27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1272 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1272  hydrogenase expression/synthesis HypA  100 
 
 
134 aa  273  7e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00563885  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0679  hydrogenase expression/synthesis HypA  39.39 
 
 
135 aa  106  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0074  hydrogenase nickel incorporation protein  38.64 
 
 
132 aa  100  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0192  hydrogenase expression/synthesis, HypA  31.45 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.342154 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0595  hydrogenase expression/synthesis, HypA  24.49 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0412  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.03 
 
 
136 aa  62.8  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.65842  normal  0.014846 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1306  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.23 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.551404  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0047  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.01 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.729496  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1424  hydrogenase expression/synthesis, HypA  22.9 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0913  hydrogenase expression/synthesis, HypA  23.2 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.533701  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1569  hypothetical protein  25 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2166  hydrogenase nickel insertion protein HypA  23.85 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.591448  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2181  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.56 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0798  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.01 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.941377  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1736  hydrogenase expression/synthesis HypA  27.48 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.407443  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2782  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.82 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1565  hydrogenase expression/synthesis HypA  23.08 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2053  hydrogenase nickel insertion protein HypA  23.85 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1088  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.08 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.909847  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0536  hydrogenase expression/synthesis, HypA  25.95 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1889  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.43 
 
 
113 aa  41.6  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0757  hydrogenase expression/synthesis HypA  23.13 
 
 
117 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.497459  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2133  hydrogenase nickel insertion protein HypA  22.14 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697456 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2192  hydrogenase nickel insertion protein HypA  22.14 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1535  hydrogenase nickel insertion protein HypA  21.37 
 
 
113 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000589093  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2146  hydrogenase nickel insertion protein HypA  22.14 
 
 
109 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1212  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.06 
 
 
119 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0774927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>