159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_11730 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_11730  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  100 
 
 
121 aa  249  1e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2830  hydrogenase nickel insertion protein HypA  69.42 
 
 
123 aa  170  5.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19820  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  58.97 
 
 
125 aa  148  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1212  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.33 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0774927  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1430  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.33 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.799763  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1238  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.33 
 
 
119 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3156  hydrogenase expression/synthesis, HypA  32.46 
 
 
110 aa  77  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1942  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.58 
 
 
110 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384246  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1459  hydrogenase expression/synthesis, HypA  31.58 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.04 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1649  hydrogenase expression/synthesis, HypA  34.71 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2782  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.74 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1766  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.65 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.506604  normal  0.950771 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1303  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.6 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.263812  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3749  hydrogenase expression/synthesis HypA  31.58 
 
 
112 aa  67  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2547  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.57 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101979  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1645  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.07 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.428632  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3140  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.95 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.58 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0374  hydrogenase expression/formation protein hupa  27.19 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0536  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.32 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3220  hydrogenase expression/synthesis HypA  31.86 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3365  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.19 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3905  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.19 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3287  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.95 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2885  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.95 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.305535  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0757  hydrogenase expression/synthesis HypA  30.51 
 
 
117 aa  61.6  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.497459  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0650  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.2 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.235635  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0934  hydrogenase expression/synthesis, HypA  31.58 
 
 
111 aa  61.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722014  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1517  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.43 
 
 
115 aa  60.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0160728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1168  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.07 
 
 
113 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.317473  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0047  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.07 
 
 
114 aa  60.8  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.729496  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2418  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.28 
 
 
136 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103783  normal  0.115418 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1373  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.6 
 
 
126 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.673816  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3188  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.62 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.584695 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1122  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.95 
 
 
110 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2181  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.57 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0476  hydrogenase formation/expression  29.82 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.653213  normal  0.217154 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1736  hydrogenase expression/synthesis HypA  27.43 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.407443  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1736  hydrogenase expression/synthesis HypA  26.09 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115348  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0070  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.36 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0437  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.95 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.525876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0426  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.95 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1023  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.57 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136662  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0176  putative hydrogenase nickel incorporation protein hypA  28.21 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4607  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.7 
 
 
113 aa  58.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0928  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.57 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2019  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.95 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0024  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.91 
 
 
123 aa  58.2  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1565  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.73 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0930  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.66 
 
 
139 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.359542 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0720  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.07 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.973117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3461  hydrogenase expression/synthesis HypA  25.44 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000576612  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1412  hydrogenase expression/synthesis, HypA  27.12 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0480002  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2192  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.28 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2133  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.28 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697456 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2146  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.28 
 
 
109 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08020  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.4 
 
 
117 aa  57  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2166  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.73 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.591448  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1850  hydrogenase nickel incorporation protein  30.53 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0816478  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03870  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.94 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2053  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.44 
 
 
117 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1787  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.07 
 
 
116 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000697266  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0449  hydrogenase expression/synthesis HypA  25.42 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3979  hydrogenase expression/synthesis, HypA  24.56 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4095  hydrogenase nickel insertion protein HypA  23.68 
 
 
113 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2132  hydrogenase expression/synthesis HypA  25.44 
 
 
113 aa  55.1  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.509828  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2489  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.64 
 
 
130 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1937  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.17 
 
 
136 aa  53.9  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0963  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.66 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.225811 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0798  hydrogenase expression/synthesis, HypA  26.32 
 
 
114 aa  53.5  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.941377  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3977  hydrogenase expression/synthesis, HypA  34.21 
 
 
109 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1669  hydrogenase expression/formation protein HypA  25.83 
 
 
121 aa  53.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3166  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.7 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0373089 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1535  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.78 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000589093  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0595  hydrogenase expression/synthesis, HypA  36.59 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1312  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.4 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.183379  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3880  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.19 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.451178  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1811  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.19 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2553  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.43 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.064786  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0365  hypothetical protein  26.32 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2006  hydrogenase expression/formation  25.23 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321644  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3018  hydrogenase expression/synthesis, HypA  26.55 
 
 
112 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1088  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.07 
 
 
113 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.909847  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3921  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.56 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1601  hydrogenase expression/formation protein HypA  28.32 
 
 
117 aa  50.4  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0929  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.95 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11958  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3762  hydrogenase nickel insertion protein HypA  22.81 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1173  hydrogenase nickel insertion protein HypA  22.81 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.305446  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17140  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  26.5 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0851583  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2528  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.44 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3810  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.83 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1416  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.97 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3397  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  25.44 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3317  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  25.44 
 
 
113 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000010148  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3492  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  25.44 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.919493  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3391  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  25.44 
 
 
113 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.440327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3821  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.32 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631833  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4512  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.3 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3326  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  25.44 
 
 
113 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651376  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>