76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2334 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2334  hydrogenase expression/synthesis HypA  100 
 
 		 140 aa  281  3.0000000000000004e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1850  hydrogenase nickel incorporation protein  34.33 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0816478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1787  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.6 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000697266  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0934  hydrogenase expression/synthesis, HypA  32.77 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.06 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0047  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.51 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.729496  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1665  hydrogenase expression/synthesis, HypA  32.26 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.559753  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2053  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.08 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.46 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1669  hydrogenase expression/formation protein HypA  30.47 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1412  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0480002  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0757  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.95 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.497459  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1199  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.02 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.78169  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1023  hydrogenase expression/synthesis, HypA  25.21 
 
 		 113 aa  50.8  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136662  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19820  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  29.85 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1565  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.57 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1092  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.46 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1308  hydrogenase nickel insertion protein HypA, putative  32.08 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000254152  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0679  hydrogenase expression/synthesis HypA  25.74 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1766  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.61 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.506604  normal  0.950771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0963  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.64 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.225811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2418  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.36 
 
 		 136 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103783  normal  0.115418 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3188  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.32 
 
 		 128 aa  48.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.584695 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1736  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.1 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0930  hydrogenase expression/synthesis, HypA  31.68 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.359542 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0595  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.91 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1238  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.23 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0365  hypothetical protein  29.73 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0720  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.46 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.973117  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1645  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.58 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.428632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3977  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.66 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1424  hydrogenase expression/synthesis, HypA  27.87 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1601  hydrogenase expression/formation protein HypA  30.4 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2192  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.25 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3140  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.4 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11730  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  34.17 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0070  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.27 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1889  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.27 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0024  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.69 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1459  hydrogenase expression/synthesis, HypA  31.2 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2146  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.25 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2133  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.25 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697456 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1212  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.68 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0774927  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1303  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.01 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.263812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1649  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.36 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2830  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.54 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0536  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.93 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1430  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.68 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.799763  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0449  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.21 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1416  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.38 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3156  hydrogenase expression/synthesis, HypA  31.03 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2528  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.73 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1898  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.23 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030561 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1373  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.48 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.673816  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0476  hydrogenase formation/expression  33.33 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.653213  normal  0.217154 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2885  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.89 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.305535  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3921  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.09 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3287  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.89 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4579  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.62 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02576  HypA  26 
 
 		 116 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02541  hypothetical protein  26 
 
 		 116 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0963  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26 
 
 		 116 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0500  hydrogenase expression/synthesis HypA  31.86 
 
 		 114 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3978  hydrogenase nickel incorporation protein  26 
 
 		 120 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0986  hydrogenase nickel incorporation protein  26 
 
 		 116 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.209126 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3014  hydrogenase nickel incorporation protein  26 
 
 		 116 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2863  hydrogenase nickel incorporation protein  26 
 
 		 116 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2489  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.81 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2851  hydrogenase nickel incorporation protein  26 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.440089 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0472  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.97 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1122  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.75 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3199  hydrogenase nickel incorporation protein  26.73 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1094  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.83 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1937  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.46 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2039  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0925  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.27 
 
 		 114 aa  40  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000996946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>