57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1023 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1023  hydrogenase expression/synthesis, HypA  100 
 
 		 113 aa  231  3e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136662  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1412  hydrogenase expression/synthesis, HypA  66.07 
 
 		 114 aa  160  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0480002  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1736  hydrogenase expression/synthesis HypA  67.26 
 
 		 114 aa  157  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0934  hydrogenase expression/synthesis, HypA  58.56 
 
 		 111 aa  146  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0365  hypothetical protein  58.04 
 
 		 114 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1850  hydrogenase nickel incorporation protein  32.33 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0816478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19820  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  30.77 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.36 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11730  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  29.57 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0929  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.25 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11958  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2489  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.07 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1459  hydrogenase expression/synthesis, HypA  34.75 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2547  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.59 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101979  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2334  hydrogenase expression/synthesis HypA  25.21 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1517  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.75 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0160728  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1094  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.95 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3749  hydrogenase expression/synthesis HypA  32.74 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3880  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.86 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.451178  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1556  hydrogenase expression/formation protein HypA  32.26 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.268583  normal  0.0306353 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0679  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.85 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0176  putative hydrogenase nickel incorporation protein hypA  29.06 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2181  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.98 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3156  hydrogenase expression/synthesis, HypA  31.58 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1303  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.78 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.263812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.04 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3366  hypothetical protein  27.59 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.8287  normal  0.256486 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3188  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.33 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.584695 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0024  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.54 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3287  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.07 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0449  hydrogenase expression/synthesis HypA  30 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2885  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.07 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.305535  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0757  hydrogenase expression/synthesis HypA  27.12 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.497459  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1787  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.7 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000697266  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1766  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.58 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.506604  normal  0.950771 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1889  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.03 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2053  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.81 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2830  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.83 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1535  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.43 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000589093  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1092  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2592  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.82 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1088  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.7 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.909847  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1811  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.19 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1498  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.57 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.130745  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0930  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.08 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.359542 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3461  hydrogenase expression/synthesis HypA  30.77 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000576612  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1312  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.4 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.183379  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1937  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.45 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1736  hydrogenase expression/synthesis HypA  31.58 
 
 		 112 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.407443  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0468  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.97 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.984402  normal  0.0359796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4095  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.19 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0650  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.57 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.235635  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1898  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.83 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0476  hydrogenase formation/expression  28.32 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.653213  normal  0.217154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1665  hydrogenase expression/synthesis, HypA  25.66 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.559753  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1645  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.15 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.428632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1373  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.98 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.673816  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1199  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.56 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.78169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>