156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1850 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1850  hydrogenase nickel incorporation protein  100 
 
 
133 aa  272  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0816478  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.56 
 
 
121 aa  77  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2334  hydrogenase expression/synthesis HypA  34.33 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0047  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.62 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.729496  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0365  hypothetical protein  32.31 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1023  hydrogenase expression/synthesis, HypA  32.33 
 
 
113 aa  73.6  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136662  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19820  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  34.81 
 
 
125 aa  72  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1649  hydrogenase expression/synthesis, HypA  35.07 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1412  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.55 
 
 
114 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0480002  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0934  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.53 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722014  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1736  hydrogenase expression/synthesis HypA  30 
 
 
114 aa  70.1  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115348  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2830  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.33 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3979  hydrogenase expression/synthesis, HypA  36.15 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0024  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.35 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2489  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.33 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0720  hydrogenase expression/synthesis, HypA  37.21 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.973117  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1312  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.06 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.183379  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1535  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.56 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000589093  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2053  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.84 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1459  hydrogenase expression/synthesis, HypA  32.09 
 
 
117 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1787  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.85 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000697266  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3188  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.09 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.584695 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1168  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.77 
 
 
113 aa  62  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.317473  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1766  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.62 
 
 
113 aa  62  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.506604  normal  0.950771 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1645  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.31 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.428632  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1430  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.85 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.799763  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1303  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.86 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.263812  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2547  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.59 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101979  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1308  hydrogenase nickel insertion protein HypA, putative  34.35 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000254152  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1212  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.61 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0774927  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4095  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1373  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.43 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.673816  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2745  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.46 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1238  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.36 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1165  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.46 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.54 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0963  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.01 
 
 
120 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.225811 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2553  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.46 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.064786  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1669  hydrogenase expression/formation protein HypA  26.12 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0650  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.43 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.235635  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2166  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.57 
 
 
113 aa  55.5  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.591448  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0449  hydrogenase expression/synthesis HypA  30.53 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11730  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  30.53 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1601  hydrogenase expression/formation protein HypA  29.46 
 
 
117 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2181  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.14 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0070  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.77 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1736  hydrogenase expression/synthesis HypA  31.3 
 
 
112 aa  54.7  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.407443  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1199  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.91 
 
 
115 aa  53.5  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.78169  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1213  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.77 
 
 
114 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0988006 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0536  hydrogenase expression/synthesis, HypA  33.33 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3018  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.69 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0679  hydrogenase expression/synthesis HypA  27.21 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1565  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.37 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1273  hydrogenase expression/synthesis HypA  31.19 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.330096  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0505  hydrogenase expression/synthesis, HypA family  29.23 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3156  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.46 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3762  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.91 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1173  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.91 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.305446  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3287  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.23 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2156  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.23 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.462739  normal  0.111432 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2885  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.23 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.305535  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0468  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.5 
 
 
114 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.984402  normal  0.0359796 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0176  putative hydrogenase nickel incorporation protein hypA  29.63 
 
 
145 aa  50.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1898  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.27 
 
 
115 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3921  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.68 
 
 
113 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02576  HypA  30.53 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0963  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.53 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3391  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  27.91 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.440327 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02541  hypothetical protein  30.53 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3317  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  27.91 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000010148  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3978  hydrogenase nickel incorporation protein  30.53 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3326  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  27.91 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651376  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3492  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  27.91 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.919493  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1889  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.14 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3397  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  27.91 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2863  hydrogenase nickel incorporation protein  30.53 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3014  hydrogenase nickel incorporation protein  30.53 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0986  hydrogenase nickel incorporation protein  30.53 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.209126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02867  HybF  27.91 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0928  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.77 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02816  hypothetical protein  27.91 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2006  hydrogenase expression/formation  28.1 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321644  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3220  hydrogenase expression/synthesis HypA  27.27 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3460  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  27.91 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2851  hydrogenase nickel incorporation protein  30.53 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.440089 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3277  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  27.91 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1094  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.72 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0705  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.91 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3880  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.71 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.451178  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2396  hydrogenase nickel incorporation protein HypA  29.46 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2418  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.38 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103783  normal  0.115418 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3171  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  27.91 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2528  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.88 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1517  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.03 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0160728  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0702  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  27.91 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3418  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  27.91 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0757  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.77 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.497459  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17140  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  26.67 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0851583  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4303  hydrogenase nickel incorporation protein HybF  27.91 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.236988  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0505  hydrogenase expression/synthesis HypA  24.81 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>