111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0514 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0514  hydrogenase expression/synthesis HypA  100 
 
 
114 aa  232  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0729285 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0500  hydrogenase expression/synthesis HypA  74.56 
 
 
114 aa  183  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0505  hydrogenase expression/synthesis HypA  73.68 
 
 
114 aa  183  7e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0472  hydrogenase expression/synthesis, HypA  73.68 
 
 
114 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0047  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.4 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.729496  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1812  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.52 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1867  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.52 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1424  hydrogenase expression/synthesis, HypA  35.96 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2089  hydrogenase expression/formation protein HypA  35.09 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2165  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.65 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0939102  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1889  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.34 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1832  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.78 
 
 
115 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.524005  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1898  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.48 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030561 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1911  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.21 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0043415  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1199  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.91 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.78169  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1879  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.33 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1092  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.26 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2415  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.33 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0774419  hitchhiker  0.0000872958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1904  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.46 
 
 
117 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0320929  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2039  hydrogenase nickel insertion protein HypA  38.05 
 
 
114 aa  70.1  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1669  hydrogenase expression/formation protein HypA  36.11 
 
 
121 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0730  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.38 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.525466  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0656  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.38 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1042  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.38 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2023  hydrogenase expression/synthesis HypA  35.78 
 
 
115 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1094  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30 
 
 
113 aa  67.4  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2113  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.46 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00315228  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1601  hydrogenase expression/formation protein HypA  37.5 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1088  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.36 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.909847  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0929  hydrogenase expression/synthesis, HypA  34.21 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11958  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2489  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.62 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0787  hydrogenase expression/formation protein HypA  32.38 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.482167  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1665  hydrogenase expression/synthesis, HypA  32.14 
 
 
115 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.559753  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3018  hydrogenase expression/synthesis, HypA  25.89 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1755  hydrogenase expression/synthesis, HypA  32.98 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0963  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.23 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.225811 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0913  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.46 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0374  hydrogenase expression/formation protein hupa  35.4 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2166  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.17 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.591448  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1273  hydrogenase expression/synthesis HypA  33.77 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.330096  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0176  putative hydrogenase nickel incorporation protein hypA  37.29 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3140  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.86 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2885  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.66 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.305535  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3287  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.66 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2830  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.83 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1122  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.86 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3979  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.2 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4512  hydrogenase nickel insertion protein HypA  37.5 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3365  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.55 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3156  hydrogenase expression/synthesis, HypA  31.86 
 
 
110 aa  51.6  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2745  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.33 
 
 
113 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1382  hydrogenase expression/formation protein HypA  40.79 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00630275  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1238  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.55 
 
 
119 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1736  hydrogenase expression/synthesis HypA  25 
 
 
112 aa  51.2  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.407443  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0533  putative hydrogenase expression/synthesis protein HypA  32.5 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1173  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.95 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.305446  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0074  hydrogenase nickel incorporation protein  32.89 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0070  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.03 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4944  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.12 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000180584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1850  hydrogenase nickel incorporation protein  24.81 
 
 
133 aa  47.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0816478  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2553  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.36 
 
 
112 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.064786  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.42 
 
 
121 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3905  hydrogenase expression/synthesis, HypA  27.84 
 
 
113 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3762  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.43 
 
 
113 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4579  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.95 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0925  hydrogenase expression/synthesis, HypA  27.43 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000996946 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1649  hydrogenase expression/synthesis, HypA  27.03 
 
 
136 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1165  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.98 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0679  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.95 
 
 
135 aa  46.2  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1430  hydrogenase nickel insertion protein HypA  23.89 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.799763  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1459  hydrogenase expression/synthesis, HypA  26.09 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4095  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.78 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1535  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.66 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000589093  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1212  hydrogenase nickel insertion protein HypA  23.89 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0774927  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3188  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.19 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.584695 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1787  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.26 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000697266  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1645  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.91 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.428632  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0468  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.35 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.984402  normal  0.0359796 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2132  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.87 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.509828  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1498  hydrogenase expression/synthesis HypA  27.37 
 
 
117 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.130745  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1168  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.7 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.317473  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0934  hydrogenase expression/synthesis, HypA  27.62 
 
 
111 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722014  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3366  hypothetical protein  24.78 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.8287  normal  0.256486 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0024  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.21 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4500  hydrogenase expression/synthesis, HypA  24.77 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2182  hydrogenase nickel insertion protein HypA  21.43 
 
 
113 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140816  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2019  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.43 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1286  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.91 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812906  normal  0.435209 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1942  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.33 
 
 
110 aa  42.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384246  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1416  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.83 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7256  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.26 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492993  normal  0.319933 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0928  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.42 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0720  hydrogenase expression/synthesis, HypA  31.18 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.973117  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0595  hydrogenase expression/synthesis, HypA  27.63 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3749  hydrogenase expression/synthesis HypA  31.58 
 
 
112 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0798  hydrogenase expression/synthesis, HypA  25 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.941377  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2541  hydrogenase nickel incorporation protein HypA  24.14 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2396  hydrogenase nickel incorporation protein HypA  24.14 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2547  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.46 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101979  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.13 
 
 
135 aa  40.4  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>