220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2974 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4676  K potassium transporter  70.92 
 
 		 648 aa  977    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2974  K potassium transporter  100 
 
 		 650 aa  1325    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6986  K potassium transporter  58.8 
 
 		 661 aa  827    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571387  hitchhiker  0.00000436362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3443  K potassium transporter  70.77 
 
 		 646 aa  965    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0061  K potassium transporter  54.94 
 
 		 655 aa  724    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3426  low affinity potassium transport system  61.31 
 
 		 655 aa  797    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1235  potassium transporter  47.73 
 
 		 665 aa  651    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000105426  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1046  potassium transporter family protein  47.77 
 
 		 657 aa  643    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000334828  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2024  K potassium transporter  52.76 
 
 		 650 aa  699    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00348692  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4780  K+ potassium transporter  60.28 
 
 		 657 aa  804    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0884  K potassium transporter  56.75 
 
 		 650 aa  769    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.011338 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3467  K potassium transporter  49.84 
 
 		 651 aa  626  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0767221 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0643  K+ transporter  46.3 
 
 		 673 aa  594  1e-168  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0152538  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1015  K potassium transporter  43.68 
 
 		 760 aa  568  1e-161  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.020253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0153  K+ transporter  44.89 
 
 		 682 aa  568  1e-160  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000510146  unclonable  2.5551699999999998e-27 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0644  K+ transporter  46.11 
 
 		 671 aa  556  1e-157  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00948742  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1090  potassium uptake protein, putative  43.6 
 
 		 666 aa  539  9.999999999999999e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1011  K+ transporter  40.36 
 
 		 677 aa  501  1e-140  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0760728  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1553  K+ transporter  39.69 
 
 		 834 aa  496  1e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0403456  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1247  K+ potassium transporter  38.33 
 
 		 877 aa  464  1e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801309 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  38.7 
 
 		 637 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  40.16 
 
 		 633 aa  337  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  46.12 
 
 		 636 aa  336  7.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  39.13 
 
 		 621 aa  335  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  40.86 
 
 		 633 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  41.08 
 
 		 633 aa  332  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1341  K+ transporter  42.26 
 
 		 454 aa  329  8e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  35.34 
 
 		 664 aa  329  9e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0514546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  38.28 
 
 		 622 aa  329  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  44.32 
 
 		 647 aa  328  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  38.7 
 
 		 628 aa  327  5e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  42.44 
 
 		 647 aa  326  1e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0976  potassium uptake protein, Kup system  39.11 
 
 		 626 aa  325  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  38.07 
 
 		 630 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  44.37 
 
 		 656 aa  325  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  41.03 
 
 		 637 aa  324  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  36.65 
 
 		 622 aa  323  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  37.14 
 
 		 622 aa  323  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  42.89 
 
 		 651 aa  323  7e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  37.14 
 
 		 622 aa  323  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1190  hypothetical protein  40.88 
 
 		 624 aa  322  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  41.7 
 
 		 624 aa  322  9.999999999999999e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  40.62 
 
 		 661 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  36.65 
 
 		 622 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0739  K potassium transporter  38.97 
 
 		 647 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  40.4 
 
 		 637 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2018  Kup system potassium uptake protein  38.17 
 
 		 643 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  36.45 
 
 		 622 aa  320  6e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  34.8 
 
 		 620 aa  320  7e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  43.68 
 
 		 651 aa  319  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  43.68 
 
 		 651 aa  318  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  42.76 
 
 		 627 aa  318  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1394  K+ potassium transporter  35.18 
 
 		 648 aa  317  6e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  36.63 
 
 		 622 aa  317  6e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1596  K potassium transporter  36.64 
 
 		 637 aa  316  8e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286785  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  36.6 
 
 		 622 aa  316  9e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  42.79 
 
 		 620 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  36.88 
 
 		 622 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  36.88 
 
 		 622 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0444  K potassium transporter  40.13 
 
 		 630 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0753432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1372  K potassium transporter  35.96 
 
 		 649 aa  314  2.9999999999999996e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.560989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  40.87 
 
 		 626 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0006  potassium transport protein Kup  37.31 
 
 		 622 aa  314  2.9999999999999996e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0580063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4117  potassium transport protein Kup  36.56 
 
 		 622 aa  314  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0495643 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3979  potassium transport protein Kup  35.16 
 
 		 622 aa  313  5.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  36.18 
 
 		 628 aa  313  9e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  36.43 
 
 		 630 aa  312  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  42.07 
 
 		 620 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  39.61 
 
 		 639 aa  312  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  42.32 
 
 		 634 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  38.03 
 
 		 614 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  42.19 
 
 		 632 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1052  potassium uptake transmembrane protein  38.5 
 
 		 613 aa  310  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  37.25 
 
 		 632 aa  310  5e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03631  potassium transporter  35.88 
 
 		 622 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4220  potassium uptake protein  35.88 
 
 		 622 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3963  potassium transport protein Kup  35.88 
 
 		 622 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4247  potassium transport protein Kup  35.88 
 
 		 622 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  35.88 
 
 		 622 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4115  potassium transport protein Kup  35.88 
 
 		 622 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133962 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03575  hypothetical protein  35.88 
 
 		 622 aa  310  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4179  potassium transport protein Kup  35.97 
 
 		 622 aa  310  8e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.418392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  41.06 
 
 		 622 aa  310  8e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4387  K potassium transporter  37.67 
 
 		 631 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.635262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  35.62 
 
 		 631 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4173  potassium transport protein Kup  39.71 
 
 		 622 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4277  K potassium transporter  37.67 
 
 		 631 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  35.21 
 
 		 631 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  42.53 
 
 		 620 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  42.41 
 
 		 622 aa  308  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0949  K+ potassium transporter  45.45 
 
 		 670 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.986532  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2282  K potassium transporter  40.07 
 
 		 642 aa  307  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.795196  normal  0.048597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2557  K potassium transporter  39.64 
 
 		 642 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173587 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2064  hypothetical protein  35.21 
 
 		 625 aa  306  5.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2054  hypothetical protein  35.31 
 
 		 624 aa  306  5.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0985  K potassium transporter  40.66 
 
 		 680 aa  307  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0511  K potassium transporter  36.43 
 
 		 637 aa  306  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  42.73 
 
 		 631 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0508  K potassium transporter  34.92 
 
 		 632 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  41.57 
 
 		 620 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>