145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0679 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0679  hydrogenase expression/synthesis HypA  100 
 
 
135 aa  273  7e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0074  hydrogenase nickel incorporation protein  40.46 
 
 
132 aa  121  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1272  hydrogenase expression/synthesis HypA  39.39 
 
 
134 aa  106  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00563885  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0595  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.46 
 
 
146 aa  84  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0412  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.03 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.65842  normal  0.014846 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0192  hydrogenase expression/synthesis, HypA  27.42 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.342154 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0913  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.65 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.533701  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1306  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.03 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.551404  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1212  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.11 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0774927  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1430  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.11 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.799763  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1238  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.89 
 
 
119 aa  66.6  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2181  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.81 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1424  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.36 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0929  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.1 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11958  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1569  hypothetical protein  29.03 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3365  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.87 
 
 
113 aa  60.8  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0720  hydrogenase expression/synthesis, HypA  27.41 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.973117  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1199  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.93 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.78169  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4095  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.37 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2553  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.56 
 
 
112 aa  55.1  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.064786  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1889  hydrogenase nickel insertion protein HypA  23.66 
 
 
113 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1092  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.78 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2053  hydrogenase nickel insertion protein HypA  21.48 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0047  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.2 
 
 
114 aa  54.7  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.729496  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3979  hydrogenase expression/synthesis, HypA  24.63 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2019  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.37 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1850  hydrogenase nickel incorporation protein  27.21 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0816478  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3762  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.12 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0913  hydrogenase expression/synthesis, HypA  25.93 
 
 
114 aa  53.5  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0331  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.95 
 
 
113 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0315757  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0757  hydrogenase expression/synthesis HypA  24.24 
 
 
117 aa  51.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.497459  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0787  hydrogenase expression/formation protein HypA  23.53 
 
 
121 aa  52  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.482167  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1766  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.12 
 
 
113 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.506604  normal  0.950771 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7256  hydrogenase expression/synthesis HypA  23.88 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492993  normal  0.319933 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2132  hydrogenase expression/synthesis HypA  25.19 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.509828  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3018  hydrogenase expression/synthesis, HypA  22.9 
 
 
112 aa  50.4  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1308  hydrogenase nickel insertion protein HypA, putative  26.32 
 
 
138 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000254152  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3287  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.87 
 
 
113 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2885  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.87 
 
 
113 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.305535  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3461  hydrogenase expression/synthesis HypA  25.93 
 
 
111 aa  50.1  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000576612  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0536  hydrogenase expression/synthesis, HypA  26.02 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2165  hydrogenase nickel insertion protein HypA  22.96 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0939102  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0437  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.93 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.525876 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2418  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.12 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103783  normal  0.115418 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1094  hydrogenase nickel insertion protein HypA  23.13 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0426  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.93 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2089  hydrogenase expression/formation protein HypA  21.48 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1459  hydrogenase expression/synthesis, HypA  22.96 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1812  hydrogenase nickel insertion protein HypA  22.96 
 
 
118 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  20.61 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1867  hydrogenase nickel insertion protein HypA  22.22 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0963  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.44 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.225811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2816  HypA protein  25.19 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1811  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.19 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2334  hydrogenase expression/synthesis HypA  25.74 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0500  hydrogenase expression/synthesis HypA  27.63 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1535  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.2 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000589093  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1023  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.85 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136662  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2830  hydrogenase nickel insertion protein HypA  21.64 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1168  hydrogenase expression/synthesis, HypA  24.63 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.317473  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1159  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.43 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2976  hydrogenase nickel incorporation protein  25.19 
 
 
118 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3059  hydrogenase nickel incorporation protein  25.19 
 
 
118 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606667  normal  0.0829124 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3043  hydrogenase nickel incorporation protein  25.19 
 
 
118 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478304 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3164  hydrogenase nickel incorporation protein  25.19 
 
 
118 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.355005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3007  hydrogenase nickel incorporation protein  25.19 
 
 
118 aa  48.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343326  normal  0.0101686 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0928  hydrogenase expression/synthesis, HypA  20.31 
 
 
128 aa  47.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0472  hydrogenase expression/synthesis, HypA  26.32 
 
 
114 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1937  hydrogenase expression/synthesis, HypA  26.02 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2182  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.09 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140816  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1832  hydrogenase nickel insertion protein HypA  21.48 
 
 
115 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.524005  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0505  hydrogenase expression/synthesis HypA  26.32 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0514  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.95 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0729285 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0505  hydrogenase expression/synthesis, HypA family  23.88 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3156  hydrogenase expression/synthesis, HypA  23.7 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0934  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.89 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722014  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0533  putative hydrogenase expression/synthesis protein HypA  22.56 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0798  hydrogenase expression/synthesis, HypA  24.44 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.941377  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3188  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.87 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.584695 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2156  hydrogenase nickel insertion protein HypA  23.88 
 
 
113 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.462739  normal  0.111432 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1942  hydrogenase nickel insertion protein HypA  22.39 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384246  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1904  hydrogenase nickel insertion protein HypA  21.48 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0320929  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2435  hydrogenase nickel incorporation protein  27.61 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.931347  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1787  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.19 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000697266  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02576  HypA  22.96 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0963  hydrogenase nickel insertion protein HypA  22.96 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02541  hypothetical protein  22.96 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3199  hydrogenase nickel incorporation protein  22.96 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2863  hydrogenase nickel incorporation protein  22.96 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3014  hydrogenase nickel incorporation protein  22.96 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1565  hydrogenase expression/synthesis HypA  24.24 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0986  hydrogenase nickel incorporation protein  22.96 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.209126 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3978  hydrogenase nickel incorporation protein  22.96 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2851  hydrogenase nickel incorporation protein  22.96 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.440089 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1645  hydrogenase nickel insertion protein HypA  21.64 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.428632  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1416  hydrogenase nickel insertion protein HypA  22.76 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3140  hydrogenase nickel insertion protein HypA  22.96 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0374  hydrogenase expression/formation protein hupa  24.44 
 
 
110 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2006  hydrogenase expression/formation  23.85 
 
 
110 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321644  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>