220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0643 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1015  K potassium transporter  51.56 
 
 
760 aa  656    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.020253  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1090  potassium uptake protein, putative  63.09 
 
 
666 aa  836    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00180767  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1235  potassium transporter  53.75 
 
 
665 aa  709    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000105426  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1046  potassium transporter family protein  54.73 
 
 
657 aa  708    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000334828  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0643  K+ transporter  100 
 
 
673 aa  1372    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0152538  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0644  K+ transporter  73.23 
 
 
671 aa  990    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00948742  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0153  K+ transporter  51.66 
 
 
682 aa  679    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000510146  unclonable  2.5551699999999998e-27 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2024  K potassium transporter  48.48 
 
 
650 aa  624  1e-177  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00348692  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6986  K potassium transporter  46.9 
 
 
661 aa  607  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.571387  hitchhiker  0.00000436362 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1553  K+ transporter  44.94 
 
 
834 aa  588  1e-167  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0403456  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1011  K+ transporter  46.91 
 
 
677 aa  592  1e-167  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0760728  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0884  K potassium transporter  44.76 
 
 
650 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.011338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2974  K potassium transporter  46.3 
 
 
650 aa  575  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3443  K potassium transporter  45.6 
 
 
646 aa  569  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4676  K potassium transporter  44.31 
 
 
648 aa  571  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0061  K potassium transporter  44.31 
 
 
655 aa  559  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3426  low affinity potassium transport system  44.39 
 
 
655 aa  557  1e-157  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1247  K+ potassium transporter  42.71 
 
 
877 aa  548  1e-154  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801309 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4780  K+ potassium transporter  43.82 
 
 
657 aa  538  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3467  K potassium transporter  41.73 
 
 
651 aa  486  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0767221 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1341  K+ transporter  45.96 
 
 
454 aa  374  1e-102  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  38.22 
 
 
636 aa  320  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3454  Kup family low affinity potassium transporter  37.08 
 
 
611 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  42.6 
 
 
633 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  42.16 
 
 
633 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  37.06 
 
 
651 aa  313  7.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2018  Kup system potassium uptake protein  38.01 
 
 
643 aa  312  1e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  38.51 
 
 
647 aa  310  6.999999999999999e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  40.58 
 
 
651 aa  309  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  36.98 
 
 
630 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1885  K potassium transporter  40.18 
 
 
622 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.508127  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  36.9 
 
 
651 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1857  K potassium transporter  35.62 
 
 
637 aa  307  5.0000000000000004e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000427943  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  39.6 
 
 
633 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  35.08 
 
 
631 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2547  K potassium transporter  37.25 
 
 
625 aa  301  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1596  K potassium transporter  35.09 
 
 
637 aa  301  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286785  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  34.83 
 
 
664 aa  300  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0514546 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  34.9 
 
 
631 aa  300  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1725  Kup system potassium uptake protein  38.1 
 
 
620 aa  299  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00153025  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  34.81 
 
 
630 aa  298  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  35.05 
 
 
647 aa  298  3e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2446  hypothetical protein  39.8 
 
 
629 aa  297  4e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4594  potassium uptake protein Kup  34.39 
 
 
634 aa  297  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  38.68 
 
 
634 aa  296  6e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  34.75 
 
 
634 aa  296  9e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  35.36 
 
 
621 aa  295  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  36.17 
 
 
620 aa  296  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1643  K potassium transporter  35.97 
 
 
670 aa  295  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  36.33 
 
 
637 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0511  K potassium transporter  34.21 
 
 
637 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317674 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  39.26 
 
 
622 aa  295  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2302  hypothetical protein  37.12 
 
 
629 aa  295  3e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  35.98 
 
 
637 aa  294  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  38.68 
 
 
634 aa  294  5e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  35.17 
 
 
622 aa  293  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  35.89 
 
 
636 aa  293  5e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  35.17 
 
 
622 aa  293  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  38.95 
 
 
614 aa  292  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  38.83 
 
 
622 aa  292  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3926  K potassium transporter  32.93 
 
 
641 aa  291  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.147688 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1372  K potassium transporter  34.25 
 
 
649 aa  291  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.560989  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2771  K potassium transporter  37.2 
 
 
637 aa  291  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  34.98 
 
 
620 aa  291  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  36.44 
 
 
622 aa  290  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1596  K potassium transporter  35.08 
 
 
668 aa  290  7e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.0938769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1877  K potassium transporter  35.08 
 
 
668 aa  290  7e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.119842  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  36.11 
 
 
637 aa  290  8e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  35.32 
 
 
620 aa  289  9e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03631  potassium transporter  37.81 
 
 
622 aa  289  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4220  potassium uptake protein  37.81 
 
 
622 aa  289  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0508  K potassium transporter  34.11 
 
 
632 aa  289  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845054  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4247  potassium transport protein Kup  37.81 
 
 
622 aa  289  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4115  potassium transport protein Kup  37.81 
 
 
622 aa  289  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.133962 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4263  potassium transport protein Kup  37.81 
 
 
622 aa  289  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.704108  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03575  hypothetical protein  37.81 
 
 
622 aa  289  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3963  potassium transport protein Kup  37.81 
 
 
622 aa  289  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4173  potassium transport protein Kup  37.81 
 
 
622 aa  289  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3491  potassium uptake protein Kup  38.05 
 
 
603 aa  288  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177309  normal  0.248816 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  34.77 
 
 
620 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5183  potassium transport protein Kup  37.81 
 
 
622 aa  288  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.594597 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  38.92 
 
 
631 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1190  hypothetical protein  35.13 
 
 
624 aa  288  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  35.42 
 
 
637 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4117  potassium transport protein Kup  38.49 
 
 
622 aa  287  5e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0495643 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4179  potassium transport protein Kup  37.15 
 
 
622 aa  287  5.999999999999999e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.418392  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3979  potassium transport protein Kup  38.04 
 
 
622 aa  286  7e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0006  potassium transport protein Kup  35.17 
 
 
622 aa  286  7e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0580063  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1192  K+ potassium transporter  35.78 
 
 
633 aa  286  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  36.63 
 
 
634 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  37.34 
 
 
661 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  36.67 
 
 
656 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1262  K potassium transporter  35.2 
 
 
643 aa  285  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0285347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  34.43 
 
 
628 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2252  K potassium transporter  35.41 
 
 
633 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  33.15 
 
 
620 aa  284  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5167  K potassium transporter  32.7 
 
 
655 aa  283  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0763503  normal  0.222033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3932  K potassium transporter  35.38 
 
 
672 aa  284  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0963001  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0141  K+ potassium transporter  35.28 
 
 
630 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0551  K potassium transporter  33.09 
 
 
632 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>