246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0951 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0951  putative lipoprotein  100 
 
 
348 aa  704    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0324  exported protein  30.15 
 
 
350 aa  145  1e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000722005  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0915  basic membrane lipoprotein  33.19 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  29.54 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3654  basic membrane lipoprotein  27.57 
 
 
334 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624388 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4441  basic membrane lipoprotein  29.38 
 
 
368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0481892  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  27.53 
 
 
346 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0010  Bmp family lipoprotein  29.66 
 
 
368 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0007  Bmp family lipoprotein  29.66 
 
 
368 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0635  basic membrane lipoprotein  28.26 
 
 
352 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635986  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  26.11 
 
 
354 aa  105  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  26.93 
 
 
358 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  26.76 
 
 
357 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  27.73 
 
 
342 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  26.59 
 
 
337 aa  97.1  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  24.5 
 
 
340 aa  96.7  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  25.1 
 
 
351 aa  95.9  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0904  basic membrane lipoprotein  27.13 
 
 
330 aa  93.2  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.701286  normal  0.455123 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  25.69 
 
 
356 aa  89.4  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  26.77 
 
 
347 aa  87.4  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  24.06 
 
 
338 aa  87.8  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  26.03 
 
 
329 aa  86.3  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  25 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  24.93 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  23.01 
 
 
341 aa  82.8  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  25.24 
 
 
347 aa  82.8  0.000000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  24.16 
 
 
340 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  23.49 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1947  basic membrane lipoprotein  26.19 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0213337  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  25.09 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  28.16 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  27.17 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  25.39 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  26.38 
 
 
339 aa  77  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  26.92 
 
 
334 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  27.17 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  26.02 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  23.83 
 
 
335 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  25.54 
 
 
363 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  22.26 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  25.84 
 
 
334 aa  75.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  28.99 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  27.6 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  25.61 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  26.81 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  26.81 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  26.81 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  26.81 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  26.29 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  26.86 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0676  basic membrane lipoprotein  28.07 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.748754  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2598  basic membrane lipoprotein  28.3 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.640676  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  25.27 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  28.08 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2121  basic membrane lipoprotein  28.69 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.27 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  27.27 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  29.22 
 
 
351 aa  72  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  27.35 
 
 
382 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0295  basic membrane lipoprotein  25.09 
 
 
377 aa  72  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000188211  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3016  basic membrane lipoprotein  24.77 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143404  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  28.08 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  26.59 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25760  nucleoside-binding protein  24.19 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.21832  normal  0.415143 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  25.42 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0824  basic membrane lipoprotein  24.52 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.585027  normal  0.688054 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  26.19 
 
 
361 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  22.77 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21280  nucleoside-binding protein  23.16 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2501  basic membrane lipoprotein  25.76 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403436  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3989  twin-arginine translocation pathway signal  30.92 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885893  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  23.71 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  22.62 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4403  basic membrane lipoprotein  27.59 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  23.51 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4191  basic membrane lipoprotein  26.33 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  25.23 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1352  basic membrane lipoprotein  22.7 
 
 
358 aa  67  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  24.77 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2784  basic membrane lipoprotein  32.86 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  24.39 
 
 
332 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  26.83 
 
 
328 aa  65.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  21.38 
 
 
713 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0476  basic membrane lipoprotein  23.28 
 
 
404 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000930051  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1848  ABC transporter periplasmic protein  27.27 
 
 
357 aa  64.3  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000897404  hitchhiker  0.00084927 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4008  basic membrane lipoprotein  25.8 
 
 
327 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2034  basic membrane lipoprotein  26.52 
 
 
403 aa  63.9  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0386  basic membrane protein C (bmpC)  24.2 
 
 
353 aa  63.9  0.000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1451  basic membrane lipoprotein  23.04 
 
 
337 aa  63.5  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2932  basic membrane lipoprotein  31.21 
 
 
327 aa  63.5  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3942  hypothetical protein  25.3 
 
 
364 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0853  basic membrane lipoprotein  26.16 
 
 
372 aa  62.8  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.674254  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2177  lipoprotein  25.11 
 
 
380 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186989  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4195  basic membrane lipoprotein  24.14 
 
 
332 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  24.14 
 
 
330 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1606  ABC transporter periplasmic protein  27.94 
 
 
361 aa  62  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1135  basic membrane lipoprotein  26.09 
 
 
388 aa  62  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.293026 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  22.8 
 
 
355 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2379  basic membrane lipoprotein  25.97 
 
 
385 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185576  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  24.14 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.954654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>