35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0365 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0365  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  237  4e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1736  hydrogenase expression/synthesis HypA  57.89 
 
 		 114 aa  142  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1023  hydrogenase expression/synthesis, HypA  58.04 
 
 		 113 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136662  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1412  hydrogenase expression/synthesis, HypA  58.41 
 
 		 114 aa  137  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0480002  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0934  hydrogenase expression/synthesis, HypA  52.29 
 
 		 111 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1850  hydrogenase nickel incorporation protein  32.31 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0816478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19820  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  30.7 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.48 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1766  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.58 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.506604  normal  0.950771 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4095  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.21 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11730  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  26.32 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0929  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.07 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11958  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2334  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.73 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1173  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.32 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.305446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3749  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.2 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2489  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.19 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1094  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.07 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0047  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.7 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.729496  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3156  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.82 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3979  hydrogenase expression/synthesis, HypA  31.03 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3762  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.45 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1787  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.66 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000697266  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0787  hydrogenase expression/formation protein HypA  24.58 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.482167  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1649  hydrogenase expression/synthesis, HypA  27.59 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0024  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.37 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1165  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.86 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1498  hydrogenase expression/synthesis HypA  27.83 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.130745  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2089  hydrogenase expression/formation protein HypA  28.57 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1199  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.32 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.78169  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.09 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1238  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.95 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3882  hydrogenase expression/synthesis HypA  24.56 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1811  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.67 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1556  hydrogenase expression/formation protein HypA  25.81 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.268583  normal  0.0306353 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2132  hydrogenase expression/synthesis HypA  23.08 
 
 		 113 aa  40  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.509828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>