 
 
 		 614 aa  620  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  50.73 
 
 		 620 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  53.67 
 
 		 614 aa  618  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  51.63 
 
 		 622 aa  621  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4213  potassium transport protein Kup  51.47 
 
 		 622 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.681675  normal  0.819116 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  50.57 
 
 		 634 aa  618  1e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4092  potassium transport protein Kup  51.47 
 
 		 622 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6716  K potassium transporter  51.22 
 
 		 641 aa  617  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4272  potassium transport protein Kup  51.47 
 
 		 622 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.461844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4107  potassium transport protein Kup  51.47 
 
 		 622 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382302  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  51.22 
 
 		 620 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4163  potassium transport protein Kup  51.47 
 
 		 622 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.134372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  50.24 
 
 		 631 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  50.57 
 
 		 634 aa  613  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0006  potassium transport protein Kup  51.47 
 
 		 622 aa  614  9.999999999999999e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0580063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4117  potassium transport protein Kup  50.33 
 
 		 622 aa  614  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0495643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  51.3 
 
 		 631 aa  609  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  51.79 
 
 		 631 aa  609  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  50.89 
 
 		 621 aa  608  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  48.37 
 
 		 637 aa  609  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  51.38 
 
 		 628 aa  610  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  49.35 
 
 		 622 aa  606  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  50.65 
 
 		 628 aa  606  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  50.24 
 
 		 622 aa  605  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  49.35 
 
 		 622 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3979  potassium transport protein Kup  49.51 
 
 		 622 aa  600  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  46.56 
 
 		 637 aa  595  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4179  potassium transport protein Kup  49.67 
 
 		 622 aa  595  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.418392  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24540  potassium uptake protein  53.25 
 
 		 632 aa  592  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.465778  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1725  Kup system potassium uptake protein  48.19 
 
 		 620 aa  589  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00153025  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1753  potassium uptake protein  49.92 
 
 		 644 aa  588  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.909141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  52.53 
 
 		 634 aa  589  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2771  K potassium transporter  48.53 
 
 		 637 aa  585  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2539  K+ potassium transporter  50.49 
 
 		 625 aa  587  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3454  Kup family low affinity potassium transporter  48.71 
 
 		 611 aa  585  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4594  potassium uptake protein Kup  52.2 
 
 		 634 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1394  K+ potassium transporter  47.64 
 
 		 648 aa  583  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4252  K+ potassium transporter  51.62 
 
 		 641 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  48.94 
 
 		 620 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2018  Kup system potassium uptake protein  47.06 
 
 		 643 aa  579  1e-164  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1262  K potassium transporter  47.8 
 
 		 643 aa  580  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0285347 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  47.13 
 
 		 647 aa  581  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2061  K+ potassium transporter  48.85 
 
 		 644 aa  579  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1192  K+ potassium transporter  52.2 
 
 		 633 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4765  K potassium transporter  47.73 
 
 		 652 aa  569  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.266428 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  47.75 
 
 		 653 aa  572  1e-161  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>