197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4512 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4512  hydrogenase nickel insertion protein HypA  100 
 
 
114 aa  222  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2553  hydrogenase nickel insertion protein HypA  42.48 
 
 
112 aa  95.9  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.064786  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3287  hydrogenase nickel insertion protein HypA  41.59 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2885  hydrogenase nickel insertion protein HypA  41.59 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.305535  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4095  hydrogenase nickel insertion protein HypA  40.71 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0468  hydrogenase nickel insertion protein HypA  42.86 
 
 
114 aa  77  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.984402  normal  0.0359796 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3979  hydrogenase expression/synthesis, HypA  38.94 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1165  hydrogenase nickel insertion protein HypA  38.6 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0074  hydrogenase nickel incorporation protein  29.84 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2830  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.09 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1424  hydrogenase expression/synthesis, HypA  32.74 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1173  hydrogenase nickel insertion protein HypA  38.05 
 
 
113 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.305446  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1535  hydrogenase nickel insertion protein HypA  38.6 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000589093  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08020  hydrogenase nickel insertion protein HypA  38.05 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1787  hydrogenase nickel insertion protein HypA  41.51 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000697266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0374  hydrogenase expression/formation protein hupa  38.05 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1645  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.11 
 
 
113 aa  70.5  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.428632  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0047  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.51 
 
 
114 aa  70.1  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.729496  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3905  hydrogenase expression/synthesis, HypA  35.85 
 
 
113 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3762  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.21 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1238  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.4 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0865  hydrogenase expression/synthesis HypA  35.09 
 
 
109 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.71265  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0717  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.09 
 
 
109 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1212  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.63 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0774927  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1286  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.84 
 
 
115 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812906  normal  0.435209 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2132  hydrogenase expression/synthesis HypA  38.39 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.509828  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2528  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.28 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1459  hydrogenase expression/synthesis, HypA  34.91 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3921  hydrogenase nickel insertion protein HypA  38.46 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1430  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.63 
 
 
119 aa  67  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.799763  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2396  hydrogenase nickel incorporation protein HypA  31.48 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3977  hydrogenase expression/synthesis, HypA  37.72 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2541  hydrogenase nickel incorporation protein HypA  31.48 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1517  hydrogenase nickel insertion protein HypA  37.39 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0160728  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1159  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.4 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0720  hydrogenase expression/synthesis, HypA  37.74 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.973117  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1498  hydrogenase expression/synthesis HypA  36.44 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.130745  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3880  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.4 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.451178  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1937  hydrogenase expression/synthesis, HypA  36.84 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2489  hydrogenase nickel insertion protein HypA  37.72 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1669  hydrogenase expression/formation protein HypA  34.21 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2053  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.91 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0331  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.09 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0315757  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2019  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.96 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3140  hydrogenase nickel insertion protein HypA  37.39 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1766  hydrogenase nickel insertion protein HypA  37.74 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.506604  normal  0.950771 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0536  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.97 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1416  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.95 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0925  hydrogenase expression/synthesis, HypA  38.26 
 
 
114 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000996946 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0929  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.2 
 
 
113 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11958  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3810  hydrogenase nickel insertion protein HypA  37.5 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4607  hydrogenase expression/synthesis, HypA  34.21 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0437  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.62 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.525876 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3156  hydrogenase expression/synthesis, HypA  33.63 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2181  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.91 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.36 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3365  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.58 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0426  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.62 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3461  hydrogenase expression/synthesis HypA  34.51 
 
 
111 aa  62  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000576612  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0656  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.36 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1898  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.2 
 
 
115 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030561 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1312  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.43 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.183379  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0024  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.7 
 
 
123 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11730  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  31.3 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0449  hydrogenase expression/synthesis HypA  33.04 
 
 
117 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19820  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  32.46 
 
 
125 aa  61.6  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1092  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.95 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2745  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.74 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0730  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.46 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.525466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1088  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.03 
 
 
113 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.909847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1122  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.52 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0967  hydrogenase nickel insertion protein HypA  38.39 
 
 
123 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.571187  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1094  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.04 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1889  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.2 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3749  hydrogenase expression/synthesis HypA  33.33 
 
 
112 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1601  hydrogenase expression/formation protein HypA  36.28 
 
 
117 aa  60.5  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0963  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.63 
 
 
120 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.225811 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0514  hydrogenase expression/synthesis HypA  37.5 
 
 
114 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0729285 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2166  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.19 
 
 
113 aa  60.1  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.591448  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1665  hydrogenase expression/synthesis, HypA  34.51 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.559753  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0474  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.4 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.635429  normal  0.537416 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3317  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  33.63 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000010148  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3391  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  33.63 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.440327 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3326  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  33.63 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651376  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2089  hydrogenase expression/formation protein HypA  29.2 
 
 
118 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2146  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.62 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2418  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.48 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103783  normal  0.115418 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0176  putative hydrogenase nickel incorporation protein hypA  35.09 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.13 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1273  hydrogenase expression/synthesis HypA  35.58 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.330096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2192  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.48 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0650  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.06 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.235635  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1042  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.46 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0798  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.97 
 
 
114 aa  57.8  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.941377  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2133  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.48 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697456 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1303  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.91 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.263812  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2039  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.96 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0472  hydrogenase expression/synthesis, HypA  33.33 
 
 
114 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1373  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.21 
 
 
126 aa  57  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.673816  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3166  hydrogenase expression/synthesis HypA  36.84 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0373089 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>