More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2251 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2251  (Uracil-5)-methyltransferase  100 
 
 		 550 aa  1115    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000149323  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  38.24 
 
 		 479 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  35.63 
 
 		 468 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  33.94 
 
 		 457 aa  246  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  31.87 
 
 		 488 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  30.92 
 
 		 471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  27.49 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  28.76 
 
 		 453 aa  205  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  29.86 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2258  RNA methyltransferase, TrmA family  26.91 
 
 		 456 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0702589  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0643  RNA methyltransferase, TrmA family  25.38 
 
 		 466 aa  184  3e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2370  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  26.49 
 
 		 451 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2082  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  26.89 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  24.36 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  24.5 
 
 		 446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  29.66 
 
 		 482 aa  179  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  24.55 
 
 		 454 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  27.81 
 
 		 480 aa  178  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  25.82 
 
 		 460 aa  177  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  25.82 
 
 		 458 aa  177  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  25.82 
 
 		 458 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  25.82 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  25.82 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  25.82 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  25.82 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  25.82 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  27.1 
 
 		 476 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  24.63 
 
 		 460 aa  174  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  30.88 
 
 		 495 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  30.59 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  27.49 
 
 		 470 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  28.16 
 
 		 572 aa  171  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1355  RNA methyltransferase  26.12 
 
 		 463 aa  170  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.547923  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06020  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.54 
 
 		 444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.14779  hitchhiker  0.000000000313227 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  29.27 
 
 		 493 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  24.36 
 
 		 459 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  28.02 
 
 		 447 aa  167  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  24.26 
 
 		 448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  24.23 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  23.98 
 
 		 451 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  24.55 
 
 		 457 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  27.78 
 
 		 488 aa  161  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  29.02 
 
 		 476 aa  160  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  25.65 
 
 		 439 aa  160  6e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  29.2 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  25.38 
 
 		 481 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  21.52 
 
 		 456 aa  157  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  24.9 
 
 		 439 aa  155  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  21.92 
 
 		 435 aa  153  7e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  24.47 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  22.12 
 
 		 453 aa  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  22.12 
 
 		 453 aa  151  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1077  RNA methyltransferase, TrmA family  24.8 
 
 		 465 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000901811  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  25.18 
 
 		 489 aa  150  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  23.59 
 
 		 455 aa  150  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0406  RNA methyltransferase  24.34 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.59395  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  23.25 
 
 		 446 aa  149  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  25.99 
 
 		 460 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4802  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  26.36 
 
 		 485 aa  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.810738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  23 
 
 		 455 aa  147  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1371  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  24.53 
 
 		 462 aa  147  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000610222  hitchhiker  0.00000000411743 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  23.06 
 
 		 470 aa  147  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  23.24 
 
 		 470 aa  147  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  24.09 
 
 		 453 aa  144  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  21.86 
 
 		 468 aa  144  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1248  RNA methyltransferase, TrmA family  27.53 
 
 		 461 aa  142  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  24.23 
 
 		 450 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  24.36 
 
 		 451 aa  141  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0994  RNA methyltransferase, TrmA family  24.02 
 
 		 457 aa  140  7.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0862  RNA methyltransferase, TrmA family  25.66 
 
 		 472 aa  139  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  22.3 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  34.02 
 
 		 458 aa  135  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0089  RNA methyltransferase  24.21 
 
 		 468 aa  129  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000133484  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  37.79 
 
 		 436 aa  128  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  26.29 
 
 		 457 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  24.16 
 
 		 458 aa  128  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  35 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  37.43 
 
 		 460 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  23.17 
 
 		 496 aa  126  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  37.1 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  26.34 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  37.63 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.1 
 
 		 459 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  37.1 
 
 		 459 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  37.1 
 
 		 459 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  37.1 
 
 		 459 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  37.1 
 
 		 459 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.1 
 
 		 459 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  24.85 
 
 		 485 aa  124  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  37.1 
 
 		 459 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.1 
 
 		 459 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  25.27 
 
 		 401 aa  124  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.368035  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  22.77 
 
 		 464 aa  123  7e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  38.92 
 
 		 477 aa  121  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  32.63 
 
 		 466 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3894  (Uracil-5)-methyltransferase  27.79 
 
 		 407 aa  120  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1354  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  22.98 
 
 		 456 aa  120  7e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.452487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  23.39 
 
 		 554 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  36.04 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0413  RNA methyltransferase  35.83 
 
 		 451 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>