220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1015 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1015  K potassium transporter  100 
 
 		 760 aa  1559    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.020253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1247  K+ potassium transporter  48.29 
 
 		 877 aa  673    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801309 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1235  potassium transporter  51.59 
 
 		 665 aa  708    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000105426  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1046  potassium transporter family protein  51.7 
 
 		 657 aa  698    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000334828  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0643  K+ transporter  51.26 
 
 		 673 aa  667    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0152538  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0153  K+ transporter  49.93 
 
 		 682 aa  679    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000510146  unclonable  2.5551699999999998e-27 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1553  K+ transporter  48.95 
 
 		 834 aa  692    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0403456  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0644  K+ transporter  51.11 
 
 		 671 aa  633  1e-180  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00948742  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2024  K potassium transporter  47.69 
 
 		 650 aa  616  1e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00348692  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1090  potassium uptake protein, putative  48.29 
 
 		 666 aa  610  1e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1011  K+ transporter  47.35 
 
 		 677 aa  596  1e-169  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0760728  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6986  K potassium transporter  43.58 
 
 		 661 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571387  hitchhiker  0.00000436362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4676  K potassium transporter  44.69 
 
 		 648 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0884  K potassium transporter  44.31 
 
 		 650 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3443  K potassium transporter  43.58 
 
 		 646 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2974  K potassium transporter  43.6 
 
 		 650 aa  558  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4780  K+ potassium transporter  40.93 
 
 		 657 aa  535  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3426  low affinity potassium transport system  39.49 
 
 		 655 aa  510  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0061  K potassium transporter  40 
 
 		 655 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3467  K potassium transporter  38.59 
 
 		 651 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0767221 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1341  K+ transporter  49.19 
 
 		 454 aa  428  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  36.75 
 
 		 633 aa  324  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0444  K potassium transporter  39.6 
 
 		 630 aa  323  8e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0753432 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  36.48 
 
 		 633 aa  321  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  39.08 
 
 		 651 aa  320  6e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2018  Kup system potassium uptake protein  36.91 
 
 		 643 aa  320  6e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3454  Kup family low affinity potassium transporter  42.41 
 
 		 611 aa  319  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  38.77 
 
 		 633 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  38.88 
 
 		 651 aa  318  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0985  K potassium transporter  38.87 
 
 		 680 aa  318  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  37.98 
 
 		 636 aa  318  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2547  K potassium transporter  41 
 
 		 625 aa  317  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  36.56 
 
 		 637 aa  317  4e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  38.43 
 
 		 651 aa  317  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  38.31 
 
 		 656 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  36.46 
 
 		 637 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  41.13 
 
 		 647 aa  315  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  35.71 
 
 		 631 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2446  hypothetical protein  39.67 
 
 		 629 aa  314  4.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  35.24 
 
 		 631 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2302  hypothetical protein  39.88 
 
 		 629 aa  312  2e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1885  K potassium transporter  39.53 
 
 		 622 aa  312  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.508127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5167  K potassium transporter  36.43 
 
 		 655 aa  309  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0763503  normal  0.222033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  35.77 
 
 		 620 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  33.23 
 
 		 661 aa  308  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  35.13 
 
 		 634 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  34.14 
 
 		 630 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  36.11 
 
 		 647 aa  305  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4765  K potassium transporter  37.22 
 
 		 652 aa  304  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.266428 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  35.86 
 
 		 630 aa  304  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  35.98 
 
 		 632 aa  304  5.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  34.63 
 
 		 632 aa  304  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1725  Kup system potassium uptake protein  37.3 
 
 		 620 aa  303  8.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00153025  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  36.7 
 
 		 637 aa  303  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  37.3 
 
 		 624 aa  301  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4594  potassium uptake protein Kup  34.62 
 
 		 634 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2282  K potassium transporter  36.36 
 
 		 642 aa  301  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.795196  normal  0.048597 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6370  K potassium transporter  34.01 
 
 		 633 aa  300  7e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  35.04 
 
 		 639 aa  300  8e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2557  K potassium transporter  36.17 
 
 		 642 aa  299  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0508  K potassium transporter  36.29 
 
 		 632 aa  300  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0551  K potassium transporter  36.29 
 
 		 632 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  39.21 
 
 		 637 aa  298  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  35.36 
 
 		 620 aa  298  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  41.28 
 
 		 614 aa  298  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0927  potassium uptake protein  33.96 
 
 		 634 aa  297  5e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137865  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  35.75 
 
 		 664 aa  297  5e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0514546 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  36.12 
 
 		 633 aa  297  6e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  37.52 
 
 		 636 aa  296  8e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1192  K+ potassium transporter  36.84 
 
 		 633 aa  296  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  34.22 
 
 		 628 aa  296  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  35.31 
 
 		 620 aa  296  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  37.17 
 
 		 639 aa  296  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1007  K potassium transporter  40.41 
 
 		 671 aa  294  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1596  K potassium transporter  32.83 
 
 		 637 aa  293  6e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286785  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0949  K+ potassium transporter  40.18 
 
 		 670 aa  293  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.986532  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  38.12 
 
 		 634 aa  293  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1372  K potassium transporter  34.44 
 
 		 649 aa  293  9e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.560989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1010  K potassium transporter  40.41 
 
 		 671 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6041  K potassium transporter  33.73 
 
 		 633 aa  292  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420233  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  37.61 
 
 		 626 aa  291  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1262  K potassium transporter  39.3 
 
 		 643 aa  291  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0285347 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4723  K potassium transporter  36.33 
 
 		 640 aa  291  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0485791 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  38.01 
 
 		 631 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0511  K potassium transporter  37.53 
 
 		 637 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317674 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1190  hypothetical protein  36.24 
 
 		 624 aa  290  7e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24540  potassium uptake protein  33.72 
 
 		 632 aa  290  7e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.465778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2771  K potassium transporter  36.8 
 
 		 637 aa  290  7e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  38.9 
 
 		 637 aa  289  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  34.82 
 
 		 620 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2222  K potassium transporter  36.19 
 
 		 629 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.569984  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7401  putative potassium uptake protein Kup  39.87 
 
 		 641 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0989  K potassium transporter  35.15 
 
 		 663 aa  289  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00318249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3762  K potassium transporter  37.85 
 
 		 650 aa  288  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2239  K potassium transporter  36.29 
 
 		 646 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.447875  normal  0.116397 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  38.57 
 
 		 622 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1598  K potassium transporter  35.52 
 
 		 633 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.357667 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1753  potassium uptake protein  35.45 
 
 		 644 aa  287  5e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.909141  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2327  K potassium transporter  39.82 
 
 		 658 aa  287  5.999999999999999e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163546 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0141  K+ potassium transporter  39.58 
 
 		 630 aa  287  5.999999999999999e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>