More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0287 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0287  histidine kinase  100 
 
 		 148 aa  305  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_93  sensor histidine kinase  83.76 
 
 		 759 aa  197  3e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1303  adaptive-response sensory kinase  45.16 
 
 		 391 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1331  adaptive-response sensory kinase  45.16 
 
 		 391 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00234976 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5063  adaptive-response sensory kinase  46.28 
 
 		 393 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4050  adaptive-response sensory kinase  45.9 
 
 		 412 aa  117  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588748  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44 
 
 		 827 aa  112  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1431  sensory box sensor histidine kinase  45.67 
 
 		 392 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0609  histidine kinase  44.26 
 
 		 395 aa  107  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  40 
 
 		 581 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0751  adaptive-response sensory kinase  40.98 
 
 		 383 aa  107  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.994211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0691  adaptive-response sensory kinase  41.73 
 
 		 387 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1321  sensor histidine kinase  44.35 
 
 		 377 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1539  sensory box sensor histidine kinase  44.09 
 
 		 392 aa  105  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2114  adaptive-response sensory kinase  40.16 
 
 		 387 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160696  normal  0.364338 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3171  adaptive-response sensory kinase  40.16 
 
 		 401 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.109214 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  39.17 
 
 		 581 aa  103  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0674  adaptive-response sensory kinase  37.69 
 
 		 381 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.384044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 556 aa  102  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 556 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15071  adaptive-response sensory kinase  37.69 
 
 		 381 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1915  adaptive-response sensory kinase  39.34 
 
 		 411 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.608744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 581 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 718 aa  101  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 379 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 379 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 379 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 		 944 aa  100  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 365 aa  100  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 		 473 aa  100  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09431  adaptive-response sensory kinase  38.52 
 
 		 370 aa  100  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.146733 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  40.32 
 
 		 617 aa  100  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 408 aa  100  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  47.71 
 
 		 1070 aa  100  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0233  sensory box sensor histidine kinase  38.39 
 
 		 607 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.373916  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 		 1042 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 695 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1308  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 894 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.455977  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11111  adaptive-response sensory kinase  36.07 
 
 		 370 aa  98.2  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.344093  normal  0.711736 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 3470 aa  97.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  39.02 
 
 		 1118 aa  97.4  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 901 aa  97.4  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 2783 aa  97.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 906 aa  97.4  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  39.66 
 
 		 346 aa  96.7  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 		 581 aa  95.9  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 885 aa  96.7  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 546 aa  96.3  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 		 911 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 458 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 1039 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  36.43 
 
 		 391 aa  95.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 725 aa  95.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 395 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1776  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 		 710 aa  94.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.548217  normal  0.563692 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 593 aa  94.4  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 489 aa  94.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 763 aa  94  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 612 aa  94  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2814  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 		 763 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.155467  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 594 aa  93.6  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  44.04 
 
 		 1070 aa  93.6  8e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2189  histidine kinase  36.84 
 
 		 482 aa  93.6  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 884 aa  93.6  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 905 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 590 aa  93.2  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3302  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 763 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 		 687 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 519 aa  92.8  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 478 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.699413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 		 853 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 394 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  38.98 
 
 		 729 aa  92  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 		 969 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 		 637 aa  92  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0937  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 534 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0830916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 677 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  40.71 
 
 		 486 aa  91.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11671  adaptive-response sensory kinase  36.07 
 
 		 372 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.27 
 
 		 662 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0301  sensory box sensor histidine kinase  37.39 
 
 		 426 aa  91.3  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2634  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 451 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0932991  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 		 722 aa  91.3  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 530 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 394 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0025  histidine kinase  38.02 
 
 		 147 aa  91.3  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000104347  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5235  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 757 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  36.89 
 
 		 903 aa  90.9  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  40.54 
 
 		 1046 aa  90.9  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 701 aa  90.5  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 718 aa  90.9  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4186  histidine kinase  38.66 
 
 		 526 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3865  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 420 aa  90.5  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 754 aa  90.5  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1213  sensor histidine kinase KdpD  39.67 
 
 		 900 aa  90.5  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1354  sensor histidine kinase  34.13 
 
 		 426 aa  90.1  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 418 aa  90.1  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 592 aa  90.1  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0123  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 433 aa  90.1  9e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2720  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 407 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>