220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0061 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6986  K potassium transporter  52.01 
 
 
661 aa  706    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571387  hitchhiker  0.00000436362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4676  K potassium transporter  52.01 
 
 
648 aa  712    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3443  K potassium transporter  54.74 
 
 
646 aa  735    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0884  K potassium transporter  51.62 
 
 
650 aa  694    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.011338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0061  K potassium transporter  100 
 
 
655 aa  1327    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3426  low affinity potassium transport system  53.15 
 
 
655 aa  688    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3467  K potassium transporter  53.26 
 
 
651 aa  664    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0767221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4780  K+ potassium transporter  52.52 
 
 
657 aa  698    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2974  K potassium transporter  54.94 
 
 
650 aa  704    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2024  K potassium transporter  48.17 
 
 
650 aa  606  9.999999999999999e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00348692  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1235  potassium transporter  44.44 
 
 
665 aa  580  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000105426  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1046  potassium transporter family protein  44.82 
 
 
657 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000334828  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0643  K+ transporter  44.31 
 
 
673 aa  559  1e-158  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0152538  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0153  K+ transporter  42.9 
 
 
682 aa  524  1e-147  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000510146  unclonable  2.5551699999999998e-27 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0644  K+ transporter  43.61 
 
 
671 aa  521  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00948742  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1090  potassium uptake protein, putative  42.66 
 
 
666 aa  513  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1011  K+ transporter  40.81 
 
 
677 aa  501  1e-140  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0760728  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1015  K potassium transporter  39.43 
 
 
760 aa  489  1e-137  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.020253  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1553  K+ transporter  37.86 
 
 
834 aa  444  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0403456  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1247  K+ potassium transporter  36.83 
 
 
877 aa  423  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801309 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  38.8 
 
 
631 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  38.62 
 
 
631 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3454  Kup family low affinity potassium transporter  39.13 
 
 
611 aa  334  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1596  K potassium transporter  38.63 
 
 
637 aa  333  6e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286785  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  41.26 
 
 
621 aa  332  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  35.69 
 
 
647 aa  331  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  37.22 
 
 
628 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2547  K potassium transporter  37.25 
 
 
625 aa  328  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  36.6 
 
 
628 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1372  K potassium transporter  39.65 
 
 
649 aa  325  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.560989  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0976  potassium uptake protein, Kup system  40.73 
 
 
626 aa  325  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  42.33 
 
 
622 aa  324  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  42.33 
 
 
622 aa  324  3e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1331  potassium uptake protein  38.08 
 
 
630 aa  323  6e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00641911  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1820  potassium uptake protein  38.08 
 
 
630 aa  323  6e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0076  potassium uptake protein  38.08 
 
 
630 aa  323  6e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210813  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2341  kup system potassium uptake protein  38.01 
 
 
660 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.357755  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2175  potassium uptake protein  37.91 
 
 
630 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2213  potassium uptake protein  37.91 
 
 
630 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  41.81 
 
 
624 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  36.32 
 
 
622 aa  320  5e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  37.46 
 
 
636 aa  320  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2247  potassium uptake protein  38.18 
 
 
660 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0511  K potassium transporter  37.35 
 
 
637 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5100  K+ transporter  37.76 
 
 
638 aa  318  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  39.09 
 
 
620 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  35.78 
 
 
647 aa  317  3e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  36.38 
 
 
620 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  37.54 
 
 
656 aa  317  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3979  potassium transport protein Kup  36.98 
 
 
622 aa  317  4e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4117  potassium transport protein Kup  36.95 
 
 
622 aa  317  4e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0495643 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6280  K+ potassium transporter  37.41 
 
 
688 aa  317  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1092  potassium uptake protein  38.1 
 
 
622 aa  317  6e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0884975  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  39.29 
 
 
620 aa  316  7e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  36.53 
 
 
630 aa  316  8e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  36.81 
 
 
637 aa  316  8e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1475  K potassium transporter  38.27 
 
 
638 aa  316  8e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765149  normal  0.163846 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1799  K+ potassium transporter  37.41 
 
 
638 aa  316  9e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1823  K potassium transporter  37.41 
 
 
638 aa  316  9e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0350815  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1710  K potassium transporter  37.16 
 
 
637 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00353606  normal  0.989137 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  37.36 
 
 
651 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  36.58 
 
 
622 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  37.18 
 
 
651 aa  314  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  38.99 
 
 
634 aa  314  3.9999999999999997e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1737  K+ potassium transporter  37.33 
 
 
637 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  39.63 
 
 
637 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  39.2 
 
 
634 aa  313  4.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  37.48 
 
 
651 aa  313  5.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4218  K potassium transporter  39.41 
 
 
636 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.945846  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  38.67 
 
 
620 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  42.63 
 
 
634 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2507  K potassium transporter  38.1 
 
 
614 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4092  potassium transport protein Kup  36.95 
 
 
622 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4107  potassium transport protein Kup  36.95 
 
 
622 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382302  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  37.64 
 
 
626 aa  311  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  40.94 
 
 
627 aa  312  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4163  potassium transport protein Kup  36.95 
 
 
622 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.134372  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  39.96 
 
 
614 aa  311  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  36.3 
 
 
622 aa  311  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4213  potassium transport protein Kup  36.95 
 
 
622 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.681675  normal  0.819116 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4272  potassium transport protein Kup  36.95 
 
 
622 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.461844  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  38.8 
 
 
639 aa  310  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  36.26 
 
 
622 aa  310  5e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03631  potassium transporter  36.3 
 
 
622 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4220  potassium uptake protein  36.3 
 
 
622 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3963  potassium transport protein Kup  36.3 
 
 
622 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4247  potassium transport protein Kup  36.3 
 
 
622 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  36.3 
 
 
622 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03575  hypothetical protein  36.3 
 
 
622 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4115  potassium transport protein Kup  36.3 
 
 
622 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.133962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7401  putative potassium uptake protein Kup  37.06 
 
 
641 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  36.2 
 
 
632 aa  310  8e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  36.92 
 
 
637 aa  309  8e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2446  hypothetical protein  40.79 
 
 
629 aa  309  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5183  potassium transport protein Kup  36.3 
 
 
622 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.594597 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4173  potassium transport protein Kup  36.3 
 
 
622 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  34.72 
 
 
620 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  38.68 
 
 
664 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0514546 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1885  K potassium transporter  37.34 
 
 
622 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.508127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  43.46 
 
 
631 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>