220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0884 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0884  K potassium transporter  100 
 
 
650 aa  1311    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.011338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3443  K potassium transporter  55.78 
 
 
646 aa  767    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2974  K potassium transporter  56.75 
 
 
650 aa  754    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0061  K potassium transporter  51.62 
 
 
655 aa  694    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685026 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2024  K potassium transporter  48.54 
 
 
650 aa  635    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00348692  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4676  K potassium transporter  54.69 
 
 
648 aa  747    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3426  low affinity potassium transport system  57.73 
 
 
655 aa  768    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4780  K+ potassium transporter  54.56 
 
 
657 aa  735    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6986  K potassium transporter  57.8 
 
 
661 aa  786    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571387  hitchhiker  0.00000436362 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1046  potassium transporter family protein  49.54 
 
 
657 aa  629  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000334828  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1235  potassium transporter  48.95 
 
 
665 aa  627  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000105426  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3467  K potassium transporter  46.06 
 
 
651 aa  600  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0767221 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0643  K+ transporter  44.76 
 
 
673 aa  578  1.0000000000000001e-163  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0152538  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0153  K+ transporter  47.09 
 
 
682 aa  577  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000510146  unclonable  2.5551699999999998e-27 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1090  potassium uptake protein, putative  46.36 
 
 
666 aa  565  1.0000000000000001e-159  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0644  K+ transporter  45.31 
 
 
671 aa  559  1e-158  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00948742  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1015  K potassium transporter  44.06 
 
 
760 aa  558  1e-157  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.020253  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1011  K+ transporter  41.41 
 
 
677 aa  506  9.999999999999999e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0760728  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1553  K+ transporter  40.18 
 
 
834 aa  502  1e-140  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0403456  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1247  K+ potassium transporter  39.73 
 
 
877 aa  492  9.999999999999999e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801309 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  42.59 
 
 
637 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  42.18 
 
 
637 aa  343  8e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  42.27 
 
 
636 aa  343  8e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  45.33 
 
 
636 aa  339  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  39.39 
 
 
637 aa  332  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  40.41 
 
 
633 aa  331  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  40.88 
 
 
633 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  44.74 
 
 
656 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  40.96 
 
 
633 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  39.56 
 
 
637 aa  326  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  40.43 
 
 
647 aa  325  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1341  K+ transporter  38.75 
 
 
454 aa  325  2e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  36.91 
 
 
631 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  36.64 
 
 
634 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0508  K potassium transporter  36.21 
 
 
632 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845054  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  38.53 
 
 
620 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1885  K potassium transporter  38.92 
 
 
622 aa  322  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.508127  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0444  K potassium transporter  40.92 
 
 
630 aa  322  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0753432 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  41.4 
 
 
631 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  38.08 
 
 
621 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0551  K potassium transporter  35.88 
 
 
632 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1596  K potassium transporter  36.36 
 
 
637 aa  320  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286785  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0511  K potassium transporter  36.2 
 
 
637 aa  320  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317674 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  38.76 
 
 
637 aa  320  6e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  40.26 
 
 
647 aa  319  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  40.31 
 
 
634 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  41.41 
 
 
651 aa  318  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  40.69 
 
 
651 aa  318  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  39.02 
 
 
661 aa  318  3e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  40.69 
 
 
651 aa  317  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  35.6 
 
 
664 aa  317  6e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0514546 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  41.18 
 
 
624 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  34.81 
 
 
630 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3762  K potassium transporter  38.36 
 
 
650 aa  315  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2547  K potassium transporter  37.93 
 
 
625 aa  315  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0985  K potassium transporter  37.5 
 
 
680 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5167  K potassium transporter  36.04 
 
 
655 aa  312  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0763503  normal  0.222033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  36.23 
 
 
620 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1372  K potassium transporter  36.03 
 
 
649 aa  312  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.560989  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4020  K potassium transporter  37.31 
 
 
640 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0241257  normal  0.195504 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  40.99 
 
 
628 aa  311  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3454  Kup family low affinity potassium transporter  39.46 
 
 
611 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2018  Kup system potassium uptake protein  39.18 
 
 
643 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  37.07 
 
 
620 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1621  potassium uptake transmembrane protein  40.34 
 
 
633 aa  309  9e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  42.05 
 
 
634 aa  309  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  42.05 
 
 
634 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  36.04 
 
 
620 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  39.91 
 
 
622 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2539  K+ potassium transporter  36.61 
 
 
625 aa  308  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2528  K potassium transporter  39.18 
 
 
628 aa  308  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00494923  hitchhiker  0.0000000660434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  38.34 
 
 
639 aa  307  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0739  K potassium transporter  40.05 
 
 
647 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  40.44 
 
 
622 aa  306  7e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  40.34 
 
 
614 aa  306  8.000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  40.93 
 
 
631 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0976  potassium uptake protein, Kup system  36.81 
 
 
626 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1190  hypothetical protein  41.19 
 
 
624 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2507  K potassium transporter  40.36 
 
 
614 aa  306  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  38.39 
 
 
630 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1407  K potassium transporter  41.12 
 
 
628 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.196511  decreased coverage  0.0000000731332 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  39.33 
 
 
628 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1608  KUP family K(+) transporter  38.56 
 
 
628 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  37.69 
 
 
622 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  37.69 
 
 
622 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1262  K potassium transporter  36.55 
 
 
643 aa  303  5.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0285347 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  37.45 
 
 
622 aa  303  6.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  39.09 
 
 
639 aa  303  7.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  36.02 
 
 
634 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  39.11 
 
 
622 aa  303  9e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  37.66 
 
 
622 aa  303  9e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3926  K potassium transporter  38.1 
 
 
641 aa  302  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.147688 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3979  potassium transport protein Kup  35.25 
 
 
622 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2557  K potassium transporter  39.78 
 
 
642 aa  301  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.173587 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1122  K potassium transporter  40.98 
 
 
569 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  39.77 
 
 
622 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  39.77 
 
 
622 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4594  potassium uptake protein Kup  40.98 
 
 
634 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2282  K potassium transporter  39.07 
 
 
642 aa  301  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.795196  normal  0.048597 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4179  potassium transport protein Kup  35.19 
 
 
622 aa  301  4e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.418392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>