188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2547 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2547  hydrogenase nickel insertion protein HypA  100 
 
 
117 aa  227  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101979  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1942  hydrogenase nickel insertion protein HypA  47.27 
 
 
110 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384246  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3220  hydrogenase expression/synthesis HypA  42.2 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3977  hydrogenase expression/synthesis, HypA  41.28 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3156  hydrogenase expression/synthesis, HypA  42.73 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3140  hydrogenase nickel insertion protein HypA  40.91 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1122  hydrogenase nickel insertion protein HypA  40.91 
 
 
110 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1517  hydrogenase nickel insertion protein HypA  41.23 
 
 
115 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0160728  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3749  hydrogenase expression/synthesis HypA  40 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2418  hydrogenase nickel insertion protein HypA  39.45 
 
 
136 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103783  normal  0.115418 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2830  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.09 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2782  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.7 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1430  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.77 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.799763  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2146  hydrogenase nickel insertion protein HypA  38.53 
 
 
109 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2192  hydrogenase nickel insertion protein HypA  38.53 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2133  hydrogenase nickel insertion protein HypA  38.53 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697456 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3018  hydrogenase expression/synthesis, HypA  33.04 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1212  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.93 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0774927  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0474  hydrogenase nickel insertion protein HypA  37.27 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.635429  normal  0.537416 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1094  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.4 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1238  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.77 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1937  hydrogenase expression/synthesis, HypA  41.44 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0437  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.64 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.525876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0426  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.64 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3821  hydrogenase expression/synthesis, HypA  34.86 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.631833  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0650  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.235635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0476  hydrogenase formation/expression  35.45 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.653213  normal  0.217154 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1787  hydrogenase nickel insertion protein HypA  38.94 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000697266  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1459  hydrogenase expression/synthesis, HypA  33.33 
 
 
117 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  39.64 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0928  hydrogenase expression/synthesis, HypA  35.14 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3461  hydrogenase expression/synthesis HypA  33.64 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000576612  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1811  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.82 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0967  hydrogenase nickel insertion protein HypA  40.35 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.571187  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0374  hydrogenase expression/formation protein hupa  37.27 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2053  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.04 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19820  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  33.05 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08020  hydrogenase nickel insertion protein HypA  40.37 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0070  hydrogenase nickel insertion protein HypA  37.84 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1373  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.8 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.673816  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1303  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.2 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.263812  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3880  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.17 
 
 
113 aa  67  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.451178  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.9 
 
 
121 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0798  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.18 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.941377  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1168  hydrogenase expression/synthesis, HypA  34.51 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.317473  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1645  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.28 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.428632  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11730  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  29.57 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1736  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.46 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.407443  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4607  hydrogenase expression/synthesis, HypA  31.82 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4095  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.74 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1088  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.86 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.909847  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1078  putative hydrogenase nickel incorporation protein  31.69 
 
 
171 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0654843  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3365  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.58 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2745  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.63 
 
 
113 aa  63.5  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0468  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.61 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.984402  normal  0.0359796 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3810  hydrogenase nickel insertion protein HypA  37.72 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0865  hydrogenase expression/synthesis HypA  33.64 
 
 
109 aa  62  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.71265  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1601  hydrogenase expression/formation protein HypA  35.71 
 
 
117 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0536  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.36 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2181  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.73 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2358  hydrogenase expression/synthesis, HypA  41.53 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.859502  normal  0.0379693 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0717  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.64 
 
 
109 aa  62  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1312  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.64 
 
 
124 aa  62  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.183379  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2483  hydrogenase expression/synthesis HypA  36.94 
 
 
110 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1424  hydrogenase expression/synthesis, HypA  27.43 
 
 
113 aa  60.5  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1766  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.63 
 
 
113 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.506604  normal  0.950771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0930  hydrogenase expression/synthesis, HypA  39.5 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.359542 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0024  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.83 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2885  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.86 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.305535  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1850  hydrogenase nickel incorporation protein  32.59 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0816478  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2619  hydrogenase expression/synthesis HypA  37.61 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.227524 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1535  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.93 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000589093  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0925  hydrogenase expression/synthesis, HypA  35.71 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000996946 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1669  hydrogenase expression/formation protein HypA  32.14 
 
 
121 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3287  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.86 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0720  hydrogenase expression/synthesis, HypA  34.51 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.973117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4944  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.31 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000180584  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3366  hypothetical protein  30.97 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.8287  normal  0.256486 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0449  hydrogenase expression/synthesis HypA  36.44 
 
 
117 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2553  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.25 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.064786  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1199  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.43 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.78169  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2156  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.09 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.462739  normal  0.111432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0505  hydrogenase expression/synthesis, HypA family  33.33 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4500  hydrogenase expression/synthesis, HypA  34.55 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2489  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.91 
 
 
130 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0963  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.88 
 
 
120 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.225811 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0176  putative hydrogenase nickel incorporation protein hypA  36.84 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02576  HypA  30.17 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0986  hydrogenase nickel incorporation protein  30.17 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.209126 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2089  hydrogenase expression/formation protein HypA  29.2 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2528  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.04 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2132  hydrogenase expression/synthesis HypA  31.86 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.509828  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02541  hypothetical protein  30.17 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1213  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.2 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0988006 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1832  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.96 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.524005  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0047  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.07 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.729496  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1889  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.57 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2863  hydrogenase nickel incorporation protein  30.17 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3014  hydrogenase nickel incorporation protein  30.17 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3978  hydrogenase nickel incorporation protein  30.17 
 
 
120 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>