77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0074 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0074  hydrogenase nickel incorporation protein  100 
 
 		 132 aa  272  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0679  hydrogenase expression/synthesis HypA  40.46 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1272  hydrogenase expression/synthesis HypA  38.64 
 
 		 134 aa  100  8e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00563885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0595  hydrogenase expression/synthesis, HypA  34.38 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0913  hydrogenase expression/synthesis, HypA  31.15 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.533701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0192  hydrogenase expression/synthesis, HypA  31.2 
 
 		 136 aa  70.1  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.342154 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0412  hydrogenase expression/synthesis HypA  30.4 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.65842  normal  0.014846 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1306  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.65 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.551404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4512  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.84 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1565  hydrogenase expression/synthesis HypA  25.95 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1159  hydrogenase nickel insertion protein HypA  21.21 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3821  hydrogenase expression/synthesis, HypA  20.45 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631833  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1424  hydrogenase expression/synthesis, HypA  23.44 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1569  hypothetical protein  27.87 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2166  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.43 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.591448  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17140  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  31.58 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0851583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2547  hydrogenase nickel insertion protein HypA  22.73 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101979  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2553  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.33 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.064786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3979  hydrogenase expression/synthesis, HypA  21.97 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1273  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.95 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.330096  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1168  hydrogenase expression/synthesis, HypA  25.64 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.317473  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2745  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.74 
 
 		 113 aa  50.1  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0024  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.22 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2181  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.81 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0514  hydrogenase expression/synthesis HypA  32.89 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0729285 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2830  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.24 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2396  hydrogenase nickel incorporation protein HypA  27.85 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2541  hydrogenase nickel incorporation protein HypA  27.85 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1535  hydrogenase nickel insertion protein HypA  21.48 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000589093  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1312  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.03 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.183379  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2444  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.63 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205339 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0505  hydrogenase expression/synthesis HypA  27.63 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1964  hydrogenase expression/synthesis, HypA  25 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0963  hydrogenase nickel insertion protein HypA  19.7 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.225811 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0757  hydrogenase expression/synthesis HypA  24.06 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.497459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1088  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.07 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.909847  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0500  hydrogenase expression/synthesis HypA  27.63 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3188  hydrogenase nickel insertion protein HypA  23 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.584695 
 
 
-
 
NC_002936  DET1430  hydrogenase nickel insertion protein HypA  23.48 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.799763  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0720  hydrogenase expression/synthesis, HypA  22.9 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.973117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2418  hydrogenase nickel insertion protein HypA  22.73 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103783  normal  0.115418 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0650  hydrogenase nickel insertion protein HypA  22.48 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.235635  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1212  hydrogenase nickel insertion protein HypA  23.48 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0774927  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1373  hydrogenase nickel insertion protein HypA  21.71 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.673816  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3287  hydrogenase nickel insertion protein HypA  19.7 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4095  hydrogenase nickel insertion protein HypA  16.67 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0472  hydrogenase expression/synthesis, HypA  27.63 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2885  hydrogenase nickel insertion protein HypA  19.7 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.305535  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3921  hydrogenase nickel insertion protein HypA  22.58 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1665  hydrogenase expression/synthesis, HypA  25.97 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.559753  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1649  hydrogenase expression/synthesis, HypA  24.81 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3140  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.44 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0930  hydrogenase expression/synthesis, HypA  22.56 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.359542 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3365  hydrogenase nickel insertion protein HypA  21.97 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1645  hydrogenase nickel insertion protein HypA  22.14 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.428632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3977  hydrogenase expression/synthesis, HypA  20.31 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1669  hydrogenase expression/formation protein HypA  23.48 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2816  HypA protein  25 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2019  hydrogenase nickel insertion protein HypA  18.18 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1787  hydrogenase nickel insertion protein HypA  21.97 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000697266  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4579  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.97 
 
 		 117 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0967  hydrogenase nickel insertion protein HypA  22.58 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.571187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1238  hydrogenase nickel insertion protein HypA  22.73 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1303  hydrogenase nickel insertion protein HypA  20.93 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.263812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3166  hydrogenase expression/synthesis HypA  22.48 
 
 		 114 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0373089 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1889  hydrogenase nickel insertion protein HypA  22.66 
 
 		 113 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1805  hydrogenase nickel insertion protein HypA  19.7 
 
 		 113 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0274215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1640  hydrogenase nickel insertion protein HypA  19.7 
 
 		 113 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00692895  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1635  hydrogenase nickel insertion protein HypA  19.7 
 
 		 113 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1092  hydrogenase nickel insertion protein HypA  23.44 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1702  hydrogenase nickel insertion protein HypA  19.7 
 
 		 113 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.414279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1931  hydrogenase nickel incorporation protein  22.14 
 
 		 113 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1643  hydrogenase nickel insertion protein HypA  19.7 
 
 		 113 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0536  hydrogenase expression/synthesis, HypA  24.39 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3762  hydrogenase nickel insertion protein HypA  21.05 
 
 		 113 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0468  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.32 
 
 		 114 aa  40  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.984402  normal  0.0359796 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08020  hydrogenase nickel insertion protein HypA  16.67 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>