188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1649 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1649  hydrogenase expression/synthesis, HypA  100 
 
 
136 aa  275  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  50 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2181  hydrogenase nickel insertion protein HypA  38.05 
 
 
113 aa  91.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19820  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  38.33 
 
 
125 aa  83.6  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2830  hydrogenase nickel insertion protein HypA  39.5 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0449  hydrogenase expression/synthesis HypA  35.04 
 
 
117 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0757  hydrogenase expression/synthesis HypA  30.77 
 
 
117 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.497459  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1199  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.48 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.78169  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0070  hydrogenase nickel insertion protein HypA  37.84 
 
 
124 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1850  hydrogenase nickel incorporation protein  35.07 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0816478  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0963  hydrogenase nickel insertion protein HypA  39.29 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.225811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.51 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_002936  DET1430  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.95 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.799763  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4095  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.23 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1889  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.51 
 
 
113 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11730  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  34.71 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1212  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.07 
 
 
119 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0774927  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1424  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.97 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1238  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.7 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1092  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.58 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1937  hydrogenase expression/synthesis, HypA  36.61 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2418  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.45 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103783  normal  0.115418 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3365  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.63 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1168  hydrogenase expression/synthesis, HypA  35.4 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.317473  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1535  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.23 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000589093  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2489  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.63 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1904  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.5 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0320929  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0967  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.65 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.571187  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1498  hydrogenase expression/synthesis HypA  32.48 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.130745  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2019  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.28 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0929  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.91 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11958  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1088  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.46 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.909847  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2444  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.52 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205339 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0047  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.63 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.729496  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1517  hydrogenase nickel insertion protein HypA  37.17 
 
 
115 aa  63.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0160728  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3166  hydrogenase expression/synthesis HypA  32.46 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0373089 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3810  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.78 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3979  hydrogenase expression/synthesis, HypA  35.14 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0928  hydrogenase expression/synthesis, HypA  33.93 
 
 
128 aa  63.5  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1879  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.93 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0865  hydrogenase expression/synthesis HypA  35.45 
 
 
109 aa  62.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.71265  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2553  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.33 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.064786  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0533  putative hydrogenase expression/synthesis protein HypA  33.7 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2113  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.97 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00315228  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2415  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.93 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0774419  hitchhiker  0.0000872958 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0024  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.46 
 
 
123 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1911  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.5 
 
 
117 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0043415  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0717  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.45 
 
 
109 aa  62.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3921  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.51 
 
 
113 aa  62  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0176  putative hydrogenase nickel incorporation protein hypA  33.63 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1094  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.93 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2089  hydrogenase expression/formation protein HypA  27.35 
 
 
118 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1286  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.78 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812906  normal  0.435209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0925  hydrogenase expression/synthesis, HypA  33.04 
 
 
114 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000996946 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3880  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.51 
 
 
113 aa  62  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.451178  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1303  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.17 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.263812  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1898  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.1 
 
 
115 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030561 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4579  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.84 
 
 
117 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1669  hydrogenase expression/formation protein HypA  29.91 
 
 
121 aa  60.8  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3188  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.23 
 
 
128 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.584695 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3156  hydrogenase expression/synthesis, HypA  38.05 
 
 
110 aa  60.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1308  hydrogenase nickel insertion protein HypA, putative  33.61 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000254152  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1645  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.11 
 
 
113 aa  60.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.428632  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3287  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.53 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0930  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.77 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.359542 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1373  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.43 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.673816  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1832  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.03 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.524005  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2885  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.53 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.305535  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1787  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.62 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000697266  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1312  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.06 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.183379  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0650  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.3 
 
 
126 aa  58.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.235635  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2782  hydrogenase nickel insertion protein HypA  38.26 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1665  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.63 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.559753  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2039  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.7 
 
 
114 aa  57.4  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2133  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.73 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697456 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2192  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.73 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3018  hydrogenase expression/synthesis, HypA  32.14 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2023  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.83 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4607  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.2 
 
 
113 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1165  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.86 
 
 
113 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0374  hydrogenase expression/formation protein hupa  36.28 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2745  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.71 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1565  hydrogenase expression/synthesis HypA  30.56 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2146  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.02 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0798  hydrogenase expression/synthesis, HypA  32.46 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.941377  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1736  hydrogenase expression/synthesis HypA  30.84 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.407443  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3199  hydrogenase nickel incorporation protein  33.91 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1811  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.58 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0595  hydrogenase expression/synthesis, HypA  36.36 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1273  hydrogenase expression/synthesis HypA  31.52 
 
 
121 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.330096  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2132  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.2 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.509828  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1942  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.28 
 
 
110 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384246  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2053  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.56 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2547  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.33 
 
 
117 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101979  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3140  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.43 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0468  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.51 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.984402  normal  0.0359796 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2182  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.93 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140816  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1459  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.91 
 
 
117 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0476  hydrogenase formation/expression  31.25 
 
 
112 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.653213  normal  0.217154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5246  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.2 
 
 
122 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.911975 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>