75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3882 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3882  hydrogenase expression/synthesis HypA  100 
 
 		 113 aa  235  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0176  putative hydrogenase nickel incorporation protein hypA  32.46 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0963  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.14 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.225811 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2132  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.45 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.509828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0925  hydrogenase expression/synthesis, HypA  26.96 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000996946 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.46 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3220  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.82 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2039  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.43 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1898  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.19 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030561 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3188  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.04 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.584695 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1094  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.07 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2023  hydrogenase expression/synthesis HypA  29.82 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1832  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.07 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.524005  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1165  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.7 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2113  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.95 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00315228  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0913  hydrogenase expression/synthesis, HypA  25.23 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1424  hydrogenase expression/synthesis, HypA  22.81 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1199  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.83 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.78169  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1273  hydrogenase expression/synthesis HypA  30.19 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.330096  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00349  hydrogenase expression/formation protein HypA  30.59 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0656  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.25 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0474  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.58 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.635429  normal  0.537416 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0730  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.25 
 
 		 114 aa  50.4  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.525466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1879  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.19 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1904  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.19 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0320929  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2089  hydrogenase expression/formation protein HypA  27.19 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1867  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.19 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.57 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2415  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.19 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0774419  hitchhiker  0.0000872958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2165  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.19 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0939102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1812  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.19 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1173  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.12 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.305446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1911  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.19 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0043415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2745  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.19 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1649  hydrogenase expression/synthesis, HypA  26.96 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2166  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.03 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.591448  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0476  hydrogenase formation/expression  26.55 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.653213  normal  0.217154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3762  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.82 
 
 		 113 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1937  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.46 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0787  hydrogenase expression/formation protein HypA  25.45 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.482167  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08020  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.27 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2019  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.46 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3156  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.09 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3287  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.25 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1889  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.55 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2489  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.07 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4607  hydrogenase expression/synthesis, HypA  24.78 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2885  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.25 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.305535  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19820  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  25 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2418  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.45 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103783  normal  0.115418 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0929  hydrogenase expression/synthesis, HypA  24.56 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11958  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1665  hydrogenase expression/synthesis, HypA  27.43 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.559753  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1498  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.45 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.130745  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1416  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.91 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1092  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.43 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.535933  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1168  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28.07 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.317473  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0468  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.43 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.984402  normal  0.0359796 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0717  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0865  hydrogenase expression/synthesis HypA  30 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.71265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0967  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.72 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.571187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1736  hydrogenase expression/synthesis HypA  26.32 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1755  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.03 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0449  hydrogenase expression/synthesis HypA  27.97 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2146  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.36 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2133  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.36 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697456 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3749  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.32 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0047  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.32 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.729496  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2192  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.36 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0374  hydrogenase expression/formation protein hupa  29.2 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50490  hydrogenase nickel incorporation protein HypA  26.13 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00363931  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3880  hydrogenase nickel insertion protein HypA  23.89 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.451178  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3979  hydrogenase expression/synthesis, HypA  25.44 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0365  hypothetical protein  24.56 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1565  hydrogenase expression/synthesis HypA  24.32 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1942  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.55 
 
 		 110 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>