277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1947 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1947  basic membrane lipoprotein  100 
 
 
371 aa  748    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0213337  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  36.45 
 
 
346 aa  238  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  31.18 
 
 
358 aa  199  9e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  29.62 
 
 
354 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  30.29 
 
 
342 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  30.56 
 
 
356 aa  155  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  29.45 
 
 
346 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  29.11 
 
 
340 aa  143  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  26.72 
 
 
340 aa  140  3e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  29.65 
 
 
347 aa  138  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  27.35 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  27.81 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3654  basic membrane lipoprotein  28.71 
 
 
334 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624388 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0915  basic membrane lipoprotein  27.51 
 
 
331 aa  134  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  28.05 
 
 
356 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  30.03 
 
 
337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  29.25 
 
 
338 aa  129  8.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  27.97 
 
 
341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  28.15 
 
 
713 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  24.63 
 
 
357 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  28.57 
 
 
386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  29.91 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  27.69 
 
 
382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1007  basic membrane protein A  26.03 
 
 
365 aa  117  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  31.17 
 
 
353 aa  116  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0904  basic membrane lipoprotein  27.13 
 
 
330 aa  116  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.701286  normal  0.455123 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  28.7 
 
 
354 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  29.37 
 
 
327 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2598  basic membrane lipoprotein  24.86 
 
 
349 aa  115  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.640676  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  29.05 
 
 
368 aa  113  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  30.19 
 
 
334 aa  113  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  28.57 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  26.09 
 
 
389 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.24 
 
 
331 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  28.24 
 
 
331 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  24.92 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  30.19 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  24.44 
 
 
355 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  27.83 
 
 
366 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  25.16 
 
 
339 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  28.03 
 
 
360 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  26.77 
 
 
330 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  24.3 
 
 
330 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  30.35 
 
 
332 aa  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  25.99 
 
 
329 aa  106  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3016  basic membrane lipoprotein  28.41 
 
 
322 aa  107  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143404  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0676  basic membrane lipoprotein  31.11 
 
 
334 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.748754  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  28.51 
 
 
330 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  28.29 
 
 
330 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  28.41 
 
 
328 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  27.91 
 
 
330 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  26.98 
 
 
358 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  23.37 
 
 
363 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  23.93 
 
 
361 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  26.78 
 
 
334 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  25.14 
 
 
363 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  28.35 
 
 
334 aa  99.4  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  25.18 
 
 
358 aa  99  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  28.52 
 
 
347 aa  99  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  29.03 
 
 
359 aa  98.6  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  29.03 
 
 
359 aa  98.6  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1516  Bmp family lipoprotein  26.1 
 
 
356 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.46456  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1320  basic membrane lipoprotein  26.56 
 
 
356 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.281006 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1832  Bmp family lipoprotein  26.03 
 
 
370 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0726704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  24.56 
 
 
358 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  26.76 
 
 
366 aa  97.1  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  23.42 
 
 
355 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  23.42 
 
 
355 aa  96.7  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  23.42 
 
 
355 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  23.42 
 
 
355 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  22.96 
 
 
358 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  23.72 
 
 
355 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  24.31 
 
 
355 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  23.42 
 
 
355 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  26 
 
 
356 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  26.85 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  25.48 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0635  basic membrane lipoprotein  31.07 
 
 
352 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635986  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  27.73 
 
 
329 aa  93.6  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  26.52 
 
 
380 aa  92.8  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  26.89 
 
 
368 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25760  nucleoside-binding protein  25.53 
 
 
365 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.415143 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0824  basic membrane lipoprotein  25.65 
 
 
358 aa  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  0.688054 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  25.93 
 
 
351 aa  91.7  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1631  basic membrane lipoprotein  25.9 
 
 
356 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0120157 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1552  membrane lipoprotein tmpc precursor  25.34 
 
 
370 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0275006  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3919  basic membrane lipoprotein  29.71 
 
 
566 aa  90.9  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.308906  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0437  ABC transporter periplasmic protein  30.33 
 
 
351 aa  90.5  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  26.97 
 
 
365 aa  90.1  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  26.64 
 
 
407 aa  89.7  7e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0951  putative lipoprotein  27.38 
 
 
348 aa  88.6  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0989  twin-arginine translocation pathway signal  28.17 
 
 
349 aa  88.6  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4403  basic membrane lipoprotein  28.84 
 
 
348 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  27.39 
 
 
330 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  26.12 
 
 
366 aa  88.2  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2769  basic membrane lipoprotein  25 
 
 
342 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  25.87 
 
 
413 aa  86.7  6e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1625  basic membrane lipoprotein  25.9 
 
 
353 aa  85.5  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.140044  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0387  basic membrane protein D (bmpD)  23.29 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0701  basic membrane lipoprotein  26.22 
 
 
364 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.842971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>