50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1556 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1556  hydrogenase expression/formation protein HypA  100 
 
 		 120 aa  243  8e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.268583  normal  0.0306353 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1092  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.7 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.08 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1889  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.46 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1665  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.7 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.559753  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2133  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.53 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697456 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1023  hydrogenase expression/synthesis, HypA  32.26 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136662  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2192  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.53 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2146  hydrogenase nickel insertion protein HypA  35.53 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3977  hydrogenase expression/synthesis, HypA  31.58 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3156  hydrogenase expression/synthesis, HypA  32.17 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2553  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.67 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.064786  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3220  hydrogenase expression/synthesis HypA  32.89 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0468  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.33 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.984402  normal  0.0359796 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0930  hydrogenase expression/synthesis, HypA  33.77 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.359542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0374  hydrogenase expression/formation protein hupa  31.58 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0533  putative hydrogenase expression/synthesis protein HypA  26.79 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0925  hydrogenase expression/synthesis, HypA  32.93 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000996946 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1649  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.16 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1498  hydrogenase expression/synthesis HypA  30.77 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.130745  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1168  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.7 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.317473  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1937  hydrogenase expression/synthesis, HypA  32.05 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1273  hydrogenase expression/synthesis HypA  33.33 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.330096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1601  hydrogenase expression/formation protein HypA  34.07 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1199  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.17 
 
 		 115 aa  43.5  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.78169  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0505  hydrogenase expression/synthesis HypA  30.1 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0913  hydrogenase expression/synthesis, HypA  23.68 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.57 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1459  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.72 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0047  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.95 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.729496  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2053  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.58 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0929  hydrogenase expression/synthesis, HypA  27.27 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11958  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1382  hydrogenase expression/formation protein HypA  33.33 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00630275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1669  hydrogenase expression/formation protein HypA  26.32 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0449  hydrogenase expression/synthesis HypA  30.12 
 
 		 117 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1238  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.56 
 
 		 119 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1424  hydrogenase expression/synthesis, HypA  24.35 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2166  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25 
 
 		 113 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.591448  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2019  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.87 
 
 		 113 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0500  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.13 
 
 		 114 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2528  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.35 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1430  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.97 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.799763  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3140  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.95 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1088  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.909847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1122  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.63 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1212  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.97 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0774927  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2483  hydrogenase expression/synthesis HypA  33.33 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0176  putative hydrogenase nickel incorporation protein hypA  35.9 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0365  hypothetical protein  25.81 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3366  hypothetical protein  28.95 
 
 		 113 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.8287  normal  0.256486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>